Post-doctorat Vaccinologie et Transcriptomique Monocellulaire – Université de Calgary (U de C)

Le Département de santé des animaux de production de la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Calgary accepte les candidatures pour un boursier postdoctoral en vaccinologie et transcriptomique monocellulaire .

Domaine : Vaccinologie et transcriptomique unicellulaire

Durée : 2 ans

Date de début : automne 2021

Salaire : 50 000 $ CAD par année plus les prestations de santé du Régime C

Titre du projet:

Transcriptomique unicellulaire de Mycobacterium avium subsp. infections à paratuberculose et vaccinations dans des modèles macrophages, souris et veaux

Description de l’emploi:

La maladie de Johne (JD) est une maladie infectieuse intestinale chronique ayant un impact économique énorme sur l’industrie laitière. Bien que des efforts aient été faits pour gérer cette maladie, il existe encore des outils limités pour la contrôler efficacement. Les mesures de contrôle actuelles sont freinées par la faible sensibilité et la faible spécificité des tests de diagnostic disponibles et l’échec des vaccins existants à prévenir l’infection. Les vaccins disponibles n’offrent pas une protection suffisante à l’hôte et n’empêchent pas non plus la propagation de Mycobacterium avium subsp . paratuberculosis ( MAP ), l’agent causal de la maladie de Johne. Bien que la manipulation génétique de MAPs’est avéré difficile, nous avons développé des souches vaccinales vivantes atténuées en éliminant des gènes essentiels. Les gènes essentiels pour la croissance et la réplication de MAP dans le corps de l’hôte naturel ont été précédemment identifiés dans notre laboratoire par Tn-seq. Deux principaux gènes essentiels qui jouent un rôle dans le métabolisme énergétique de la MAP et l’absorption des métaux dans la cellule hôte ont été choisis pour des études ultérieures. La mutagenèse dirigée a été utilisée pour éliminer ces gènes qui aident normalement la MAP à persister dans le corps de l’hôte. Ces deux souches mutantes uniques ont été testées dans un modèle d’infection du veau pour mesurer la colonisation de MAP dans les tissus infectés, la quantité de MAP dans les fèces, l’expression des gènes des PBMC, les types de cellules immunitaires périphériques et le test de viabilité bactérienne.

Il est connu que MAP subvertit le système immunitaire de l’hôte en utilisant les macrophages comme réservoir principal. Mais les mécanismes par lesquels les vaccins MAP offrent une protection contre les infections naturelles ne sont pas encore entièrement compris. Nous visons à utiliser une nouvelle technologie émergente, la transcriptomique monocellulaire, pour étudier l’effet de l’infection par les souches WT et vaccinales sur la transcriptomique en aval des gènes liés à des processus biologiques spécifiques, notamment les processus inflammatoires, la tolérance, les modificateurs épigénétiques putatifs et l’homéostasie lipidique.

Nos souches vaccinales et WT seront davantage testées dans des modèles de macrophage bovin, d’infection de souris et d’infection de veau. Nous nous intéressons à la transcriptomique unicellulaire des tissus intestinaux et des ganglions lymphatiques pour nous aider à caractériser les gènes impliqués dans la pathogenèse de la JD et les voies de protection des cellules isolées du site d’infection.

Qualifications:

-Un doctorat en immunologie vétérinaire

-Un dossier de publication démontrant l’excellence

-Au moins une publication relative à l’analyse transcriptomique des réponses immunitaires, de préférence par séquençage d‘ ARN à cellule unique

-Expertise démontrable dans la préparation de bibliothèques de séquençage de nouvelle génération

-Expertise démontrable dans l‘ analyse des données ARN- seq et l’analyse des voies d’enrichissement

-Expertise démontrable dans le travail avec différents modèles animaux

-Compétences exemplaires en pensée critique et capacité démontrée à résoudre les problèmes de manière autonome

-Communication : Maîtrise de l’anglais, tant à l’écrit qu’à l’oral. Une expérience de présentation devant un public académique est requise

-Gestion du temps : le candidat doit avoir d’excellentes compétences en gestion du temps et être capable de travailler de manière autonome dans un environnement interdisciplinaire

-Supervision : Une expérience antérieure en mentorat d’étudiants de premier cycle et des cycles supérieurs est un atout

* Veuillez consulter les lignes directrices sur l’admissibilité postdoctorale pour plus d’informations avant de postuler pour ce poste.

Détails de la demande:

    • Lettre de motivation décrivant les antécédents et les intérêts de recherche
    • CV avec liste complète des publications
    • Noms et coordonnées de trois références professionnelles

Veuillez envoyer vos questions ou votre candidature à jdebuck@ucalgary.ca .

À propos de l‘ UCVM

L’UCVM est une faculté vétérinaire dynamique de l’Ouest canadien qui s’engage à renforcer les liens entre la santé animale, la santé publique et l’environnement. Le corps professoral de l‘ UCVM travaille dans toutes les disciplines et départements, favorisant la recherche collaborative, l’enseignement et le service. Les descriptions de la Faculté et de ses départements sont disponibles sur le site Web de l‘ UCVM ( www.vet.ucalgary.ca ).

À propos de l’Université de Calgary

L’Université de Calgary est la principale université de nouvelle génération au Canada – une institution vivante, en pleine croissance et jeune qui embrasse le changement et les opportunités avec une attitude positive. Située dans la ville la plus entreprenante du pays, l’université fait d’énormes progrès dans son parcours Eyes High pour être reconnue comme l’une des cinq meilleures universités de recherche au Canada, fondée sur un apprentissage et un enseignement innovants et pleinement intégrée à la communauté qu’elle sert et dirige. L’Université de Calgary inspire et soutient la découverte, la créativité et l’innovation dans toutes les disciplines. Pour plus d’informations, visitez  ucalgary.ca .

À propos de Calgary, Alberta

Calgary est l’une des villes les plus propres au monde et a été nommée l’une des villes les plus agréables au monde depuis des années. Calgary est une ville de leaders – dans les affaires, la communauté, la philanthropie et le bénévolat. Les Calgariens bénéficient de la plus forte économie du pays et bénéficient de plus de jours de soleil par an que toute autre grande ville canadienne. Calgary se trouve à moins d’une heure de route des Rocheuses et possède le réseau de sentiers urbains et de pistes cyclables le plus étendu d’Amérique du Nord.

Information additionnelle

Les conditions d’emploi sont couvertes par la convention collective de l’UCalgary et de la PDAC . Pour en savoir plus sur le programme de bourses postdoctorales de l’Université de Calgary, visitez notre site Web Postdocs .

L’Université de Calgary reconnaît qu’un personnel/un corps professoral diversifié profite et enrichit les expériences de travail, d’apprentissage et de recherche de l’ensemble du campus et de la communauté en général. Nous nous engageons à éliminer les obstacles rencontrés historiquement par certaines personnes de notre société. Nous nous efforçons de recruter des personnes qui amélioreront davantage notre diversité et soutiendront leur réussite professionnelle pendant leur séjour ici. Nous encourageons tous les candidats qualifiés à postuler, mais la préférence sera donnée aux citoyens canadiens et aux résidents permanents du Canada

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