زمالة ما بعد الدكتوراه: البيولوجيا الحسابية المكانية وحيدة الخلية لعلم الأورام الدقيق

EMBL هو المختبر الرائد في أوروبا لعلوم الحياة – منظمة حكومية دولية تضم أكثر من 110 مجموعة بحثية مستقلة وفرق خدمة تغطي طيف البيولوجيا الجزيئية. تعمل عبر ستة مواقع في هايدلبرغ (المقر الرئيسي) ، برشلونة ، كامبريدج ، غرونوبل ، هامبورغ وروما. مهمتنا هي إجراء البحوث الأساسية في علم الأحياء الجزيئي. تدريب العلماء والطلاب والزوار على جميع المستويات ؛ تقديم خدمات حيوية للعلماء في القطاعين العام والخاص داخل الدول الأعضاء ؛ تطوير أدوات وطرق جديدة ؛ والمشاركة بنشاط في نقل التكنولوجيا.

حول المشروع:  تعد إعادة توجيه الخلايا التائية الذاتية من خلال الأجسام المضادة ثنائية الخصوصية (BsAb) مبدأ علاجيًا مهمًا لعلاج الأورام اللمفاوية للخلايا البائية. تختلف استجابات العلاج بشدة بين المرضى. هناك حاجة طبية ملحة لفهم أفضل لآليات المقاومة ، والمؤشرات الحيوية لتوقع الاستجابة ، والأهداف التجميعية لتحسين الاستجابة. كل من الورم الجوهري ، على سبيل المثال التغيرات الجينية والتخلقية ، والعوامل الخارجية ، مثل التركيب والحالة الوظيفية للبيئة المكروية للعقدة الليمفاوية ، مهمة.

نقوم بتطبيق omics و التحليل المكاني الحديث لخلية واحدة (بما في ذلك CITE-Seq والكيمياء المناعية عالية التعدد) لتوصيف الأورام وبيئاتها الدقيقة ضمن دراسة سريرية مستقبلية للمرضى المعالجين بـ BSAbs. يتم هذا العمل ضمن مشروع Transcan-3 للأجسام المضادة ثنائية الخصوصية في سرطان الغدد الليمفاوية: التنميط المكروبيئي للتنبؤ باستجابة العلاج والكشف عن آليات المقاومة المناعية (BIALYMP). يجمع هذا التعاون الدولي بين مجموعات البحث في مجال التكنولوجيا الحيوية والحاسوبية وأخصائيي الأورام السريريين ويتم تنسيقه بواسطة Wolfgang Huber (EMBL).

نحن نبحث عن عالم أحياء حسابي / متخصص في المعلومات الحيوية سيجمع بين أبحاث الاكتشاف البيولوجي المعتمدة على البيانات ، وتطوير الطريقة الحسابية أو الإحصائية المطلوبة ، والإدارة المركزية والتحليل التكاملي لبيانات البحث. يوفر المنصب فرصًا ممتازة لاستكمال مهاراتك الحالية بمهارات جديدة ، وبناء ملفك البحثي في ​​البيولوجيا الحاسوبية والطب الحيوي ، وتقديم مساهمة حقيقية في تحسين نتائج المرضى.

عن الفريق:تقوم مجموعة البحث من Wolfgang Huber في EMBL بتطوير تحليل البيانات الإحصائية وطرق التعلم الآلي للتقنيات الحيوية الحديثة ، وتطبيقها على الاكتشاف البيولوجي والطب الحيوي ، وترجمتها إلى أدوات قابلة لإعادة الاستخدام من خلال الانخراط في مجتمعات البرمجيات مفتوحة المصدر. يتمتع الفريق متعدد التخصصات والدولي بتعاون قوي مع الباحثين في مجال السرطان وعلم الأحياء التنموي. يستخدمون أحدث البيانات التجريبية لاكتشاف وفهم العمليات البيولوجية ولتطوير تطبيقات طبية حيوية جديدة.

دورك

ستشارك في مشروع BIALYMP الشامل وتشكل ملف البحث الخاص بك في واحد أو أكثر من المجالات التالية. يسمح إعداد المشروع ببعض المرونة في تخصيص المسؤوليات وفقًا للمؤهلات والاهتمامات.

• تحليل واكتشاف البيانات:
• قم بتطوير سير عمل تحليل البيانات الشامل باستخدام أنظمة R / Bioconductor و / أو النظم الإيكولوجية لبرامج Python للمعلومات الحيوية والإحصاءات والتعلم الآلي.
• اكتشف رؤى جديدة ومثيرة من البيانات ، غالبًا بالتعاون مع خبراء المجال الطبي الحيوي.
• تطوير الطريقة والمعايير:
• اختبار وقياس تحليل البيانات وحيدة الخلية الموجودة والأساليب الإحصائية.
• قم بتحسين الأساليب لاحتياجاتك أو تطوير مناهج جديدة.
• إدارة البيانات: قم بإعداد مساحات تخزين البيانات المشتركة وإدارة البيانات الوصفية التي تدعم العمل التعاوني والتحليلات عالية الطاقة والتصور وممارسات العلوم المفتوحة مثل بيانات FAIR ونشر البرامج جنبًا إلى جنب مع “الأوراق” العلمية.

قد يكون لديك أيضًا

خلفية في علم البيانات البيولوجية ، متحمس من خلال إجراء الاكتشافات البيولوجية أو المساهمة فيها ، وأنت مهتم بالعلوم متعددة التخصصات ، وتستمتع بالعمل التعاوني وترغب في توصيل المفاهيم والنتائج إلى العلماء الآخرين في مجالات البحث المختلفة.

** لا تلبي كل المتطلبات؟ نحن ملتزمون ببناء مكان عمل متنوع وشامل وأصلي ، لذلك إذا كنت متحمسًا لهذا الدور ولكن تجربتك السابقة لا تتوافق تمامًا مع كل مؤهل في الوصف الوظيفي ، فنحن نشجعك على التقديم على أي حال.

ماذا تحتاج لتعلم ايضا

نحن مختبر الأبحاث الرائد في أوروبا لعلوم الحياة – وهي منظمة حكومية دولية تقوم بإجراء بحث علمي في تخصصات تشمل البيولوجيا الجزيئية والفيزياء والكيمياء وعلوم الكمبيوتر. نحن مختبر دولي ومبتكر ومتعدد التخصصات مع أكثر من 1900 موظف من العديد من الدول ، ونعمل عبر ستة مواقع ، في هايدلبرغ (HQ) وبرشلونة وهينكستون بالقرب من كامبريدج وهامبورغ وجرينوبل وروما.

مهمتنا هي تقديم خدمات حيوية في تدريب العلماء والطلاب والزوار على جميع المستويات ؛ لتطوير أدوات وأساليب جديدة في علوم الحياة والمشاركة بنشاط في أنشطة نقل التكنولوجيا ، ودمج أبحاث علوم الحياة الأوروبية. لغة العمل في المعهد هي اللغة الإنجليزية.

العقد الأولي هو لمدة ثلاث سنوات مع إمكانية التمديد لمدة محددة.

EMBL هو أحد الموقعين على DORA. اكتشف كيف ننفذ أفضل الممارسات في تقييم البحث في عمليات التوظيف لدينا هنا .

إذا كانت لديك أي أسئلة قبل تقديم طلبك لهذا المنصب ، فيرجى الاتصال بـ Wolfgang Huber (wolfgang.huber@embl.org).

للأسئلة أو المشكلات المتعلقة بعملية التقديم ، يرجى الاتصال بـ Recruitment@embl.org