Un poste postdoctoral est disponible à l’Université de Californie

Un poste postdoctoral est disponible à l’Université de Californie à Irvine sous la direction du Dr Stanley Ng. Le candidat retenu explorera la relation entre la hiérarchie des couches moléculaires de l’épigénome au phénome à résolution clonale dans divers tissus. En bref, les études impliqueront la génération de multiples modalités de données à partir de clones de tissus humains et de souris, y compris les mutations somatiques de l’ADN résolues dans l’espace, l’expression des gènes et des protéines et les profils de méthylation. L’intégration bioinformatique de types de données distincts et des analyses statistiques ultérieures seront effectuées pour élucider comment les altérations de diverses couches moléculaires dans des clones individuels peuvent conduire à leurs contributions respectives au développement/progression de la maladie, à la transformation maligne et à la résistance spécifique au traitement. Ainsi, ces études faciliteront l’identification de nouveaux marqueurs de risque et de cibles thérapeutiques. Le développement de prédicteurs moléculaires de risque et de réponse au traitement basés sur des biofluides minimalement invasifs et cliniquement pertinents à l’aide de modèles statistiques sera également étudié, dans le but d’une traduction clinique.
Nous recherchons des candidats intéressés par le développement de nouveaux outils de diagnostic et l’identification de stratégies de ciblage spécifiques aux clones de maladies. Les candidats retenus devront travailler de manière indépendante, tout en collaborant avec des bioinformaticiens, des biologistes, des cliniciens et d’autres scientifiques, le cas échéant, pour atteindre des objectifs scientifiques.
Notre laboratoire utilise des plateformes informatiques de pointe et des technologies omiques de pointe. UC Irvine est une université de recherche de classe mondiale avec des programmes d’études supérieures hautement classés en sciences biomédicales. Notre emplacement dans le sud de la Californie abrite l’un des plus grands centres de recherche universitaire et de biotechnologie aux États-Unis. Les membres du laboratoire bénéficient d’un accès direct à cette communauté exceptionnelle de cliniciens et de scientifiques, ainsi qu’au large éventail d’activités récréatives disponibles dans notre région. Les candidats retenus rejoindront une équipe interdisciplinaire et hautement collaborative travaillant au développement de la prochaine génération d’outils et de technologies pour faire progresser les diagnostics et la thérapeutique de précision.

Qualification requise
• Un doctorat ou un doctorat en médecine/doctorat axé sur l’épigénétique, la génétique, la génomique, la biologie, la bioinformatique, l’apprentissage automatique ou un domaine connexe Compétences/qualifications préférées • Vaste expérience
dans un environnement de recherche et au moins une publication du premier auteur dans un revue scientifique réputée
• Maîtrise de R, Python et/ou d’autres langages de programmation, et familiarité avec le travail dans un environnement informatique haute performance basé sur Linux
• Formation formelle et expertise dans le développement de modèles statistiques et l’analyse de données de grande dimension, y compris ensembles de données de séquençage de nouvelle génération
• Capacité à travailler de manière indépendante pour faire avancer les projets
• Capacité à communiquer efficacement et à collaborer au sein d’une équipe multidisciplinaire
• Capacité à composer et à présenter des présentations complètes lors de réunions scientifiques et à préparer des articles de recherche pour des publications à comité de lecture
• Expérience dans la coupe, la fixation et la coloration de tissus pour l’imagerie histologique, la microdissection par capture laser et la préparation d’échantillons pour le séquençage (monocellulaire)
• Expertise avec ATAC-Seq, profilage de méthylation, séquençage du génome/exome/ciblé, appel de mutation, analyse de cellule unique, ARN-Seq, protéomique, analyse des biofluides, technologies spatiales de 10X, NanoString, ou similaire • Expertise en apprentissage automatique et en mathématiques/
statistiques inférence (par exemple, classification d’images à l’aide de réseaux de neurones profonds, apprentissage par renforcement, modèles de régression et de classification régularisés, regroupement, optimisation)
• Expérience de la génération de données multi-omiques et de l’analyse intégrative (par exemple, 10X Multiome, Mission Bio Tapestri, pipelines de calcul personnalisés)
• Expertise en parallélisation multicœur/multithread utilisant l’accélération matérielle basée sur GPU ou similaire
• Expérience avec la construction logiciels hautement distribuables (par exemple, packages R, modules Python, outils de ligne de commande basés sur Linux, programmes C, applications MATLAB, GitHub) Le

salaire sera basé sur les directives de l’Université de Californie pour les boursiers postdoctoraux et est proportionnel aux qualifications et à l’expérience. Les nominations auront une durée maximale de 3 ans et seront financées par des bourses extra-muros.
Pour plus d’informations sur le programme de recherche et cette opportunité, veuillez contacter le Dr Ng à stanlewn@uci.edu.
Département : https://www.biochem.uci.edu/index.asp

QUALIFICATIONS
Qualifications de base (requises au moment de la candidature)
Un doctorat ou un doctorat en médecine avec un accent sur l’épigénétique, la génétique, la génomique, la biologie, la bioinformatique, l’apprentissage automatique , ou un domaine connexe

EXIGENCES D’APPLICATION
Exigences documentaires

• Curriculum Vitae – Votre CV le plus récemment mis à jour
• Lettre de motivation (facultatif)
• Déclaration de recherche – Décrivez votre expérience antérieure, vos objectifs futurs et comment vous pouvez contribuer à la vision globale de la recherche du laboratoire Ng
• Déclaration des activités d’excellence inclusive – Déclaration expliquant comment les contributions passées et/ou potentielles à l’excellence inclusive feront progresser l’engagement de l’UCI envers l’excellence inclusive. Consultez nos conseils pour rédiger une déclaration d’activités d’excellence inclusive. (Facultatif)
• Divers / Supplémentaires (Facultatif) Exigences de référence 3-5 requises (coordonnées uniquement)

Exigences de référence

• 3-5 requis (coordonnées uniquement)

Lien d’application : https://recruit.ap.uci.edu/JPF08190