Poste « PostDoc » (F/H) dans le domaine de l’analyse génomique des interactions microbiennes-minérales

Description du projet de recherche

Le projet financé par l’ERC vise à étudier les interactions de divers micro-organismes métallophiles chimiolithoautotrophes avec des matériaux minéraux complexes. Nous examinons les interactions microbiennes-minéraux en laboratoire et dans l’environnement à l’échelle micrométrique et nanométrique et caractérisons les empreintes microbiennes laissées sur les minéraux d’origine terrestre et extraterrestre ( https://www.nature.com/articles/s43247-021-00105-x#Ack1 ; https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.01492/full ).

Nous visons en outre à étudier la répartition écologique des micro-organismes métallophiles dans divers environnements extrêmes grâce à une approche métagénomique et à caractériser des micro-organismes auparavant incultes dans des conditions de laboratoire en étudiant leur physiologie, leur biochimie et en sondant de nouvelles interactions microbiennes avec des minéraux terrestres et extraterrestres. Cette approche vise à révéler de nouvelles espèces microbiennes capables de vivre, d’interagir avec et d’utiliser les métaux provenant de matériaux extraterrestres aux limites de la vie. Nous recherchons actuellement un postdoctorant très motivé pour examiner les génomes et transcriptomes microbiens de divers écosystèmes extrêmes et cultures de laboratoire. Les candidats ayant une solide expérience en microbiologie, en isolement microbien, en bioinformatique et en méthodes de séquençage de nouvelle génération pour l’assemblage et la caractérisation des génomes microbiens et de la phylogénie seront privilégiés. Des connaissances sur les génomes microbiens, la biochimie générale et la physiologie des micro-organismes transformateurs de métaux sont également attendues.

Description du CBM

Le Centre de Biophysique Moléculaire (CBM, http://cbm.cnrs-orleans.fr ) est une unité de recherche du Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), affiliée à l’Université d’Orléans. Au sein du Groupe d’Exobiologie du CBM à Orléans, un poste PostDoc est disponible dans les domaines de la microbiologie, de la bioinformatique, de la bio(géo)chimie, de l’astrobiologie et de l’étude génomique des interactions microbiennes avec divers minéraux dans le cadre d’un projet financé par l’ERC. Le groupe d’exobiologie du CBM offre une supervision et une expertise approfondies pour la culture et la caractérisation physiologique des micro-organismes métallophiles, la biochimie des extrémophiles, les techniques moléculaires, les techniques de microscopie électronique et de spectroscopie analytique, ainsi que la participation à des projets scientifiques en constante évolution.