Chercheur postdoctoral en microbiologie et génomique (22817) – Pathologie, bactériologie et maladies des volailles – Gand , Belgique

→ Postuler avant le 31/03/2022 (JJ/MM/AAAA) 23:59 (Heure de Bruxelles)
   → Faculté de Médecine Vétérinaire  
   → Département : DI05 – Pathobiologie, Farmacologie en Bijzondere Dieren
   → Taux d’occupation : 100%
   → Nombre de postes : 1    
   → Type d’emploi : Contrat à durée déterminée 
   → Durée de la mission : 2 ans 
   → Échelle salariale : PD1 à PD4 (doctorat) 
   → Diplôme requis : PhD 

L’équipe de santé intestinale du bétail (LiGHT) de Gand, au sein du département de pathobiologie, pharmacologie et médecine zoologique, recrute actuellement un chercheur postdoctoral enthousiaste et très motivé pour travailler sur un projet de recherche sur la «technologie des polymères à empreinte de surface et le séquençage des nanopores pour le point de analyse microbienne des aliments de soin – SIPORE ».

À PROPOS DU PROJET

Le projet SIPORE comprend l’étude de deux technologies de point de service, les biocapteurs à base de polymères à empreinte de surface (SIP) et le séquençage des nanopores, qui peuvent être utilisées pour la détection et la caractérisation des pathogènes bactériens d’origine alimentaire avec des caractéristiques de performance suffisantes pour de futures applications sur le terrain. Ce projet sera réalisé en collaboration avec la KU Leuven, l’Institut flamand de recherche pour l’agriculture, la pêche et l’alimentation (ILVO) et Flander Food.
L’objectif du projet est (1) d’optimiser et de valider le biocapteur SIP pour des organismes cibles spécifiques, (2) d’acquérir des connaissances sur le pouvoir discriminant et la reproductibilité du séquençage des nanopores MinION pour la caractérisation des pathogènes cibles au niveau des sous-espèces par rapport à Illumina séquençage, et (3) pour explorer l’utilisation des biocapteurs SIP comme étape initiale de dépistage et de sélection pour l’analyse de typage MinION en aval.
Au sein de l’équipe de santé intestinale du bétail (LiGHT) de Gand, nous nous concentrerons sur la détection de Salmonella au point de service. Les problèmes de Salmonella peuvent survenir dans tous les segments de la chaîne alimentaire de la volaille. L’infection peut se produire pendant la production de matières premières jusqu’à la production d’animaux vivants. Les œufs et la viande de volaille sont les principales sources de salmonellose humaine d’origine alimentaire dans le monde.

À PROPOS DE L’UNIVERSITÉ DE GAND

L’Université de Gand est un monde à part. Employant plus de 8 000 personnes, elle s’implique activement dans l’enseignement et la recherche, la gestion et l’administration, ainsi que dans l’offre de services techniques et sociaux au quotidien. C’est l’un des employeurs les plus importants et les plus passionnants de la région et offre d’excellentes opportunités de carrière. Avec ses 11 facultés et plus de 80 départements offrant des programmes d’études de pointe fondés sur la recherche dans un large éventail de domaines académiques, l’Université de Gand est un choix logique pour son personnel et ses étudiants.

VOS TÂCHES

– Vous rejoindrez l’équipe de santé intestinale du bétail (LiGHT) de Gand et travaillerez de manière indépendante sur le projet de recherche pour effectuer les validations en laboratoire du biocapteur SIP pour des organismes cibles spécifiques (Salmonella), effectuer l’analyse comparative du séquençage Illumina vs. MinION pour Salmonella inclus de développement des pipelines bio-informatiques nécessaires et testera le couplage du SIP avec le flux de travail MinION pour Salmonella (fournissant une combinaison unique de travail en laboratoire humide et en laboratoire sec)
– Vous soutiendrez le groupe de recherche grâce à la bioinformatique et à l’analyse statistique de grands ensembles de données à l’échelle NGS sur divers projets au sein du groupe de recherche
– Encadrement d’étudiants en master et de doctorants

CE QUE NOUS RECHERCHONS

– Vous êtes titulaire d’un doctorat avec thèse. De préférence un doctorat en sciences biologiques, y compris les sciences animales, les sciences vétérinaires, la bio-ingénierie ou des disciplines connexes
– Excellentes compétences en communication et maîtrise de l’anglais
– Très motivé et esprit d’équipe
– Vous êtes motivé à explorer les questions de recherche de manière indépendante et approfondie
– Vous avez un intérêt particulier pour la microbiologie
– Écriture scientifique démontrée par le biais de publications de haute qualité
– Connaissance des langages de programmation tels que R (y compris RMarkdown) ou Python
– Familier avec l’environnement Linux/Unix et la gestion de grands ensembles de données
– Une solide expérience dans l’analyse de données NGS (séquençage nanopore et Illumina) est un plus

CE QUE NOUS POUVONS VOUS PROPOSER
– Nous vous proposons un contrat à durée déterminée de 24 mois (plein temps, 100%) Votre contrat débutera au plus tôt le 1/05/2022.
– Votre rémunération sera déterminée par l’échelle salariale PD1 à PD4 (si vous êtes titulaire d’un doctorat). Cliquez ici pour plus d’informations sur nos échelles salariales.
– Tous les membres du personnel de l’Université de Gand bénéficient d’un certain nombre d’avantages, tels qu’un large éventail de possibilités de formation et d’éducation, 36 jours de vacances (sur une base annuelle pour un emploi à temps plein) complétés par des jours de pont fixes annuels, une allocation vélo et éco-chèques. Cliquez ici pour un aperçu complet de tous les avantages du personnel (en néerlandais).
– Travailler dans un environnement agréable avec une équipe jeune et dynamique de l’Université de Gand en étroite collaboration avec la KU Leuven et l’Institut de recherche flamand pour l’agriculture, la pêche et l’alimentation (ILVO)

INTÉRESSÉ?

Postulez en ligne via le système de recrutement en ligne avant la date limite de candidature (voir ci-dessus). Nous n’acceptons pas les candidatures tardives ou les candidatures qui ne sont pas soumises via le système en ligne.

Votre candidature doit comprendre les documents suivants :

– Dans le champ ‘CV’ : votre CV
– Dans le champ ‘Lettre de motivation’ : votre lettre de motivation au format pdf
– Dans le champ ‘Diplôme’ : un relevé de notes du diplôme requis. Si vous avez un diplôme étranger dans une langue autre que nos langues nationales (néerlandais, français ou allemand) ou l’anglais, veuillez ajouter une traduction dans l’une des langues mentionnées.

Notez que la taille de fichier maximale pour chaque champ est de 10 Mo.

Comme l’Université de Gand maintient une politique d’égalité des chances et de diversité, tout le monde est encouragé à postuler pour ce poste.

PLUS D’INFORMATION

Pour plus d’informations sur cette offre d’emploi, veuillez contacter le Prof. Gunther Antonissen ( Gunther.Antonissen@ugent.be ). Important : n’envoyez PAS votre candidature par e-mail, mais postulez en ligne.