Stagiaire postdoctoral senior/junior en bioinformatique – Université des sciences et technologies du roi Abdallah (KAUST)

Arabie saoudite
Publié il y a 2 mois

Les candidats très motivés sont invités à postuler pour un poste postdoctoral de 2 ans (avec possibilité de prolongation) au sein du laboratoire de l’ Assoc. Professeur David Gomez-Cabrero de la division des sciences et de l’ingénierie biologiques et environnementales ( BESE ) de l’ Université des sciences et technologies du roi Abdallah ( KAUST ) ( https://www.kaust.edu.sa/en/study/faculty/david -gomez-cabrero ).

Le projet étudie la composition de la niche de la moelle osseuse en bonne santé et les changements associés à la maladie en utilisant une stratégie multi-omique. Nous générons une collection complète de profils en vrac (ARN+ATAC-seq), unicellulaires (ARN+ATAC-seq) et transcriptomiques spatiaux ( ARN – seq) de cellules progénitrices hématopoïétiques et non hématopoïétiques dans la moelle osseuse. Notre objectif est de caractériser tous les types de cellules (voir :  https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104225 ), leur organisation 3D dans la moelle osseuse et les interactions cellule à cellule qui définissent la différenciation cellulaire. De plus, nous étudions – grâce aux mêmes technologies – les changements qui se produisent dans le myélome multiple et la myélodysplasie .

Ce qui est attendu :

    • Analyse bioinformatique (selon l’expérience du candidat) : (i) soutien à la mise en œuvre et/ou au développement de pipelines bioinformatiques de pointe ; (ii) analyse unicellulaire, analyse multi-omique ; (iii) analyse bioinformatique transcriptomique spatiale.
    • Apprendre et mettre en œuvre l’analyse basée sur la médecine systémique.
    • Collaboration avec des cliniciens et des biologistes.
    • Participation active au développement des projets (par exemple, conception, développement conceptuel, etc.)
    • Collaborer au développement de tout développement bioinformatique nécessaire pour atteindre les objectifs du projet.
    • Participer à la présentation orale de tous les résultats et résumés du projet, y compris la participation aux réunions périodiques sur l’état du projet et la présentation des livrables finaux du projet
    • Des déplacements seront nécessaires occasionnellement pour le projet (réunions de travail, diffusion et/ou à des fins pédagogiques)

Le candidat retenu rejoindra une communauté dynamique et polyvalente de bioinformaticiens, d’informaticiens, de biotechnologistes, de biologistes et de biochimistes.

Le candidat retenu bénéficiera également d’un environnement visant à faciliter la progression dans la carrière de chercheur : réseautage, encadrement d’étudiants et gestion de projet. Nous considérerons les tâches et les responsabilités en fonction de l’ancienneté et de l’expérience.

La division BESE de KAUST offre une combinaison unique d’un environnement intellectuellement stimulant et d’un accès à des laboratoires, des instruments et des programmes de financement de classe mondiale. Les installations de KAUST comprennent également des laboratoires de base à la pointe de la technologie en génomique, protéomique, imagerie et caractérisation, informatique extrême et informatique.

Au propos de vous

Le chercheur postdoctoral devra jouer un rôle de premier plan dans l’élaboration et la réalisation du programme de recherche. Le projet nécessitera de solides compétences en analyse de données bioinformatiques, en mise en œuvre du pipeline (et éventuellement en développement) et en programmation. Le candidat idéal aura un doctorat. en bioinformatique, en informatique, en biotechnologie, en biologie ou dans une discipline connexe. L’expérience en analyse NGS ( ARN -seq / ATAC -seq; en vrac / cellule unique) et en profilage spatial sera évaluée positivement. Un haut niveau de maîtrise de l’anglais et d’excellentes compétences en communication écrite et verbale sont des exigences essentielles pour ce poste.

Informations Complémentaires

KAUST est une université internationale de recherche diplômée dédiée à l’avancement de la science et de la technologie grâce à la recherche interdisciplinaire, à l’éducation et à l’innovation. KAUST attire les meilleurs professeurs, scientifiques, ingénieurs et étudiants internationaux pour mener des recherches motivées par la curiosité et axées sur les objectifs afin de relever les défis scientifiques et technologiques les plus urgents au monde. Situé en Arabie saoudite, sur les rives orientales de la mer Rouge, KAUST offre un campus primé pour vivre, travailler, étudier et jouer, et offre de superbes installations de recherche, avec un financement de recherche de base garanti, un soutien aux infrastructures, des opportunités d’entrepreneuriat et à l’international. salaires compétitifs. Pour plus d’informations sur KAUST , veuillez visiter http://www.kaust.edu.sa . Plus d’informations sur la division BESE et le programme Bioscience sont disponibles sur  http://bese.kaust.edu.sa .

Les demandes informelles sont les bienvenues, veuillez consulter le lien de candidature :  https://apply.interfolio.com/113819

Les autres informations:

La date de début est flexible.

Qualifications

Qualifications requises

    • Le plus important :  la motivation .
    • Un doctorat. et expérience dans un domaine disciplinaire pertinent, y compris la bioinformatique, l’informatique, la biotechnologie, la biologie et la biologie computationnelle.
    • Compétences en programmation : R et/ou Python
    • Personnalité créative et motivée avec un intérêt pour les sciences fondamentales et appliquées pour relever les grands défis de l’agriculture.
    • Excellentes compétences en résolution de problèmes combinées à de bonnes compétences interpersonnelles pour le travail d’équipe international.
    • Excellentes compétences en communication en anglais
    • Compétences de haut niveau en communication écrite et orale avec la capacité de représenter l’équipe de recherche lors de conférences nationales et internationales.
    • Un registre des publications dans des revues de qualité à comité de lecture

Compétences supplémentaires à considérer

    • Expérience dans l’utilisation et le développement d’outils Open Source.
    • Expérience de l’utilisation de bases de données relationnelles, de SQL et/ou de formats de données structurées.
    • Analyse multi-omique.
    • Conception, implémentation et documentation de packages R.
    • Gestion du serveur.

Veuillez postuler via le site Web du recruteur.

Caractéristiques de l'emploi

Catégorie emploiPost doc

Postuler en ligne

Laissez un commentaire

Ce site utilise Akismet pour réduire les indésirables. En savoir plus sur comment les données de vos commentaires sont utilisées.