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- DOMAINE(S) DE RECHERCHE1
Systèmes dynamiques, oscillateurs moléculaires, ATP et GTP, biophysique, mathématiques et biologie computationnelle, cytosquelette d’actine
- DESCRIPTION DE L’EMPLOI
Les plaques de Peyer sont les principaux sites inducteurs de l’immunité intestinale, cruciale pour la défense de l’hôte contre les pathogènes mais aussi pour la régulation du microbiote et la tolérance aux protéines alimentaires. Le bon positionnement et l’activation de cellules immunitaires spécifiques sont essentiels pour le changement radical des programmes transcriptionnels qui conduisent à l’initiation de la réponse immunitaire intestinale. Cependant, les liens entre la localisation des cellules immunitaires, leur migration et interaction avec les cellules voisines, l’activation, les changements transcriptionnels et la réponse immunitaire elle-même restent mal caractérisés. Ici, nous combinerons transcriptomique spatiale, imagerie fluorescente haute résolution, analyse bioinformatique et méthodes d’apprentissage automatique intermodal pour décrypter les circuits microenvironnementaux impliqués dans l’initiation de la réponse immunitaire du patch de Peyer dans différentes conditions de stimulation. Elle permettra de comprendre comment ces différents mécanismes cellulaires sont orchestrés ensemble pour produire une réponse immunitaire appropriée aux menaces détectées.
- QUALIFICATIONS/COMPÉTENCES/EXIGENCES EN MATIÈRE D’ÉDUCATION ET DE RECHERCHE
Bonne connaissance des méthodes d’analyse d’ARN-seq sur cellule unique, des calculs d’expression différentielle et de l’enrichissement fonctionnel. Connaissances de base en analyse d’images. Intérêt pour les questions biologiques, en particulier en immunologie et biologie cellulaire. Bon sens de l’organisation avec présentation synthétique des résultats scientifiques et bonne communication avec les mathématiciens, bioinformaticiens et biologistes.
- DATE LIMITE D’INSCRIPTION
16 février 2022
- DATE DE DÉBUT
Octobre 2022
- LIEU DE TRAVAIL
Aix Marseille Université au Campus de Luminy – Marseille
- DOCUMENTS DE DEMANDE DE CANDIDATURE
La demande doit inclure :
- CV
- lettre de motivation
Un email sera automatiquement envoyé à vos deux références afin qu’elles téléchargent directement leur lettre de recommandation. Nous vous invitons à les contacter pour vous assurer qu’ils ont bien reçu le courriel.
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