Post-doc en spectroscopie multidimensionnelle femtoseconde dans les flavoenzymes

France
Publié il y a 2 mois

Un poste postdoctoral est disponible au  Laboratoire d’Optique et Biosciences  (Ecole Polytechnique, CNRS , INSERM ) à  Palaiseau , France. L’engagement proposé est d’une durée d’au moins 18 mois, avec une date de début flexible entre septembre 2021 et janvier 2022. Le post-doctorant recruté contribuera au   projet MIRTHYX ( ANR -19-CE30-0001 ), visant à développer la spectroscopie 2DIR en flavoenzymes, en étroite collaboration avec l’  Institut d’Optique Graduate School  et  Amplitude Laser .

Le Laboratoire d’Optique et Biosciences ( LOB ) bénéficie d’un environnement interdisciplinaire où physiciens et biologistes travaillent ensemble pour aborder des problématiques pertinentes en biologie à travers le développement de nouvelles méthodes optiques, basées par exemple sur les lasers femtosecondes et l’optique non linéaire. Dans ce contexte, l’équipe hôte est plus particulièrement impliquée dans l’application de la spectroscopie femtoseconde dans l’ infrarouge moyen ( MIR ) à l’investigation de diverses biomolécules 1 . Le projet proposé abordera les changements structurels locaux de la flavoenzyme ThyX lors de la liaison de substrats ou d’inhibiteurs. ThyX, une alternative bactérienne au Thymidylate Synthase, a été identifié comme une cible antimicrobienne prometteuse 2. Des acides aminés non naturels seront insérés à des sites spécifiques de la protéine afin de fournir une résolution spatiale et temporelle combinée. L’application de la spectroscopie 2DIR à ce système ne sera possible que grâce à la grande amélioration du rapport signal sur bruit récemment rapportée pour les spectromètres 2DIR à taux de répétition élevé pompés par diode 3 . La source MIR développée dans le cadre du projet MIRThyX profitera de la récente démonstration par nos partenaires d’une compression efficace jusqu’à 7 impulsions fs 4 , simplifiant grandement la génération d’ impulsions MIR grâce à l’utilisation d’un simple redressement optique.

Le post-doc engagé aura l’opportunité de contribuer aux tâches suivantes:

    • préparation de protéines ThyX avec des acides aminés non naturels substitués aux sites appropriés,
    • Spectroscopie pompe-sonde MIR dans ThyX utilisant un système Titane: Saphir 1 kHz,
    • développement d’un nouveau spectromètre 2DIR à balayage adapté au fonctionnement à 125 kHz,
    • caractérisation de la source MIR 125 kHz basée sur le redressement optique d’impulsions 7-fs,
    • Spectroscopie 2DIR dans ThyX en utilisant la source MIR 125 kHz .

Les deux derniers événements auront lieu à l’Institut d’Optique, situé à Palaiseau à quelques pas du LOB .

1 C. Falvo, L. Daniault, T. Vieille, V. Kemlin, JC Lambry, C. Meier, MH Vos, A. Bonvalet, M. Joffre,  J. Phys. Chem. Lett. 6 , 2216-2222 (2015) , V. Kemlin, A. Bonvalet, L. Daniault, M. Joffre,  J. Phys. Chem. Lett. 7 , 3377-3382 (2016) , JA De La Paz, A. Bonvalet, M. Joffre,  Opt. Express  27 , 4140 (2019) , D.Sorigue et al.,  Science  372 , 148 (2021) .

2 H. Myllykallio, G. Lipowski, D. Leduc, J. Filee, P. Forterre, U. Liebl,  Science  297 , 105 (2002) .

3 BM Luther, KM Tracy, M. Gerrity, S. Brown, AT Krummel,  Opt. Express  24 , 4117-4127 (2016) , PM Donaldson, GM Greetham, DJ Shaw, AW Parker, M. Towrie,  J. Phys. Chem. A  122 , 780-787 (2018) , KM Farrell, JS Ostrander, AC Jones, BR Yakami, SS Dicke, CT Middleton, P. Hamm, MT Zanni,  Opt. Express  28 , 33584 (2020) .

4 L. Lavenu, M. Natile, F. Guichard, X. Delen, M. Hanna, Y. Zaouter, P. Georges,  Opt. Express  27 , 1958-1967 (2019) .

Caractéristiques de l'emploi

Catégorie emploiEnseignement et recherche scientifique

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