Doctorat en analyse spatio-temporelle du développement du cerveau humain au niveau d’une seule cellule – Fribourg-en-Brisgau , Allemagne

Le laboratoire Vogel ( www.developmentalneuroepigenetics.uni-freiburg.de ), Institut d’anatomie et de biologie cellulaire, Université de Fribourg, utilise des approches de séquençage unicellulaire pour étudier la régulation transcriptionnelle par le biais de modifications d’histones et de facteurs de transcription au cours du développement du cortex cérébral et de l’hippocampe, et dans les maladies du SNC. Nous nous intéressons particulièrement à la fonction de l’histone méthyltransférase DOT1L et avons récemment montré que DOT1L a une grande plasticité conduisant à des effets pléiotropiques lors de la spécification des couches du néocortex cérébral (Franz et al, 2019), à des altérations des paysages amplificateurs (Ferrari et al , 2020), et basée sur des analyses unicellulaires, à une adaptation du programme métabolique lors de la différenciation neuronale (Appiah et al, 2022).

Nous recherchons un doctorant motivé pour faire progresser notre compréhension du développement cortical humain en explorant le transcriptome et l’épigénome dépendants de DOT1L dans des cellules individuelles lors de la différenciation organoïde du cerveau humain avec une résolution spatio-temporelle. La technologie de séquençage unicellulaire d’organoïdes du cerveau humain et d’iPSC sera combinée à des analyses de transcriptomique spatiale et de bioinformatique.

Le doctorant sera membre du groupe de formation à la recherche Me In Bio PhD (RTG2344, financé par la Fondation allemande pour la recherche) et bénéficiera de son programme de formation structuré. Me In Bio vise une double formation en bioinformatique et en approches de laboratoire humide pour explorer la dynamique spatio-temporelle de la régulation des gènes à l’aide de méthodes à haut débit et à haute résolution ( www.meinbio.uni-freiburg.de ) .

Nous recherchons un chercheur junior ayant une formation en neurosciences, en épigénétique et/ou en analyse (cellule unique) – omique.

Le poste de doctorat est financé à partir de septembre 2023 pour trois ans (65% TVL-E13, échelle salariale de la fonction publique allemande).

Nous offrons

• Un projet de recherche moderne passionnant dans un laboratoire bien équipé utilisant des technologies de pointe
• Encadrement intensif assuré par un comité consultatif de thèse
• Echange régulier avec un laboratoire tandem de bioinformatique pour assurer une communication interdisciplinaire à bas seuil
• Cours réguliers en bioinformatique et techniques de laboratoire humide offerts par le RTG2344 Me In Bio
• Cours supplémentaires de “compétences générales” et possibilités de mise en réseau avec tous les membres de RTG Me In Bio pour des échanges scientifiques
• Fonds annuels pour les visites de conférence

Les candidats doivent

• Avoir une excellente maîtrise récente en neurosciences, biologie moléculaire, bioinformatique ou dans des domaines connexes
• Être passionné par les sciences et très motivé
• Avoir une forte affection pour acquérir à la fois des connaissances biologiques et informatiques
• Être disposé à participer activement aux rencontres interdisciplinaires et autres activités du groupe de formation à la recherche Me In Bio
• Être à l’aise en anglais écrit et parlé

Veuillez adresser vos demandes de renseignements supplémentaires et vos documents de candidature au plus tard le 11 juin 2023 (CV, lettre de motivation, certificats de licence et de master et relevé de notes, noms de deux arbitres) à christine.hacker@anat.uni-freiburg.de