Stagiaires postdoctoraux en informatique – génomique unicellulaire dans le groupe Haniffa, Royaume-Uni

Le programme de génétique cellulaire est à la recherche de deux boursiers postdoctoraux en informatique pour soutenir le groupe Haniffa. Le programme est axé sur l’atlas cellulaire et vise à cartographier les tissus en combinant la transcriptomique unicellulaire, la génomique spatiale et les méthodologies informatiques pour construire des modèles tridimensionnels (3D) de transcriptome complet de cellules dans leur contexte tissulaire, avec l’ambition à long terme de construire un atlas 3D du corps entier à une résolution de cellule unique.

À propos de l’équipe :

Muzlifah Haniffa est une dermatologue pionnière dans les applications des technologies de génomique unicellulaire pour comprendre le développement humain, l’homéostasie tissulaire, l’immunité et la pathogenèse des maladies. Un objectif de recherche majeur de son laboratoire est de décoder le développement et la maturation fonctionnelle du système immunitaire humain et le développement de l’embryon entier. La recherche du groupe Haniffa dans le cadre du programme de génétique cellulaire applique des techniques perturbatrices de pointe de génomique unicellulaire et spatiale pour étudier le développement humain et les tissus adultes sains et malades.

À propos des rôles :

Poste 1 : Vous serez responsable de l’analyse de la génomique unicellulaire de grande taille, y compris des ensembles de données de génomique spatiale liés à la recherche sur l’Atlas des cellules humaines, afin de fournir des informations clés. Vous travaillerez en collaboration avec des biologistes de laboratoire humide générant les données, d’autres chercheurs, y compris des bioinformaticiens du groupe Haniffa, le programme de génétique cellulaire, y compris l’équipe informatique, l‘ EBI et des collaborateurs internationaux. Le poste sera financé pendant trois ans.

Poste 2 : Vous travaillerez sur un projet financé par CZI pour analyser la génomique unicellulaire de grande taille, y compris les données de génomique spatiale de la peau pédiatrique. Vous travaillerez en collaboration avec des biologistes de laboratoire humide et des bioinformaticiens au sein du programme de génétique cellulaire à Sanger et des chercheurs de QMULet l’Université de Newcastle. Le poste sera financé pendant trois ans.

À propos de vous :

Vous comprenez les concepts clés de la génomique, du traitement des données et de l’analyse des données à haut débit. Vous aurez idéalement une expérience dans la gestion et l’analyse de très grands ensembles de données, en utilisant ou en développant des méthodes statistiques / d’apprentissage automatique pour l’analyse d’ensembles de données à grande échelle. Vous travaillez efficacement au sein d’une équipe et de manière autonome. Vous organisez également la charge de travail et communiquez de manière adéquate.

En tant que stagiaire postdoctoral du programme de génétique cellulaire, vous rejoindrez un environnement collaboratif et de pointe. Le programme encourage tout le monde à réseauter et à présenter ses recherches, y compris lors de notre série de séminaires hebdomadaires. En plus du soutien des principaux domaines Sanger des opérations scientifiques, des opérations de gestion et des TIC , au sein du programme, les équipes des opérations de génétique cellulaire fournissent un soutien multidisciplinaire complet pour aider à tout, depuis le traitement des échantillons, la fourniture de pipelines d’analyse, jusqu’à l’assistance aux demandes de bourse. Le Sanger Institute prend également en charge les PDF en offrant diverses opportunités de formation, des opportunités de réseautage et a mis en place un comité PDF pour s’assurer que nos PDF sont pris en charge tout au long de leurs publications.

Compétences essentielles :

Un doctorat en biologie computationnelle, en bioinformatique, en biostatistique ou dans une discipline scientifique connexe
Compréhension et expérience dans les domaines de la génomique, du traitement de données et de l’analyse de données à haut débit
Vaste expérience dans un environnement de recherche avec un bilan établi de productivité
Maîtrise d’un ou plus de langages de script (C/C++, R, python)
Compétences et comportements

Excellentes capacités de communication et d’organisation
Style de travail indépendant éprouvé, résolution de problèmes techniques, analyse de données et génération d’idées nouvelles
Motivation et ambition d’apporter une contribution personnelle à la recherche GRL
Capacité avérée à travailler efficacement au sein d’une équipe
Capacité à effectuer plusieurs tâches à la fois et à organiser sa propre charge de travail
Bonne attention aux détails et à la tenue de dossiers Fait preuve d‘
inclusivité et de respect pour tous et dans le profil de rôle ci-joint.