Assistant de recherche en bioinformatique et analyse métagénomique

Danemark
Publié il y a 4 mois

L’émergence et la propagation mondiales de la résistance aux antimicrobiens (RAM) comptent parmi les plus grands défis pour la santé humaine et animale.

Le Groupe de recherche sur l’épidémiologie génomique a pour tâche principale de mener des recherches ciblées dans le but de prédire et de prévenir les maladies infectieuses chez l’homme et l’animal, et de soutenir la détection, la surveillance et le contrôle mondiaux, avec un accent particulier sur la résistance aux antimicrobiens. Le groupe de recherche combine l’expertise en microbiologie conventionnelle et moléculaire avec l’épidémiologie et la bioinformatique et agit en tant que centre de référence de l’UE et de l’OMS pour la résistance aux antimicrobiens.

Le Groupe de recherche sur l’épidémiologie génomique collabore avec plusieurs partenaires du monde entier à l’établissement et à l’amélioration de la surveillance mondiale de la résistance aux antimicrobiens. Ceci est principalement basé sur des analyses métagénomiques des eaux usées, mais il est nécessaire de relier ces données aux données sur les gènes AMR d’isolats uniques et à l’analyse de la séquence du génome entier (WGS) provenant de sources cliniques et autres.

Le groupe a développé des outils de métagénomique et WGS en ligne pour l’analyse du génome bactérien, auxquels des utilisateurs du monde entier ont accédé. Le groupe a un accès complet à Computerome (Supercalculateur national danois pour les sciences de la vie). En outre, le groupe garantit la disponibilité de l’expertise intellectuelle et de la technologie pour exécuter le projet, y compris toutes les installations pour les expériences de biologie moléculaire, les installations de bio-informatique et l’expertise dans le séquençage du génome entier, la métagénomique et l’apprentissage automatique.

Pour cela, le Research Group for Genomic Epidemiology, National Food Institute, DTU recherche un candidat pour un poste vacant d’assistant de recherche en bioinformatique sur la métagénomique et l’analyse du séquençage du génome entier.

Responsabilités et qualifications

  • Vous vous engagerez dans le développement et la maintenance de pipelines de cartographie et d’analyse métagénomique.
  • Vous vous engagerez dans le développement et la maintenance d’outils d’analyse de séquençage du génome entier.
  • Maintenir et mettre à jour les bases de données utilisées dans le groupe. 
  • Maintenir et organiser le stockage des données dans le groupe.
  • Vous soutiendrez d’autres projets de recherche et activités en cours liés au séquençage du génome entier et à l’analyse métagénomique.

Les candidats doivent avoir une maîtrise de deux ans en bioinformatique ou un diplôme similaire avec un niveau académique équivalent à un master de deux ans. De préférence, le candidat a de l’expérience avec l’analyse métagénomique et les langages de programmation (Python / Perl). Une expérience avec les environnements shell / ligne de commande Unix est également préférée.

En tant que qualification formelle, vous devez être titulaire d’une maîtrise en ingénierie ou équivalent.

Nous offrons
DTU est une université technique de premier plan mondialement reconnue pour l’excellence de sa recherche, de son éducation, de son innovation et de ses conseils scientifiques. Nous offrons un travail enrichissant et stimulant dans un environnement international. Nous visons l’excellence académique dans un environnement caractérisé par le respect collégial et la liberté académique tempérée par la responsabilité.

Salaire et conditions de travail
La nomination sera basée sur la convention collective avec la Confédération des associations professionnelles. L’allocation sera convenue avec le syndicat concerné.

La période d’emploi est de 2 ans.

Vous pouvez en savoir plus sur les cheminements de carrière chez DTU ici .

Informations complémentaires Des informations
complémentaires peuvent être obtenues auprès du professeur Frank Møller Aarestrup, [email protected], +45 51157481

Vous pouvez en savoir plus sur DTU Food sur www.food.dtu.dk/english/Research/Genomic-Epidemiology

Si vous postulez depuis l’étranger, vous pouvez trouver des informations utiles sur le travail au Danemark et au DTU au DTU – Déménagement au Danemark .

Procédure de candidature
Votre candidature en ligne complète doit être soumise au plus tard le 8 juin 2021 (heure du Danemark) .

Les candidatures doivent être soumises en un seul fichier PDF contenant tous les éléments à prendre en considération. Pour postuler, veuillez ouvrir le lien «Postuler en ligne», remplir le formulaire de candidature en ligne et joindre tous vos documents en anglais dans un seul fichier PDF . Le dossier doit inclure:

  • Candidature (lettre de motivation)
  • CV
  • Diplômes académiques (MSc)

A ll candidats intéressés quel que soit l’ âge, le sexe, le handicap, la race, la religion ou l’ origine ethnique sont encouragés à appliquer.

Postulez pour cet emploi

Postulez au plus tard le 8 juin 2021
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Caractéristiques de l'emploi

Catégorie emploiEnseignement et recherche scientifique

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