Séquençage du génome Cours Bioinformatique Afrique 2023

International
Publicado hace 10 meses

Le séquençage est devenu un outil essentiel dans l’analyse génétique et génomique. Il est de plus en plus important pour les scientifiques expérimentaux d’acquérir les compétences bioinformatiques nécessaires pour analyser les grands volumes de données produits par les séquenceurs. Ce cours vise à doter les participants des compétences informatiques essentielles nécessaires pour commencer à analyser les données et appliquer certains des outils et ressources les plus couramment utilisés pour l’analyse des données de séquence.

Le programme couvre les principales technologies de séquençage, la théorie algorithmique et les principes de la bioinformatique, avec un fort accent sur les sessions de calcul pratiques utilisant des techniques et des outils d’analyse de séquence applicables à toute espèce ou taille de génome. Une variété d’applications seront couvertes depuis l’analyse post-séquençage, le contrôle qualité, l’alignement de référence et l’appel de variantes.

Le cours couvrira les sujets suivants :

• Introduction à Unix/Linux et aux flux de travail en cours d’exécution
• Introduction aux technologies de séquençage
• Prétraitement des données de séquençage et CQ
• Alignement sur les séquences de référence
• Appel et annotation de variantes

Public visé:

Les candidats doivent être des scientifiques postdoctoraux, des doctorants seniors, des membres juniors du corps professoral ou des cliniciens / professionnels de la santé activement engagés ou sur le point de commencer des recherches impliquant l’analyse de données de séquençage de nouvelle génération.La priorité sera donnée aux candidats qui 1) ont actuellement ou auront bientôt des données expérimentales NGS à analyser 2) utiliseront les techniques bioinformatiques enseignées dans au moins deux des modules / domaines répertoriés dans le plan du programme dans leurs expériences 3) ont un clair plan/opportunité de diffuser les connaissances parmi leurs pairs. Nous encourageons les candidats à mettre en évidence ces domaines dans leur candidature.

Objectifs d’apprentissage:

Après cet atelier, les participants devraient être en mesure de :
  • Utiliser la ligne de commande Unix comme outil d’analyse de données
  • Décrire les différents formats de fichiers de données NGS disponibles
  • Effectuer une évaluation QC des données de séquençage à haut débit
  • Expliquer les concepts algorithmiques derrière l’alignement de lecture, l’appel de variantes et la détection de variantes structurelles
  • Effectuez un alignement de lecture, un appel de variante et une détection de variation structurelle à l’aide d’outils standard

Si vous souhaitez postuler pour participer au cours en 2023,  veuillez suivre ce lien .

Les candidatures sont dues le: jeudi 29 juin 2023 à 23h59 CAT.
Aucune candidature tardive ne sera acceptée.

 (Pour plus d’informations sur le cours, consultez le site Web :   https://www.h3abionet.org/categories/event/course/genome-sequencing-bioinformatics-africa-gsb-africa-2023  ou le dépliant à droite)

Cliquez ici pour postuler maintenant!

Características del Puesto

Categoría de PuestoStage et Formation

Aplicar en linea

Check Also

Bourses du Labex GRAL-Université de Grenoble GRAL Master 2 2024-2025

Appel à candidatures étudiants. Année académique 2024-2025 Dans le cadre de l’ École doctorale Chimie Biologie Santé …