Doktorand (m / w / div) in MS-basierter Proteomik kleiner Proteine

Das Max-Planck-Institut für Biophysik ist ein führendes internationales Forschungsinstitut, das biophysikalische, biochemische und rechnerische Methoden verwendet, um die Struktur, Dynamik und Funktion zellulärer Systeme auf molekularer Ebene zu untersuchen. Es besteht aus vier wissenschaftlichen Abteilungen, mehreren Forschungsgruppen und wissenschaftlichen Kerneinrichtungen mit etwa 200 Mitarbeitern aus mehr als 25 Ländern. Mein Labor ist auf die Entwicklung massenspektrometrischer Techniken spezialisiert, um offene Fragen in der Struktur-, Molekular- und Neurobiologie zu beantworten. Unser Methodenportfolio umfasst proteomische Workflows ( markierungsfreie [ DDA , DIA ] und markierungsbasierte [ SILAC , TMT ] Quantifizierungen, gezielte Workflows [ PRM ], PTMund Top-Down-Analysen) sowie HDX- MS, Lipidomics / Metabolomics und MS-Bildgebung ( https://www.biophys.mpg.de/2126817/proteomics ).

Im Rahmen des Special Priority Program 2002 der DFG ( https://www.spp2002.uni-kiel.de/ ) suchen wir derzeit nach einem

Doktorand (m / w / div)
in MS-basierter Proteomik kleiner Proteine

Ziel des Projekts ist es, die funktionellen Rollen spezifischer kleiner Proteinuntereinheiten in prokaryotischen terminalen Oxidasen (z. B.  https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31604309/ ) zu untersuchen und Top-Down-Ansätze zu untersuchen und weiterzuentwickeln neue Untereinheiten in verschiedenen prokaryotischen Modellsystemen (z. B. E. coli und Pseudomonas) zu identifizieren.

Wir bieten:

  • Die Möglichkeit, fortgeschrittene Techniken in der MS-basierten Proteomics-Datenerfassung und -analyse zu erlernen und zu entwickeln
  • Modernste Forschungsausrüstung (z. B. Orbitrap Eclipse [ FAIMS ], Fusion Lumos, Rapiflex TOF / TOF- Instrumente) und technische Infrastruktur (wissenschaftliches Rechnen, EM-Anlage, Elektronik und mechanische Werkstatt)
  • Eine großartige, hochgradig interaktive Arbeitsatmosphäre in einem internationalen und kollaborativen Team und Institut
  • Eine anfängliche Förderperiode von drei Jahren, einschließlich Teilnahme an Workshops, Seminaren, Konferenzen (Gehaltsskala des Bundes für den öffentlichen Dienst TVöD E13 / 65%).

Dein Profil:

  • Master / Diplom in Chemie, Biochemie oder Biophysik oder gleichwertig
  • Die bisherigen Erfahrungen mit MALDI – TOF und / oder LC-MS Datenerfassung und -analyse sind obligatorisch
  • Kenntnisse über zugehörige Software und bioinformatische Tools (z. B. MaxQuant, Perseus, Proteome Discoverer, PEAKS usw.) und / oder Programmiersprachen (R, Python) sind von Vorteil
  • Erfahrung in der Arbeit mit Membranproteinen und biochemischen Techniken ist von Vorteil
  • Aufgeschlossene und motivierte Persönlichkeit mit Fokus auf Teamplay
  • Fähigkeit, genau und unabhängig zu arbeiten

Die Max-Planck-Gesellschaft strebt nach Gleichstellung und Vielfalt der Geschlechter. Wir freuen uns über Bewerbungen aus allen Bereichen. Die Max-Planck-Gesellschaft will mehr behinderte Menschen beschäftigen. Bewerbungen von behinderten Menschen werden ausdrücklich empfohlen.

Bitte senden Sie Ihre Bewerbung  mit dem Betreff „SPP 2002 PhD application“ an julian.langer@biophys.mpg.de und  fügen Sie ein Anschreiben mit einer kurzen Zusammenfassung der relevanten Forschungserfahrungen, einem Lebenslauf und Referenzen oder Kontaktdaten in einer einzigen PDF-Datei bei .

Max-Planck-Institut für Biophysik
Herrn Dr. Julian Langer
Max-von-Laue-Straße 3
60438 Frankfurt am Main

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