Doctorat en Modélisation du Développement des Plantes

Le laboratoire RDP (Reproduction et Développement des Plantes) est une unité mixte de recherche CNRS, INRAE, ENS de Lyon et UCBL associée à l’INRIA, comprenant 9 équipes de recherche (environ 120 personnes). Le laboratoire est un centre de recherche interdisciplinaire de premier plan en biologie du développement des plantes et en biologie quantitative. Le laboratoire est situé sur le site Monod de l’ENS de Lyon. La thèse de doctorat sera codirigée par deux membres du laboratoire RDP, Teva Vernoux et Christophe Godin.

Activités
– Développement de modèles
– Programmation de modèles
– Analyse des résultats et comparaison avec des données réelles issues de l’imagerie
– Présentation orale et discussion des résultats
– Rédaction de rapports
– Analyse de la littérature

Compétences attendues

Compétences/connaissances
Connaissances correspondant à celles de niveau master ou ingénieur.

Savoir-faire
Le doctorant doit être familier avec le développement des systèmes biologiques (animaux ou végétaux), notamment au niveau cellulaire.
Le candidat doit maîtriser les sujets suivants :
– Théorie des systèmes dynamiques
– Réseaux de régulation génétique
– ODE
– Simulation computationnelle
– Programmation Python (ou équivalent)
Le candidat doit maîtriser l’anglais scientifique.

soft skills
Le doctorant doit avoir l’esprit d’équipe, être ouvert d’esprit, faire preuve d’autonomie et de méthode dans son investigation.

Le doctorant développera un nouveau modèle de signalisation de l’auxine avec une capacité d’intégration temporelle de l’information sur l’auxine, et le couplera à un modèle de transport de l’auxine dans le méristème apical des pousses.