Deux doctorats de 3 ans en microscopie diffractive tomographique à résolution isotrope : TDM 4Pi et TDM assisté par miroir – Marseille , France

PROFIL CHERCHEUR :  PhD / R1 : Chercheur premier cycle
DOMAINE(S) DE RECHERCHE ET DISCIPLINES1 : Physique / Optique

DESCRIPTION DU POSTE / DE L’OFFRE :  La microscopie diffractive tomographique (TDM) représente l’état de l’art de la microscopie optique non marquée, en termes de résolution et de mesure quantitative des propriétés optiques de l’échantillon. Cette technique est encore disponible dans le commerce, mais dans des versions simplifiées. L’Institut Fresnel et l’IRIMAS collaborent via une subvention ANR, en vue d’améliorer encore la technique . En particulier, l’importance de travailler avec des images à résolution isotrope est largement négligée [1]. Même des quantités simples telles que des volumes ne peuvent pas être mesurées avec précision à l’échelle micrométrique en microscopie à transmission uniquement, en raison du problème dit du «cône manquant» [2]. Par conséquent, l’indice de réfraction ou les concentrations d’espèces sont encore plus difficiles à mesurer avec précision [3-5].

Nous proposons 2 thèses de doctorat dans le cadre de la subvention conjointe IRIMAS-Fresnel ANR TARANIS (1 à IRIMAS et 1 à Fresnel) pour étudier le TDM à résolution isotrope . Plusieurs approches sont possibles : combiner les rotations d’échantillon et d’éclairage comme dans [1], utiliser une configuration 4Pi, comme proposé dans [2], ou utiliser une approche TDM assistée par miroir, comme démontré dans [4,5]. Les candidats sélectionnés rejoindront des groupes reconnus et actifs dans le domaine, et devront :

Étudier les principes sous-jacents du TDM (bibliographie), se familiariser avec le fonctionnement des systèmes IRIMAS et Fresnel actuels, ainsi qu’avec les différentes méthodes de reconstruction de données déjà mises en œuvre dans les laboratoires.

Participer à la construction de configurations TDM 4Pi / miroir assisté

Écrire des codes de reconstruction avancés, adaptés à ces configurations particulières

Des visites scientifiques régulières sont prévues pour les doctorants dans les deux instituts Fresnel et IRIMAS.

Simon, B., et al., Microscopie diffractive tomographique à résolution isotrope, Optica 4, 460 (2017)

Lauer, V., Nouvelle approche de la tomographie par diffraction optique produisant une équation vectorielle de la tomographie par diffraction et un nouveau microscope tomographique, Journal of Microscopy 205, 165 (2002)

Zhang, T., et al., Microscopie de diffraction en champ lointain à résolution λ/10, Optica 3, 609(2016)

Mudry, E., et al., Microscopie diffractive tomographique assistée par miroir avec résolution isotrope, Optics Letters 35, 1857 (2010)

Foucault, L., et al., Approche de microscopie diffractive tomographique à réflexion par transmission polyvalente, Journal of the Optical Society of America A 36, C18 (2019)

• Contact Fresnel : Guillaume Maire guillaume.maire@fresnel.fr, Institut Fresnel, Avenue Escadrille Normandie Niemen, 13397 Marseille Cedex 20, Tél : +33 (0)4 13 94 55 13
• Contact IRIMAS : Olivier Haeberlé/Nicolas Verrier olivier.haeberle@uha.fr nicolas.verrier@uha.fr, IRIMAS – Université de Haute-Alsace 61 rue Albert Camus, 68093 Mulhouse Cedex, Tél : +33 (0)3 89 33 76 11 / 76 66

CE QUE NOUS OFFRONS 
1720 € de salaire net par mois

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TYPE DE  CONTRAT :  TEMPORAIRE  / STATUT :  TEMPS PLEIN / HEURES PAR SEMAINE  :  35 (S): 

• Institut Fresnel, Campus Universitaire de Saint-Jérôme, 52 Av. Escadrille Normandie Niemen, 13013 Marseille, France pour la 1ère bourse doctorale
• IRIMAS, Mulhouse, France pour la deuxième bourse doctorale

QUALIFICATIONS, NIVEAU DE FORMATION REQUIS, COMPÉTENCES PROFESSIONNELLES, EXIGENCES DE RECHERCHE 
Master en Physique, solides compétences analytiques (Physique, Optique), optique expérimentale et compétences informatiques (Matlab, C/C++ et/ou Python)

SOFT SKILLS :  Autonomie, débrouillardise et créativité
DOCUMENTS DE CANDIDATURE DEMANDÉS, PROCESSUS DE SÉLECTION
CV, relevés de notes officiels du Master

OÙ POSTULER

• Contact Fresnel : Guillaume Maire guillaume.maire@fresnel.fr, Institut Fresnel, Avenue Escadrille Normandie Niemen, 13397 Marseille Cedex 20, Tél : +33 (0)4 13 94 55 13
• Contact IRIMAS : Olivier Haeberlé/Nicolas Verrier olivier.haeberle@uha.fr nicolas.verrier@uha.fr, IRIMAS – Université de Haute-Alsace 61 rue Albert Camus, 68093 Mulhouse Cedex, Tél : +33 (0)3 89 33 76 11 / 76 66