PhD Position – Algorithmes pour une dynamique moléculaire multi-échelles efficace

Allemagne
Publié il y a 1 mois

Groupe de travail:

INM -9 – Biomédecine computationnelle

Domaine de recherche:

Thèse de doctorat

Description de l’emploi:

L’Institut de Neuroscience et de Médecine – Biomédecine computationnelle ( INM -9) développe et utilise des méthodes informatiques allant des simulations moléculaires multi-échelles à la bioinformatique et à la conception de médicaments pour relever le défi de comprendre les bases moléculaires des processus de signalisation cellulaires (en particulier neuronaux), en Le projet vise à développer un logiciel efficace et hautement évolutif pour les simulations moléculaires, en particulier pour les applications aux systèmes biologiques. Le poste de doctorat sera situé à l’ INM -9 et est réalisé en très étroite collaboration avec Jülich Supercomputing Center ( JSC). Cela offre un environnement hautement interdisciplinaire pour le travail et la formation. Le travail de notre équipe nécessite une validation constante par les études expérimentales et nous avons accès à des plates-formes informatiques de pointe situées au JSC . Votre responsabilité en tant que membre de notre équipe sera de mettre en œuvre de nouvelles méthodes et algorithmes dans notre logiciel de simulation de dynamique moléculaire multi-échelles appelé MiMIC ( pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jctc.9b00093 , pubs.acs.org /doi/abs/10.1021/acs.jctc.9b00424 )

Votre travail:

    •  Participez au développement continu du code de simulation multi-échelles MiMiC
    •  Mettre en œuvre de nouveaux algorithmes parallèles ou paralléliser ceux existants
    •  Portez le code sur les GPU
    •  Tester et valider le logiciel
    • Benchmarkez votre code sur les supercalculateurs du JSC

Votre profil:

    •  Excellent diplôme universitaire (Master) en physique, en informatique ou dans un domaine connexe.
    •  Connaissance de base du système d’exploitation Unix
    •  Expérience avec un logiciel de simulation moléculaire
    •  Expérience avec le langage de programmation C ++ ou Fortran
    • La connaissance d’au moins une des techniques de calcul parallèle (OpenMP, MPI , CUDA ) est souhaitée
    •  La connaissance de la théorie fonctionnelle de la densité ou de la mécanique moléculaire est un plus
    •  Bonnes compétences en anglais parlé et écrit
    •  Compétences en communication et en travail d’équipe

Notre offre:

Nous travaillons sur les toutes dernières questions qui ont un impact sur notre société et vous offrons la possibilité de contribuer activement à façonner le changement! Nous vous proposons des conditions idéales pour terminer votre doctorat:

    •  Travailler dans un environnement motivé et hautement interdisciplinaire
    •  Opportunités de faire partie de la communauté scientifique nationale et internationale
    •  Cours de formation complets et possibilités individuelles de développement personnel et professionnel
    •  Gestion complète de la santé de l’entreprise
    •  Des conditions idéales pour concilier vie professionnelle et vie privée, ainsi qu’une politique d’entreprise familiale
    • Un programme de doctorat structuré pour vous et vos superviseurs avec un package complet de formation continue et de réseautage sur notre plateforme de doctorants JuDocs www.fz-juelich.de/judocs

    •  Services ciblés pour les employés internationaux, par exemple via notre service de conseil international

Le poste est initialement pour une durée déterminée de 3 ans. Payez conformément à 70% du groupe de rémunération 13 de la convention collective du service public (TVöD-Bund) et en plus 60% d’un salaire mensuel comme paiement spécial («prime de Noël»). De plus amples informations sur les diplômes de doctorat au Forschungszentrum Jülich, y compris nos autres sites, sont disponibles sur: www.fz-juelich.de/gp/Careers_Docs Le Forschungszentrum Jülich promeut l’égalité des chances et la diversité dans ses relations de travail . Nous accueillons également les candidatures de personnes handicapées.

Ce centre de recherche fait partie de l’Association Helmholtz des centres de recherche allemands. Avec plus de 42 000 employés et un budget annuel de plus de 5 milliards d’euros, l’Association Helmholtz est la plus grande organisation scientifique d’Allemagne.

Caractéristiques de l'emploi

Catégorie emploiEnseignement et recherche scientifique

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