Chercheur postdoctoral en modèles de bio-ingénierie pour étudier les interactions multicellulaires des macrophages – Canada

Un poste postdoctoral à temps plein financé par une subvention pendant deux ans est disponible pour une personne très motivée souhaitant établir des modèles de tissus humains biomimétiques ou bioartificiels 3D afin d’étudier la dynamique des interactions complexes immunitaires – cellules structurelles – matrice extracellulaire et leur rôle dans le développement d’immunothérapies efficaces. Ce travail doit être mené dans le cadre du nouveau cluster d’immunobiologie intégrative multi-échelle à l’UBC-Okanagan qui comprend les laboratoires des Drs Isaac Li, Emmanuel Osei, Fred Menard, Will Hughes et Luca Piantanida ( https://research.ok.ubc .ca/research-excellence/research-clusters/immuno… ).

Le candidat retenu sera principalement supervisé par les Drs. Osei et Li bénéficieront également d’un mentorat conjoint de la part de l’ensemble du cluster.

OBJECTIFS DU CLUSTER D’IMMUNOBIOLOGIE INTÉGRATIVE MULTI-ÉCHELLE

Le groupe vise à comprendre les subtilités des interactions des cellules immunitaires, en se concentrant spécifiquement sur les macrophages, afin de propulser les progrès de l’immunothérapie pour une gamme de maladies liées aux poumons (par exemple, le COVID-19-ARDS, la BPCO et le cancer du poumon). Fondamentalement, ces maladies ont des mécanismes sous-jacents communs : elles sont principalement provoquées par des réponses immunitaires aberrantes qui entraînent une inflammation incontrôlée, une fibrose et des lésions tissulaires. Pour ce faire, notre objectif immédiat est de développer des techniques de nouvelle génération et des modèles bioartificiels permettant de surveiller en temps réel la fonction et les interactions des macrophages à plusieurs échelles biologiques, depuis les molécules (nm, sec) jusqu’aux cellules (μm, heures) et aux tissus ( mm, jours). Cela fournira des informations importantes sur le rôle de ces cellules dans l’homéostasie tissulaire et les mécanismes pathologiques.

DESCRIPTION DU PROJET

Pour comprendre l’interaction dynamique entre les macrophages et les types de cellules qui influencent leur activité (par exemple, les cellules T, les fibroblastes, les cellules épithéliales et cancéreuses) ainsi que la matrice extracellulaire, nous avons l’intention de développer des modèles biomimétiques ou bioartificiels multicellulaires robustes, viables. Le candidat retenu aura accès à des bio-imprimantes de traitement de la lumière par extrusion et numérique, à des imprimantes 3D et à des installations de culture tissulaire pour permettre le développement de sphéroïdes et d’organoïdes vers des modèles de tissus biomimétiques vascularisés plus complexes, d’abord avec des lignées cellulaires secondaires, puis avec des cellules primaires. Ces modèles seront soigneusement caractérisés à l’aide d’analyses moléculaires (avancées) (par exemple, tri cellulaire, ELISA RNAseq et Luminex) et de sondes chimiques nouvellement synthétisées. En outre, le candidat retenu développera également des méthodes d’imagerie avancée (5D) des modèles d’ingénierie tissulaire afin d’évaluer les interactions cellule-cellule-ECM et de fournir des informations spatiales, temporelles et spectrales à partir des modèles. Tous les modèles établis seront validés via des comparaisons avec des modèles 3D in vitro établis, par exemple des tranches de poumon coupées avec précision. Après caractérisation des modèles en conditions homéostatiques, des perturbateurs seront introduits pour évaluer les phénotypes anormaux et différents mécanismes pathologiques.

QUALIFICATIONS ET COMPÉTENCES

Les candidats doivent avoir complété un doctorat. en génie biomédical ou en sciences biomédicales avec un accent sur le génie tissulaire, la biologie cellulaire et moléculaire ou d’autres disciplines connexes au cours des cinq dernières années avec un dossier de publications impressionnant pour être compétitif pour les bourses d’études et les subventions provinciales et nationales.

Le candidat doit avoir une solide expérience/formation dans le travail sur des modèles d’ingénierie tissulaire, par exemple des modèles d’hydrogel cellulaire bio-imprimés, des modèles d’organes sur puce, des modèles d’hydrogel 3D in vitro intégrés dans des cellules, des organoïdes, des modèles de co-culture in vitro, des poumons coupés avec précision. tranches etc

Une expérience démontrée des protocoles de vascularisation et de l’établissement de modèles de bio-ingénierie vascularisés est un atout.

Expérience des techniques de biofabrication, de l’ingénierie et de la manipulation de différents bio-encres naturelles et synthétiques (Collagène, GELMA, PEGDA, Alginate, Matrigel, etc.)

Une expérience et une expertise antérieures en matière de bio-impression par extrusion et par traitement par lumière numérique sont un atout.

Une formation en langages de programmation de modélisation 3D.

Solide expérience et expertise en culture cellulaire, immunologie et inflammation cellulaires, signalisation cellulaire, voies fibrotiques et des facteurs de croissance.  

Une solide expérience en techniques de biologie cellulaire et moléculaire, notamment les Westerns, la Q-PCR, le séquençage de nouvelle génération et la capacité d’analyser des données volumineuses à l’aide de langages de programmation et d’apprentissage automatique, la méthodologie ARNi, les méthodologies d’édition de gènes, le clonage moléculaire et la production de plasmides sont hautement souhaitables.

Expérience et expertise en biologie des macrophages et des cellules structurales (cellules épithéliales, fibroblastes, cellules endothéliales).

Le candidat doit postuler à toutes les opportunités de financement postdoctoral externes (par exemple, bourse postdoctorale Michael Smith, Banting, CRSNG, IRSC et diverses bourses de voyage pour assister à des conférences).

RESPONSABILITÉS

• Effectuer des analyses de la littérature pour identifier les principales lacunes dans les connaissances actuelles et éclairer l’approche d’analyse.
• Établir des modèles de macrophages sphéroïdes et organoïdes multicellulaires.
• Bio-ingénierie des formulations de bio-encres optimales pour établir des modèles de tissus de macrophages multicellulaires vascularisés bio-imprimés à l’aide de techniques de bio-impression basées sur l’extrusion et le traitement de la lumière numérique.
• Caractériser les modèles établis grâce à des analyses moléculaires impliquant l’isolement et le fractionnement de cellules à partir de modèles et d’organoïdes bio-imprimés en hydrogel 3D à l’aide de protocoles de tri cellulaire, d’immunocytologie, d’histologie, d’ELISA (Luminex), de transferts Western, d’ARNseq, de PCR, d’études d’édition de gènes, etc.
• Établir des protocoles pour utiliser des techniques d’imagerie avancées pour observer les interactions cellule-cellule-ECM.
• Optimiser le modèle établi pour inclure les cellules humaines primaires et évaluer l’effet des perturbogènes dans les systèmes biomimétiques des macrophages multicellulaires afin de modéliser les conditions homéostatiques et pathologiques.
• Rédiger des manuscrits évalués par des pairs pour publication dans des revues pertinentes.
• Élaborer des plans d’analyse et effectuer des analyses de données à l’aide de sources de données primaires et secondaires.
• Diriger des activités d’application des connaissances, y compris des présentations lors de conférences de recherche, des réunions avec des intervenants clés et des initiatives de changement de politique.
• Aider à superviser la recherche aux cycles supérieurs et au premier cycle.
• Identifier les sources de financement pertinentes et élaborer des propositions et des demandes de subventions selon les besoins.
• Préparer les demandes d’éthique et d’autres tâches liées à la recherche, selon les besoins.
• Aide à la gestion des activités du cluster.

CONSÉQUENCE DE L’ERREUR :

Il s’agit d’un poste de recherche senior qui joue un rôle essentiel dans le développement de ce nouveau domaine. Le poste assure le leadership et définit l’orientation de la conduite de la recherche et est responsable de l’intégrité des données et de la gestion efficace et efficiente des projets de recherche. Le candidat retenu sera responsable de la qualité et de l’intégrité de la recherche entreprise, y compris les données, les analyses et l’interprétation, ainsi que de la gestion efficace des livrables. Le poste nécessite de l’innovation, de l’adaptation et une planification stratégique. Une décision ou des actions incorrectes peuvent nuire à la réputation du laboratoire, coûter cher et entraîner une perte de crédibilité.

SUPERVISION REÇUE :

Le candidat choisi travaillera avec un degré élevé d’indépendance et devra établir des priorités selon des directives générales et de concert avec les chercheurs principaux. Le PDF devra jouer un rôle de leadership dans le laboratoire sous la supervision des Drs Osei et Li. Ce poste offrira au candidat un niveau élevé d’exposition à la biotechnologie.

SUPERVISION DONNÉE :

Le PDF devra fournir une supervision et des conseils aux étudiants du premier cycle et des cycles supérieurs, selon les besoins.

SALAIRE

50 000 $ par année (plus avantages sociaux).

PROCÉDURE DE DEMANDE

Veuillez soumettre un seul dossier PDF au Dr Emmanuel Osei (emmanuel.osei@ubc,ca) et au Dr Isaac Li ( isaac.li@ubc.ca ) contenant :

• LETTRE DE COUVERTURE (une page détaillant l’expertise, les intérêts de recherche/objectifs de carrière)
• CV contenant le dossier de publication et les coordonnées de 3 références.

Les candidatures seront acceptées jusqu’à 17h00 PST, le 31 mai 2024.

Cette offre concerne le campus de l’UBC Okanagan à Kelowna, en Colombie-Britannique, au Canada.

Veuillez vous référer au numéro de référence EU-57955 lors de toute correspondance concernant ce poste.

L’équité et la diversité sont essentielles à l’excellence académique. Une communauté ouverte et diversifiée favorise l’inclusion de voix sous-représentées ou découragées. Nous encourageons les candidatures de membres de groupes qui ont été marginalisés pour tout motif énuméré dans le Code des droits de la personne de la Colombie-Britannique, notamment le sexe, l’orientation sexuelle, l’identité ou l’expression de genre, la racialisation, le handicap, les convictions politiques, la religion, l’état matrimonial ou familial, l’âge et /ou statut de personne des Premières Nations, Métis, Inuit ou autochtone.

À propos de l’UBC
L’Université de la Colombie-Britannique est un centre mondial de recherche et d’enseignement, régulièrement classé parmi les 20 meilleures universités publiques au monde. Le campus Okanagan de l’UBC est une communauté d’apprentissage intime qui adopte de nouvelles façons de penser audacieuses. Nous attirons des étudiants et des professeurs exceptionnels qui visent à changer le monde.

Boursiers postdoctoraux à l’UBC Okanagan
UBCO abrite une population croissante de plus de 60 postdoctorants, contribuant à une culture de recherche florissante qui a un impact sur notre région, notre pays et la communauté internationale. Le Collège des études supérieures s’associe aux facultés et aux services du campus pour offrir des opportunités de mentorat, des ateliers, des événements et des expériences enrichissantes qui préparent les postdoctorants à leur avenir dans le monde universitaire et professionnel. Notre association postdoctorale fournit et construit une communauté accueillante pour les postdoctorants sur le campus de l’UBC Okanagan.

À propos de Kelowna
Le campus Okanagan de l’UBC borde la ville dynamique de Kelowna, un pôle de développement économique avec une population d’environ 150 000 habitants – la quatrième population à la croissance la plus rapide au Canada. En fait, la vallée de l’Okanagan est considérée comme l’une des meilleures communautés au Canada pour développer votre entreprise. Plus de 160 autobus circulent quotidiennement du campus vers des endroits clés tels que le quartier culturel de Kelowna et le secteur riverain prospère du centre-ville. Le campus se trouve à deux minutes de l’aéroport international de Kelowna, l’un des 10 aéroports les plus fréquentés au Canada.