Postdoc computationnel : génomique régulatrice unicellulaire du cerveau humain – Institut flamand de biotechnologie (VIB)

Le VIB -KU Leuven Center for Brain & Disease Research fait partie du VIB Life Sciences Institute et est intégré à l’Université de Louvain, qui figure parmi les 50 meilleures universités du monde. Dans notre Centre, plus de 300 chercheurs étudient les mécanismes de base du système nerveux central et les maladies associées.

Le Stein Aerts Lab ( www.aertslab.org ) recherche un post-doctorant en informatique. Notre équipe travaille sur la génomique unicellulaire et la régulation des gènes, en combinant de nouvelles technologies unicellulaires et spatiales avec la bioinformatique et l’apprentissage automatique. Dans ce projet, le candidat développera de nouvelles stratégies informatiques pour identifier la variation génétique humaine liée aux changements d’état des cellules dans le cerveau humain, en mettant particulièrement l’accent sur les régions cérébrales affectées par la maladie de Parkinson. Le candidat peut utiliser et combiner l’ ATAC unicellulaire -seq, l’ ARN unicellulaire-seq, l’expression spatiale des gènes et les données de séquençage du génome entier (avec de longues lectures). Le candidat aura l’opportunité d’explorer de nouvelles méthodes d’analyse en utilisant l’apprentissage en profondeur. En fonction de l’intérêt, il est également possible d’être impliqué dans le wet-lab, pour réaliser des expériences de séquençage monocellulaire.

Profil

• Vous avez obtenu un doctorat en bioinformatique, informatique, physique, ingénierie, bio-ingénierie ou l’équivalent.
• Excellente expérience en bioinformatique (par exemple, GitHub ou publications dans des revues informatiques)
• Une expérience en programmation est requise (Python, R).
• Une expérience avec l’apprentissage automatique est un plus (par exemple, Tensorflow/Keras/PyTorch).
• Une expérience avec les conteneurs logiciels et/ou NextFlow est un plus.
• Capacité à travailler de façon autonome et en équipe.

Nous offrons

• Accès à une infrastructure informatique de pointe
• Un environnement de recherche international stimulant
• Salaire et avantages sociaux compétitifs
• Soutien financier pendant au moins 2 ans. Le candidat retenu est encouragé à obtenir une bourse personnelle (Marie-Curie, HFSP , EMBO ou organismes de financement nationaux)

Date de début : dès que possible

Comment s’inscrire?

Veuillez compléter la procédure de candidature en ligne et inclure un CV détaillé, deux lettres de référence et une lettre de motivation.

Pour plus d’informations : stein.aerts@kuleuven.be