Thèse : Adaptation LOCal du dinoflagellé toxique ALexandrium minutum (LOCAL) – Plouzané , France

Référence : PV-2024-1413/1
Département/Bureau :
Durée en mois :
Date de début :
Date limite de candidature : 15/04/2024

Domaines généraux de responsabilité

L’unité de recherche DYNECO (Dynamique des Ecosystèmes Côtiers) travaille sur l’évolution des écosystèmes côtiers en réponse aux perturbations naturelles et anthropiques. Il mène des activités scientifiques et d’expertise dans ce domaine visant à comprendre, modéliser et prédire 1) les flux de matière dans le continuum terre-mer, et 2) la dynamique spatiale et temporelle de la biodiversité. Les approches impliquent l’observation, l’expérimentation et la modélisation.

Au sein de DYNECO, le laboratoire PELAGOS se concentre sur les écosystèmes pélagiques côtiers. Le laboratoire travaille sur les flux biogéochimiques aux interfaces et la dynamique des communautés phytoplanctoniques côtières, avec un accent particulier sur les proliférations d’algues nuisibles. Le laboratoire regroupe des chimistes, des biogéochimistes et des biologistes.

Résumé

Les crustacés comptent parmi les sources alimentaires de protéines animales les plus durables. Cependant, la production durable de coquillages est entravée par plusieurs facteurs, notamment la bioaccumulation de toxines produites par des espèces de phytoplancton telles qu’Alexandrium minutum . En raison de leurs grandes capacités de dispersion dans le milieu marin, les espèces de phytoplancton devraient présenter des populations homogènes dans le monde entier. Pourtant, une structure génétique spatiale forte est extrêmement courante. Vous étudierez si cette forte structure génétique spatiale peut s’expliquer par une adaptation locale à des conditions environnementales contrastées. L’adaptation locale est rarement étudiée dans le phytoplancton, mais elle pourrait être essentielle pour mieux comprendre le développement d’espèces toxiques dans le contexte du changement climatique. À l’aide de populations se développant en Bretagne (France) et en Galice (Espagne), vous : 1. Analyserez des séries de suivi à long terme pour identifier les conditions environnementales associées au développement d’A. minutum dans les deux écosystèmes ; 2. Déterminer les fonctions des gènes appartenant à des régions génomiques présentant d’importantes divergences inter-populations ; 3. Caractériser la divergence fonctionnelle entre les populations à l’aide d’expériences in vitro

Mots clés

Efflorescences algales nuisibles, Génomique des populations et fonctionnelle, Diversité fonctionnelle, Adaptation locale, Écologie

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

• Master en biodiversité, écologie, évolution et/ou océanographie.
• Intérêt à utiliser à la fois des outils basés sur la ligne de commande (modélisation statistique, bioinformatique) et des approches expérimentales pour étudier les aspects fonctionnels de la diversité intraspécifique du phytoplancton.

Conditions de travail spécifiques

La thèse est une véritable opportunité de travailler sur les thématiques scientifiques et technologiques prioritaires de l’Ifremer. Elle donne droit à un salaire mensuel brut de 2300 euros brut pour une durée de 3 ans, non cumulable avec d’autres bourses. 

Ce poste de doctorat est basé au laboratoire Pelagos (Plouzané, France) et comprendra des courts séjours dans le groupe « Algues nocives et écologie du plancton », au Centre Océanographique de Vigo (Espagne).

Comment postuler pour ce poste

Votre dossier de candidature doit comprendre :

• un curriculum vitae 
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes académique (Bachelor + Master 1 et premier semestre Master 2)

Votre candidature doit être compilée en 2 fichiers PDF maximum, jusqu’à 3 Mo pour chaque fichier.

La date limite de candidature est le 15 avril 2024 . Néanmoins, nous vous invitons vivement à nous faire part au plus tôt de votre intention de postuler, en contactant le responsable du sujet : mickael.le.gac@ifremer.fr

En parallèle, merci de déposer votre candidature à l’école doctorale : EDSML (https://ed-sml.doctorat-bretagne.fr)

Les contrats des doctorants débuteront à compter du 1er octobre 2024 , sous réserve du dépôt des documents administratifs autorisant l’Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de Master 2 ou diplôme d’ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors UE).

L’Institut et le service de recrutement

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l’IFREMER s’inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l’expertise et l’innovation pour :

– Protéger et restaurer l’océan

– Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société

– Créer et partager des données, des informations et des connaissances sur les océans.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long des côtes françaises sur plus de 20 sites, l’Institut explore les 3 grands océans : les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader dans les sciences océaniques, l’IFREMER gère la flotte océanographique française et ses scientifiques dévoués créent des technologies révolutionnaires pour repousser les limites de l’exploration et de la connaissance des océans, des abysses à l’interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens ont à cœur de faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et transfèrent ces connaissances et technologies aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Notre mission consiste également à renforcer la sensibilisation du public à l’importance de comprendre l’océan et ses ressources, et à responsabiliser les générations futures de dirigeants par le biais de campagnes nationales d’éducation et de sensibilisation.

Créé en 1984, l’IFREMER est un établissement public français et son budget avoisine les 240 millions d’euros. Il opère sous la tutelle conjointe du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation, du ministère de la Mer, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation.

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature : 15/04/2024

Toutes les candidatures sont traitées exclusivement via notre site Internet. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton « Postuler ».