Bourse de doctorat en écologie microbienne marine – Espagne

Nous proposons un doctorat de 4 ans, à partir de début 2024, pour travailler sur l’écologie microbienne marine, au sein du projet CROSS-POINT : The e C ological R ole of the grow arre S t re SPO nse In mari N e bac T eria (PID2022-143213NB-I00), à réaliser à l’Institut des Sciences Marines de Barcelone, sous la direction de Marta Sebastián ( https://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0001- 7175-8941 ).

Sujet de recherche

Les communautés procaryotes marines jouent un rôle central dans le fonctionnement des écosystèmes océaniques et dans la résilience des océans au changement global. Ces communautés sont extrêmement diverses en termes de taxonomie, de capacités métaboliques et d’activités, et montrent une capacité remarquable à persister de plusieurs mois à plusieurs années face à des conditions défavorables en devenant dormantes (un état réversible de faible activité métabolique). Bien que plus de 40 % des cellules procaryotes de l’océan puissent être trouvées à l’état dormant, la réponse à l’arrêt de la croissance conduisant à la dormance et les stratégies de survie ont été à peine explorées chez les procaryotes marins.

Travaux proposés

Le doctorant générera des connaissances sur cette réponse à l’arrêt de la croissance en i) explorant les bases moléculaires de la dormance dans les métagénomes marins, ii) évaluant les stratégies de survie dans des isolats marins écologiquement pertinents et iii) mettant en lumière le rôle potentiel de la dormance en tant que mécanisme pour résister aux infections virales. Pour cela, le doctorant utilisera une approche multifacette combinant métagénomique, approches unicellulaires, transcriptomique et protéomique.

Le doctorant devra maîtriser l’utilisation d’Unix et R ou Python et acquérir une expertise sur le traitement bioinformatique des données de séquençage, ainsi que sur les techniques microbiologiques, moléculaires et de microscopie.

Le candidat sélectionné s’intégrera à l’Ecologie des Microbes Marins (EMM), qui est un groupe très dynamique et motivé, et à l’Association des Jeunes Chercheurs de l’ICM-CSIC, qui offre une opportunité idéale de réseautage entre jeunes scientifiques. La grande diversité des groupes et des sujets de recherche à l’ICM offrira également un environnement de recherche très fertile au doctorant. Le directeur de thèse maintient un engagement ferme à former les étudiants afin de garantir un maximum d’avantages d’apprentissage, y compris la participation à des cours et des conférences, des séjours dans d’autres laboratoires, des séminaires et d’autres stratégies de formation. Dans le cadre de sa formation, le doctorant suivra également des cours sur les compétences générales telles que l’écriture et la communication, y compris les compétences de diffusion et de sensibilisation.

Profil du candidat

Nous recherchons des candidats très motivés et titulaires d’un Master en sciences de l’environnement, sciences marines, biologie, microbiologie, bioinformatique, océanographie ou similaire. Une excellente maîtrise de l’anglais oral et écrit est une condition essentielle. Les candidats ayant des connaissances en R/Python, en outils bioinformatiques, ainsi qu’en laboratoire humide, en culture microbienne, moléculaire ou des compétences connexes seront privilégiés. La motivation pour apprendre et travailler en équipe, la capacité à résoudre des problèmes et un esprit curieux sont des conditions importantes.

Procédure de demande

Les candidatures peuvent être envoyées au plus tard le 30 ^septembre 2023 par courrier électronique à Marta Sebastián ( msebastian@icm.csic.es ) et doivent inclure :

• Un CV
• Une lettre de motivation.
• Les relevés de notes de vos diplômes de baccalauréat et de maîtrise*.

Les lettres de recommandation sont facultatives. Un contact préalable informel est également le bienvenu. Si vous êtes présélectionné, nous vous contacterons pour organiser un entretien par vidéoconférence.

* Si vous avez obtenu votre(vos) diplôme(s) en dehors de l’Espagne, vous devez être en mesure de fournir vos relevés de notes officiels en espagnol ou en anglais. Veuillez obtenir ces documents dès que possible car, si vous êtes présélectionné, il vous sera demandé de les télécharger via un formulaire de candidature.