Séquençage du génome Cours Bioinformatique Afrique 2023

Le séquençage est devenu un outil essentiel dans l’analyse génétique et génomique. Il est de plus en plus important pour les scientifiques expérimentaux d’acquérir les compétences bioinformatiques nécessaires pour analyser les grands volumes de données produits par les séquenceurs. Ce cours vise à doter les participants des compétences informatiques essentielles nécessaires pour commencer à analyser les données et appliquer certains des outils et ressources les plus couramment utilisés pour l’analyse des données de séquence.

Le programme couvre les principales technologies de séquençage, la théorie algorithmique et les principes de la bioinformatique, avec un fort accent sur les sessions de calcul pratiques utilisant des techniques et des outils d’analyse de séquence applicables à toute espèce ou taille de génome. Une variété d’applications seront couvertes depuis l’analyse post-séquençage, le contrôle qualité, l’alignement de référence et l’appel de variantes.

Les candidats doivent être des scientifiques postdoctoraux, des doctorants seniors, des membres juniors du corps professoral ou des cliniciens / professionnels de la santé activement engagés ou sur le point de commencer des recherches impliquant l’analyse de données de séquençage de nouvelle génération.La priorité sera donnée aux candidats qui 1) ont actuellement ou auront bientôt des données expérimentales NGS à analyser 2) utiliseront les techniques bioinformatiques enseignées dans au moins deux des modules / domaines répertoriés dans le plan du programme dans leurs expériences 3) ont un clair plan/opportunité de diffuser les connaissances parmi leurs pairs. Nous encourageons les candidats à mettre en évidence ces domaines dans leur candidature.

Après cet atelier, les participants devraient être en mesure de :