POSITION POSTDOCTORALE — DÉPARTEMENT D’UROLOGIE – BOSTON CHILDREN’S HOSPITAL ET HARVARD MEDICAL SCHOOL, États-Unis

Un poste postdoctoral est ouvert dans le programme de recherche en urologie du Boston Children’s Hospital et de la Harvard Medical School en collaboration avec les laboratoires Lee et Adam. Le laboratoire Lee étudie le protéome urinaire pour identifier de nouveaux marqueurs cliniquement pertinents de la maladie urologique, en particulier les lésions rénales, les infections des voies urinaires et le dysfonctionnement de la vessie. Le laboratoire Adam se concentre sur les mécanismes moléculaires qui sous-tendent le remodelage tissulaire des voies urinaires en réponse à une blessure. Les projets pour ce poste se concentreront sur l’interrogation de protéines urinaires spécifiques identifiées comme des biomarqueurs potentiels de la détérioration de la vessie et des lésions rénales dans le contexte de l’obstruction des voies urinaires et sur la détermination de leur importance biologique. Les candidats seront responsables de divers aspects de la protéomique et des expériences biochimiques, de la préparation des échantillons à l’analyse des données. Ces projets nécessiteront une expérience en spectrométrie de masse, en modifications de protéines et en bioinformatique, y compris une connaissance pratique de LC-Opération ESI -MS/MS et HPLC , ainsi qu’une expérience dans l’analyse de grands ensembles de données. Des intérêts supplémentaires en glycobiologie, glycoprotéomique ou biologie cellulaire sont préférés, mais pas nécessaires. Le Boston Children’s Hospital est l’hôpital d’enseignement pédiatrique de la Harvard Medical School et offre un environnement riche pour la recherche translationnelle. Les personnes ayant une expérience appropriée des groupes sous-représentés sont fortement encouragées à postuler.

Les candidats intéressés doivent envoyer leur CV et un résumé d’une page du contexte et des objectifs de recherche à :

Nicolas Fisher

Administrateur principal de la recherche

Département d’urologie

Hôpital pour enfants de Boston

300, avenue Longwood Boston, MA 02115

Nicholas.fisher@childrens.harvard.edu

Rosalyn Adam, Ph. D.

Professeur agrégé de chirurgie (urologie), Harvard Medical School

Directeur de la recherche fondamentale en urologie

Département d’urologie

Hôpital pour enfants de Boston

Richard S. Lee, MD

Professeur agrégé de chirurgie (urologie), Harvard Medical School

Vice-président, Recherche

Département d’urologie

Hôpital pour enfants de Boston

Documents d’intérêt sélectionnés :

Vaezzadeh AR, Briscoe AC, Steen H, Lee RS . Méthode de concentration, de purification et d’épuisement de l’albumine en une étape pour la protéomique urinaire. J Proteome Res. 2010;9(11):6082-9

Zhou H, Briscoe AC, Froehlich JW, Lee RS . Dé-N-glycosylation catalysée par la PNGase F dans un four à micro-ondes domestique. Biochimie anale. 1 août 2012;427(1):33-5.

Froehlich JW, Dodds ED, Wilhelm M, Serang O, Steen JA, Lee RS . Un Classificateur Basé Sur Des Mesures De Masse Précises Pour Aider La Glycoprotéomique Impartiale À Grande échelle. Protéomique des cellules Mol. avril 2013;12(4):1017-25.

Zhou H, Froehlich JW, Briscoe AC, Lee RS . Le GlycoFilter : une plate-forme de préparation d’échantillons simple et complète pour la protéomique, la N-glycomique et l’attribution de sites de glycosylation. Protéomique des cellules Mol. 2013;12(10):2981-91.

Zhou H, Warren PG, Froehlich JW, Lee RS . Stratégie de double modification pour quantifier simultanément les N-glycanes neutres et sialylés par MALDI – MS. Chimie anale. 2014;86(13):6277-84.

Zhou H, Morley S, Kostel S, Freeman MR, Joshi V, Brewster D, Lee RS . Préparation d’échantillons réversible en phase solide universelle pour la caractérisation simultanée du protéome et du N-glycome. J Proteome Res. 4 mars 2016;15(3):891-9.

Froehlich JW, Kostel SA, Cho PS, Briscoe AC, Steen H, Vaezzadeh AR, Lee RS . La protéomique urinaire donne des informations pathologiques sur l’obstruction de la jonction urétéro-pelvienne. Protéomique des cellules Mol. 2016 août;15(8):2607-15.

Dagher A, Curatolo A, Sachdev M, Stephens AJ, Mullins C, Landis JR, van Bokhoven A, El-Hayek A, Froehlich JW, Briscoe AC, Roy R, Yang J, Pontari MA, Zurakowski D, Lee RS* , Moïse MA* ; Réseau de recherche MAPP . Identification de nouveaux biomarqueurs non invasifs du syndrome de douleur pelvienne chronique urinaire : résultats du Réseau de recherche sur l’approche multidisciplinaire pour l’étude de la douleur pelvienne chronique ( MAPP ). BJU Int. juillet 2017;120(1):130-142. PMID : 28263447 PMCID : PMC5951631 *contribution égale .

Woodworth DC, Dagher A, Curatolo A, Sachdev M, Ashe-McNalley C, Naliboff BD, Labus JS, Landis JR, Kutch JJ, Mullins C, Mayer EA, Moses MA*, Ellingson BM*, Lee RS . Des changements dans la structure de la substance blanche du cerveau sont associés aux protéines urinaires dans le syndrome de douleur pelvienne chronique urologique ( UCPPS ): A MAPP Network Study. PLoS One. 5 décembre 2018 ; 13(12). PMID : 30517112 ; PMCID : PMC6281196.apport égal.

Vitko D, Cho PS, Kostel SA, DiMartino SE, Cabour LD, Migliozzi MA, Logvinenko T, Warren PG, Froehlich JW, Lee RS . Caractérisation des patients atteints d’infections récurrentes des voies urinaires dans le reflux vésico-urétéral : une étude pilote du protéome urinaire. Protéomique des cellules Mol. 2020 mars;19(3):456-466. doi : 10.1074/mcp.RA119.001873. Publication en ligne le 2 janvier 2020. PMID : 31896675 ; PMCID : PMC7050111.

Li H, Patel V, DiMartino SE, Froehlich JW, Lee RS . Une comparaison approfondie des N-glycomes urinaires pédiatriques et adultes. Protéomique des cellules Mol. 2020 novembre;19(11):1767-1776. PMID : 32737218 ; PMCID : PMC7664126.

Roy R, Stephens AJ, Daisy C, Merritt L, Newcomb CW, Yang J, Dagher A, Curatolo A, Sachdev M, McNeish B, Landis R, van Bokhoven A, El-Hayek A, Froehlich J, Pontari MA, Zurakowski D , Lee RS , Moïse MA . Association des changements longitudinaux des symptômes et des biomarqueurs urinaires chez les patients atteints du syndrome de douleur pelvienne chronique urologique : une étude du réseau de recherche MAPP . J Urol. 2021 février;205(2):514-523. PMID : 33026902 ; PMCID : PMC8139408. *cotisation égale

Li H, Kostel SA, DiMartino SE, Hashemi Gheinani A, Froehlich JW, Lee RS . Isolement de l’uromoduline et analyse de sa N -glycosylation par NanoLC-MS/MS. J Proteome Res. 2 mars 2021. doi : 10.1021/acs.jproteome.0c01053. Epub avant impression. PMID : 33650863.

Vitko D, McQuaid JW, Gheinani AH, Hasegawa K, DiMartino S, Davis KH, Chung CY, Petrosino JF, Adam RM, Mansbach JM, Lee RS . Les infections des voies urinaires chez les enfants atteints de reflux vésico-urétéral s’accompagnent d’altérations du microbiote urinaire et des profils du métabolome. Eur Urol. 17 sept. 2021 :S0302-2838(21)01990-4. doi: 10.1016/j.eururo.2021.08.022. Epub avant impression. PMID : 34538688.

Yang W, Ramachandran A, You S, Jeong HB, Morley S, Mulone MD, Logvinenko T, Kim J, Hwang D, Freeman MR et Adam RM. (2014) L’intégration des profils protéomiques et transcriptomiques identifie un nouveau réseau PDGF – MYC dans les cellules musculaires lisses humaines. Signal de communication cellulaire 12 (1) : 44.

Gheinani AH, Kock I, Vasquez E, Baumgartner U, Bigger-Allen A, Sack BS, Burkhard FC, Adam RM et Monastyrskaya K (2018) Profils d’expression concordants de miARN et d’ARNm chez l’homme et la souris présentant une obstruction de la sortie de la vessie. Am J Clin Exp Urol 6(6): 219-233.

Hashemi Gheinani A, Bigger-Allen A, Wacker A et Adam RM. (2020) Analyse systémique des troubles bénins de la vessie : aperçus de l’analyse des omiques. Am J Physiol Renal Physiol 318(4): F901-F910.