Séquençage du génome Cours Bioinformatique Afrique 2023
jeunes
Juni 20, 2023
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Public visé:
Les candidats doivent être des scientifiques postdoctoraux, des doctorants seniors, des membres juniors du corps professoral ou des cliniciens / professionnels de la santé activement engagés ou sur le point de commencer des recherches impliquant l’analyse de données de séquençage de nouvelle génération. La priorité sera donnée aux candidats qui 1) ont actuellement ou auront bientôt des données expérimentales NGS à analyser 2) utiliseront les techniques bioinformatiques enseignées dans au moins deux des modules / domaines répertoriés dans le plan du programme dans leurs expériences 3) ont un clair plan/opportunité de diffuser les connaissances parmi leurs pairs. Nous encourageons les candidats à mettre en évidence ces domaines dans leur candidature.
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Objectifs d’apprentissage:
Après cet atelier, les participants devraient être en mesure de :
- Utiliser la ligne de commande Unix comme outil d’analyse de données
- Décrire les différents formats de fichiers de données NGS disponibles
- Effectuer une évaluation QC des données de séquençage à haut débit
- Expliquer les concepts algorithmiques derrière l’alignement de lecture, l’appel de variantes et la détection de variantes structurelles
- Effectuez un alignement de lecture, un appel de variante et une détection de variation structurelle à l’aide d’outils standard
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Job Features
Job Category | Stage et Formation |
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