Deux bourses de doctorat en génomique microbienne comparative à grande échelle, en phylogénie et en résistance aux antimicrobiens

Danemark
Publié il y a 4 mois

L’émergence et la propagation mondiales de la résistance aux antimicrobiens (RAM) comptent parmi les plus grands défis pour la santé humaine et animale.

Le Groupe de recherche sur l’épidémiologie génomique a pour tâche principale de mener des recherches ciblées dans le but de prédire et de prévenir les maladies infectieuses chez les humains et les animaux, et de soutenir la détection, la surveillance et le contrôle mondiaux, avec un accent particulier sur la résistance aux antimicrobiens. Le groupe de recherche combine l’expertise en microbiologie conventionnelle et moléculaire avec l’épidémiologie et la bioinformatique et agit en tant que centre de référence de l’UE et de l’OMS pour la résistance aux antimicrobiens.

Le groupe de recherche sur l’épidémiologie génomique, avec plusieurs partenaires dans le monde, est principalement financé par la Fondation Novo Nordisk et travaille à l’établissement et à l’amélioration de la surveillance mondiale de la résistance aux antimicrobiens. Ceci est basé sur des analyses à grande échelle et une comparaison des données NGS à partir d’isolats uniques et d’ensembles de données métagénomiques.

Pour cela, le groupe de recherche recherche des candidats pour deux postes de doctorat vacants en bioinformatique et en exploration de données axés sur la résistance aux antimicrobiens.

Responsabilités et qualifications

Position 1

Votre principale responsabilité sera d’effectuer des analyses génomiques comparatives de l’emplacement génomique exact des gènes de résistance aux antimicrobiens (synthèse des gènes) et de le déterminer à travers les réservoirs et les isolats uniques et les ensembles de données de métagénomique.

Position 2

Votre principale responsabilité sera d’intégrer des isolats uniques et des isolats assemblés par métagénomique dans des phylogénies à grande échelle et de les analyser par rapport aux réservoirs, à l’origine et à l’occurrence de gènes importants, y compris la résistance aux antimicrobiens.

Pour les deux postes:

  • Vous accomplirez cela à l’aide de différents outils de bioinformatique et d’apprentissage automatique pour déterminer l’association entre les gènes AMR dans les ensembles de données de métagénomique.
  • Vous communiquerez les résultats de la recherche en présentant des données lors de réunions de projet et de conférences internationales, et vous rédigerez des rapports et des manuscrits pour publication.
  • Le travail quotidien sera effectué en étroite collaboration avec d’autres chercheurs du groupe Epidémiologie génomique et avec des partenaires nationaux et internationaux associés au projet mondial d’assainissement. La collaboration comprend la participation active à des réunions et conférences nationales et internationales, le partage des données et des résultats, la contribution à des publications conjointes.

Vous devez être titulaire d’un master de deux ans (120 points ECTS) ou d’un diplôme similaire avec un niveau académique équivalent à un master de deux ans.

Approbation et inscription
La bourse pour le doctorat est soumise à l’approbation académique, et le candidat sera inscrit dans l’un des programmes de diplôme général au DTU. Pour plus d’informations sur nos conditions d’inscription et la planification générale du programme d’études de doctorat, veuillez consulter le guide du doctorat du DTU .

Nous offrons
DTU est une université technique de premier plan mondialement reconnue pour l’excellence de sa recherche, de son éducation, de son innovation et de ses conseils scientifiques. Nous offrons un travail enrichissant et stimulant dans un environnement international. Nous visons l’excellence académique dans un environnement caractérisé par le respect collégial et la liberté académique tempérée par la responsabilité.

Conditions de salaire et de nomination
La nomination sera basée sur la convention collective avec la Confédération danoise des associations professionnelles. L’allocation sera convenue avec le syndicat concerné. La période d’emploi est de 3 ans.

Vous pouvez en savoir plus sur les cheminements de carrière chez DTU ici .

Informations complémentaires Des informations
complémentaires peuvent être obtenues auprès du professeur Frank Møller Aarestrup, [email protected], +45 51157481.

Vous pouvez en savoir plus sur le groupe de recherche sur www.food.dtu.dk/english/Research/Genomic-Epidemiology

 Si vous postulez depuis l’étranger, vous pouvez trouver des informations utiles sur le travail au Danemark et au DTU au DTU – Déménagement au Danemark .

Procédure de candidature
Votre candidature en ligne complète doit être soumise au plus tard le 11 juin 2021 (heure du Danemark) .

Les candidatures doivent être soumises en un seul fichier PDF contenant tous les éléments à prendre en considération. Pour postuler, veuillez ouvrir le lien «Postuler en ligne», remplir le formulaire de candidature en ligne et joindre tous vos documents en anglais dans un seul fichier PDF . Le dossier doit inclure:

  • Une lettre motivant la candidature (lettre de motivation)
  • Curriculum vitae
  • Relevés de notes et diplôme BSc / MSc
  • Feuille Excel avec traduction des notes au système de notation danois (voir les lignes directrices et la feuille de calcul Excel ici )

Vous pouvez postuler avant d’obtenir votre master mais ne pouvez pas commencer avant de l’avoir reçu.

A ll candidats intéressés quel que soit l’ âge, le sexe, la race, le handicap, la religion ou l’ origine ethnique sont encouragés à appliquer.

Le National Food Institute recherche et communique des solutions durables et à valeur ajoutée dans les domaines de l’alimentation et de la santé au profit de la société et de l’industrie.

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Caractéristiques de l'emploi

Catégorie emploiStage et Formation

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