2 bourses de doctorat en protéomique basée sur la SEP Université de Copenhague (UCPH)

Nous proposons deux bourses de doctorat de 3 ans dans le groupe Nielsen au Centre de recherche sur les protéines de la Fondation Novo Nordisk, Département de santé publique, Université de Copenhague, à compter du 1er septembre 2022 ou dès que possible par la suite.

Notre groupe et nos recherches
Vous travaillerez dans le groupe du professeur Dr. Michael L. Nielsen au Centre de recherche sur les protéines de la Fondation Novo Nordisk ( CPR – www.cpr.ku.dk ). Le centre a été créé à la Faculté des sciences de la santé et des sciences médicales de l’Université de Copenhague pour promouvoir la recherche fondamentale et appliquée sur les protéines humaines d’intérêt médical. Le centre comprend un large éventail d’expertises et de ressources, notamment la protéomique, la production de protéines et la caractérisation des mécanismes de la maladie.

Le groupe Nielsen se concentre sur le développement et l’application de nouvelles technologies protéomiques pour détailler les résultats cellulaires dans une approche au niveau des systèmes, dans le but d’améliorer la compréhension actuelle des phénotypes cellulaires et des maladies. À cette fin, le candidat sélectionné utilisera ou améliorera les stratégies de pointe actuelles basées sur la spectrométrie de masse (MS) pour l’identification et la quantification des modifications post-traductionnelles (PTM).

Pour plus d’informations sur le groupe de recherche, veuillez visiter:
http://www.cpr.ku.dk/nielsen/

Focus des projets de doctorat disponibles
Les projets de doctorat actuellement disponibles dans le laboratoire Nielsen se concentreront sur l’un des domaines de recherche suivants liés à l’utilisation de technologies protéomiques de pointe pour la caractérisation dynamique et temporelle des PTM. Les candidats postulant au poste doivent idéalement indiquer le domaine de recherche qui les intéresse :

•  Projet de doctorat 1 – Développement de méthodes : notre laboratoire a été le pionnier de la méthodologie MS de pointe pour l’étude impartiale et systémique de l’ ADP -ribosylation, et une grande partie des connaissances protéomiques contemporaines dans le domaine ont été générées dans notre laboratoire. Néanmoins, il existe des obstacles techniques à surmonter en ce qui concerne la préparation des échantillons et le développement de méthodes techniques MS, et l’analyse et la stratification des données générées pourraient être encore améliorées. Le candidat idéal devrait évaluer la méthodologie actuelle afin de l’améliorer ou intégrer systématiquement les données MS actuellement disponibles afin de fournir un aperçu complet ou d’effectuer une méta-analyse.
• Projet de doctorat 2 – Application de la méthode : l’ ADP -ribosylation est devenue un PTM vital dans de nombreux processus cellulaires, notamment la transcription, les dommages à l’ADN , la modulation de la chromatine, le traitement de l’ARN , la métabolomique, la localisation des protéines et bien d’autres. Pour la majorité des enzymes PARP , leurs rôles biologiques restent énigmatiques et l’analyse de leurs implications fonctionnelles par la protéomique basée sur la SEP aidera à cette compréhension. Le candidat idéal devrait donc étudier les rôles cellulaires de l’ ADP -ribosylation et des enzymes PARP afin d’améliorer la compréhension actuelle de la biologie PARP .
•  Projet de doctorat 3 – Application de la méthode : Le laboratoire Nielsen a développé la première stratégie protéomique pour les études au niveau des systèmes de la SUMOylation spécifique au site, endogène et native, qui peut être appliquée à n’importe quel type d’échantillon de tous les eucaryotes supérieurs. Dans ce projet, le candidat travaillera sur l’utilisation des stratégies SUMO -protéomique pour démêler le rôle de la voie SUMOylation dans le contexte de la santé et de la maladie.

Le superviseur principal est le professeur Dr Michael L. Nielsen, CPR , michael.lund.nielsen@cpr.ku.dk

Début :                  1er septembre 2022

Durée :          3 ans en tant que doctorant

Qualifications

• Les candidats doivent avoir une maîtrise en biochimie, biologie moléculaire, sciences naturelles, bioinformatique ou similaire avant de commencer
• Une aptitude analytique à concevoir des solutions scientifiques ou techniques innovantes
• Une expérience antérieure dans des domaines de recherche liés à l’ ADP -ribosylation ou à la biologie PARP serait un avantage distinct
• Des connaissances dans un ou plusieurs des domaines suivants seraient considérées comme un avantage : biologie moléculaire et cellulaire, signalisation cellulaire, biologie de la chromatine, protéomique ou biologie des systèmes
• Une expérience préalable en spectrométrie de masse à haute résolution n’est pas essentielle, mais serait considérée comme un avantage
• Des connaissances en bioinformatique et en analyse de données à grande échelle, ainsi que des compétences dans un environnement de calcul statistique tel que R et Python seront considérées comme un avantage distinct, mais pas comme une exigence
• Bonnes compétences en communication, tant à l’oral qu’à l’écrit
• Une forte motivation et d’excellentes compétences scientifiques sont essentielles
• La capacité de mener des recherches indépendantes et créatives, de démontrer une productivité scientifique et de faire preuve de bonnes compétences interpersonnelles et de communication.

Lieu de travail
L’emploi est au CPR ( www.cpr.ku.dk ), Université de Copenhague, situé dans le centre de Copenhague. L’environnement de recherche au CPR est dynamique, ambitieux et international, avec env. 30 nationalités différentes actuellement représentées. Le Centre comprend des laboratoires modernes et des installations de pointe dans le domaine de la science des protéines. Des séminaires avec des conférenciers internationaux de haut niveau et des séminaires de recherche internes réguliers sont organisés au Centre.

Conditions de salaire et d’emploi
La durée hebdomadaire moyenne de travail est de 37 heures par semaine.

Le poste est un poste à durée déterminée limité à une durée de 3 ans. La date de début est le 1er septembre 2022 ou après accord.

L’emploi est conditionné à la réussite de l’inscription du candidat en tant que doctorant à la Graduate School de la Faculté des sciences de la santé et de la médecine de l’Université de Copenhague. Cela nécessite la soumission et l’acceptation d’une candidature pour le projet spécifique formulé par le candidat.
L’étude doctorale doit être complétée conformément à l’arrêté ministériel sur le programme de doctorat (2013) et aux règles de la Faculté sur l’obtention du diplôme.

Le salaire, la pension et les conditions d’emploi sont conformes à l’accord entre le ministère des Finances et la Confédération danoise des associations professionnelles des universitaires de l’État. Selon l’ancienneté, le salaire mensuel commence à environ 28 300 DKK / Environ 3 800 EUR(niveau d’avril 2022) plus pension.

Questions
Pour des informations spécifiques sur la bourse de doctorat, veuillez contacter le directeur de thèse principal.

Des informations générales sur les études de doctorat à la Faculté des sciences de la santé et de la médecine sont disponibles sur le site Web de la Graduate School: https://healthsciences.ku.dk/phd/guidelines/

Procédure de
candidature Votre candidature doit être soumise par voie électronique en cliquant sur « Postuler maintenant » ci-dessous . La demande doit comprendre les documents suivants au format PDF :

1. Lettre de candidature motivée (max. une page)
2. CV incl. formation, expérience, compétences linguistiques et autres compétences pertinentes pour le poste
3. Copie certifiée conforme du diplôme original de maîtrise en sciences et relevé de notes dans la langue d’origine, y compris une traduction anglaise autorisée si elle est délivrée dans une autre langue que l’anglais ou le danois. S’il n’est pas rempli, une copie certifiée / signée d’un relevé de notes récent ou une déclaration écrite de l’établissement ou du superviseur est acceptée. En tant que condition préalable à l’emploi d’une bourse de doctorat, votre maîtrise doit être équivalente à une maîtrise danoise. Nous vous encourageons à en savoir plus dans la base de données d’évaluation : https://ufm.dk/en/education/recognition-and-transparency/find-assessments/assessment-database . Veuillez noter que nous pourrions vous demander d’obtenir une évaluation de votre formation effectuée par le ministère de l’Enseignement supérieur et de la Science
4. Liste des publications (si possible)

Date limite de candidature :  4 mai 2022, 23h59 CET

Nous nous réservons le droit de ne pas prendre en compte les documents reçus après la date limite et de ne pas prendre en compte les candidatures qui ne répondent pas aux exigences susmentionnées.

La suite du processus
Après l’expiration du délai de dépôt des candidatures, le responsable du recrutement agréé sélectionne les candidats à évaluer sur avis du comité de recrutement. Tous les candidats sont alors immédiatement informés si leur candidature a été acceptée pour évaluation par un évaluateur impartial.
L’évaluateur procède à une évaluation non prioritaire des qualifications académiques et de l’expérience par rapport au domaine de recherche susmentionné, aux techniques, aux compétences et aux autres exigences énumérées dans l’annonce.

Une fois le travail d’évaluation terminé, chaque candidat a la possibilité de commenter la partie de l’évaluation qui le concerne lui-même.

Vous pouvez trouver des informations sur le processus de recrutement sur : http://employment.ku.dk/faculty/recruitment-process/

Les candidats seront évalués conformément à l’arrêté ministériel no. 242 du 13 mars 2012 sur la nomination du personnel académique dans les universités.

L’Université de Copenhague souhaite refléter la diversité de la société et encourager tous les candidats qualifiés à postuler indépendamment de leurs antécédents personnels. 

Membre de l’Alliance internationale des universités de recherche ( IARU ) et parmi les meilleures universités européennes, l’Université de Copenhague promeut la recherche et l’enseignement au plus haut niveau international. Riche en tradition et moderne dans ses perspectives, l’Université donne aux étudiants et au personnel la possibilité de cultiver leur talent dans un environnement ambitieux et informel. Une organisation efficace – avec de bonnes conditions de travail et une culture de travail collaborative – crée le cadre idéal pour une carrière académique réussie.