Doctorant – Département de Biologie – Gand , Belgique

Date de dernière candidature 15 mai 2024 00:00

Département WE11 – Département de Biologie

Contrat Durée limitée

Diplôme Vous êtes titulaire d’un Master en Sciences dans le domaine de la Biologie, de la Biochimie et des Biotechnologies, ou Sciences de la Bio-ingénierie, acquis avant le 15 juillet 2024.

Taux d’occupation 100%

Type de poste vacant Personnel de recherche

Description de l’emploi

Nous avons une opportunité passionnante pour un doctorant très motivé d’optimiser les techniques d’édition du génome et d’étudier les mécanismes de capture du carbone dans l’algue verte Ulva. Le projet de doctorat fait partie d’un projet FWO ERC Runner-up (Starting Grant) issu des lignes de recherche existantes du Phycology Research Group et du Plant Genome Editing Group de l’Université de Gand sur la biologie fonctionnelle d’Ulva. Plus précisément, nous souhaitons comprendre les processus cellulaires qui permettent à Ulva compressa de contrôler la fixation du carbone. Pour y parvenir, nous devons d’abord élargir notre palette d’outils : nous sommes capables d’activer l’expression de gènes (gain de fonction), mais sommes limités par l’efficacité de la technologie permettant d’inhiber la fonction des gènes (perte de fonction). Ulva est actuellement la seule macroalgue où des mutants avec gain et perte de fonction peuvent être générés et un modèle émergent en biologie moléculaire.

Le chercheur doctorant sera chargé d’optimiser l’efficacité de l’édition ciblée du génome chez Ulva et de concevoir le premier écran CRISPR chez une algue. La mutagenèse CRISPR est possible dans Ulva, mais n’est actuellement pas efficace pour exécuter des écrans à grande échelle. Le chercheur doctorant augmentera l’efficacité de la mutagenèse CRISPR basée sur des vecteurs chez Ulva en utilisant un système de sélection établi et une vaste collection d’éléments constitutifs de vecteurs. L’effet de différentes architectures de vecteurs, applications CRISPR et conditions de culture sur l’efficacité de l’édition du génome sera évalué.

Les espèces d’Ulva ont les taux photosynthétiques les plus élevés au monde par zone et possèdent une combinaison de mécanismes de concentration de carbone (CCM) uniques qui permettent une absorption flexible du carbone inorganique de l’eau de mer environnante. Le projet FWO ERC Runner-up vise à lier la capacité d’Ulva à croître rapidement et à former des proliférations nuisibles avec sa fixation efficace du carbone. Pour atteindre cet objectif, le doctorant étudiera les régulateurs putatifs du CCM en utilisant des mutants à gain et à perte de fonction. Les mutants à gain de fonction (marquage génétique) permettront d’étudier la localisation des protéines et les interactions protéine-protéine, le phénotypage des mutants à perte de fonction révélera comment les défauts d’acquisition du carbone affectent la croissance des algues.

L’étudiant travaillera sur les sujets suivants, dans le but d’obtenir un doctorat en Sciences : Biologie de l’Université de Gand (UGent) :

• Culture d’algues et génotypage
• Clonage moléculaire
• Transformation stable à l’aide de plasmides vecteurs
• (Microscopie confocale
• Caractérisation fonctionnelle de gènes candidats à l’aide d’études de mutants
• Analyse du transcriptome
• Analyse des interactions protéine-protéine

Profil de l’emploi

• Vous êtes titulaire d’un Master en Sciences dans le domaine de la Biologie, de la Biochimie et des Biotechnologies, ou Sciences de la Bio-ingénierie, acquis avant le 15 juillet 2024.
• Vous effectuerez des recherches fondamentales dans les domaines de la biologie des algues et de la biologie fonctionnelle.
• Vous possédez les compétences nécessaires en laboratoire humide pour générer, organiser et analyser des collections d’algues vectorielles et transgéniques.
• Vous avez un esprit analytique et de résolution de problèmes, déterminé à surmonter les défis pratiques et techniques.
• Vous avez une attitude ouverte et collaborative envers les membres de l’équipe.
• Vous êtes disposé à participer à des conférences (inter)nationales et à maintenir des expériences en laboratoire.
• Vous êtes une personne motivée, travailleuse et engagée dans l’obtention d’un doctorat.
• Vous êtes disposé à contribuer à l’enseignement des cours pratiques de niveau master et à accompagner les étudiants en licence et en master dans leurs projets de thèse.
• Vous possédez de bonnes compétences en communication orale et écrite et parlez couramment l’anglais.

QUE POUVONS-NOUS VOUS OFFRIR

• Nous proposons un poste de doctorant à temps plein, composé d’une période initiale de 12 mois, qui – après une évaluation positive, sera prolongée jusqu’à un total maximum de 48 mois.
• Votre contrat débutera au plus tôt le 1er septembre 2024.
• Le montant de la bourse est de 100 % du salaire net d’un membre de l’AAP à situation familiale égale. Le montant de la bourse individuelle est déterminé par la Direction du Personnel et de l’Organisation en fonction de la situation familiale et de l’ancienneté. Une bourse qui répond aux conditions et critères du règlement des bourses doctorales est considérée comme exonérée d’impôt sur le revenu.  Cliquez ici pour plus d’informations sur nos échelles salariales
• Tous les collaborateurs de l’Université de Gand bénéficient d’un certain nombre d’avantages, tels qu’un large éventail de possibilités de formation et d’éducation, 36 jours de congés (sur une base annuelle pour un emploi à temps plein) complétés par des jours de pont fixes annuels, une indemnité vélo et des allocations écologiques. pièces justificatives.  Cliquez ici pour un aperçu complet de tous les avantages du personnel  (en néerlandais).

comment s’inscrire

Envoyez votre candidature à Jonas Blomme ( jonas.blomme@ugent.be ) avec comme sujet ‚ULVA PhD‘. Votre candidature doit comprendre les documents suivants :

• Votre CV
• votre lettre de motivation pour cette bourse de doctorat. Veuillez préciser pourquoi vous postulez spécifiquement pour ce sujet.
• un relevé de notes du diplôme requis avec tous les suppléments au diplôme (s’il est déjà en votre possession). Si vous disposez d’un diplôme étranger dans une langue autre que nos langues nationales (néerlandais, français ou allemand) ou l’anglais, veuillez ajouter une traduction dans l’une des langues mentionnées.
  • les coordonnées de deux références