Doctorant – Département de Biologie Moléculaire Biomédicale – Gand , Belgique

Date de dernière candidature 30 juin 2024 00:00

Département WE14 – Département de Biologie Moléculaire Biomédicale

Contrat Durée limitée

Diplôme Master ès sciences en génie des biosciences, bioinformatique, biochimie et biotechnologie – majeure bioinformatique et biologie des systèmes ou autre Master ès sciences avec une expertise pertinente en biologie computationnelle

Taux d’occupation 100%

Type de poste vacant Personnel de recherche

Description de l’emploi

• Le glioblastome reste une tumeur cérébrale agressive, mortelle et difficile à guérir. De plus en plus de preuves indiquent une grande hétérogénéité des tumeurs, ainsi qu’une plasticité en réponse au traitement, conduisant à un échec thérapeutique. Au niveau d’une seule cellule, cela se présente avec différents états cellulaires qui peuvent passer les uns aux autres en fonction de conditions environnementales ou d’un traitement spécifique. Une compréhension complète des mécanismes moléculaires et régulateurs sous-jacents à la plasticité induite par le traitement chez les patients atteints de glioblastome est indispensable au développement de nouvelles modalités de traitement plus efficaces et moins toxiques. Ce projet de doctorat s’inscrit dans le contexte d’un projet interuniversitaire « Stichting Tegen Kanker » qui vise à élucider les mécanismes moléculaires de la plasticité des cellules tumorales radio-induites à une résolution unicellulaire.
• Le laboratoire de biologie computationnelle, intégromique et régulation génétique – CBIGR – du professeur Vanessa Vermeirssen se concentre sur l’acquisition d’une compréhension fonctionnelle de la régulation et de la signalisation génétiques en vue d’une médecine personnalisée, en utilisant les statistiques, la bioinformatique et l’apprentissage automatique, ainsi que la biologie à haut débit dans le cadre des réseaux de régulation génétique. Notre objectif final est d’utiliser ces connaissances dans le développement de nouvelles stratégies préventives ou thérapeutiques pour des soins de santé personnels réussis. Nous faisons partie du Département de Biologie Moléculaire Biomédicale et du Département de Médecine Biomoléculaire, avec une expertise reconnue en biologie moléculaire, technologies omiques, bioinformatique et cancer à l’Université de Gand. Nous sommes également partenaire du Cancer Research Institute Gand (CRIG), https://www.crig.ugent.be/en/prof-vanessa-vermeirssen-phd .
• Nous recherchons un doctorant talentueux et très motivé pour rejoindre notre équipe enthousiaste dans la recherche sur le glioblastome multi-omique unicellulaire. Plus précisément, vous mettrez en œuvre et optimiserez des méthodologies (multi-omique informatique et expérimentale de pointe sur une seule cellule) et analyserez et intégrerez des données de grande dimension pour démêler l’hétérogénéité réglementaire du glioblastome et identifier les programmes clés de régulation de la plasticité.

Profil de l’emploi

• Vous avez obtenu un Master ès sciences en génie des biosciences, bioinformatique, biochimie et biotechnologie – majeure bioinformatique et biologie des systèmes ou un autre Master ès sciences avec une expertise pertinente en biologie computationnelle.
• Vous disposez d’un bon historique (résultats d’études – top 25 % de la cohorte étudiée – et/ou publications).
• Vous avez de l’expérience en programmation (y compris bash, Python, scripts R, calcul haute performance, bases de données et outils de visualisation).
• Vous possédez un fort intérêt et une expertise en bioinformatique, en biostatistique et en analyse de données de grande dimension.
• Vous avez des connaissances en biologie moléculaire du cancer, unicellulaire et multi-omique.
• Une expertise en travaux de laboratoire dans un laboratoire de biologie moléculaire, y compris les technologies omiques, est un plus.
• Vous possédez d’excellentes compétences en communication écrite et orale en anglais.
• Vous possédez de solides compétences analytiques en résolution de problèmes (créative, critique, pensée originale).
• Vous êtes capable de travailler de manière indépendante et de prendre des initiatives, mais vous êtes également un joueur d’équipe.
• Vous êtes précis et avez un fort sentiment de responsabilité.
• Vous êtes persévérant et avez une forte ambition d’apprendre.

Notre offre

• Vous travaillerez dans un environnement stimulant, multidisciplinaire et collaboratif et aurez la possibilité d’interagir avec les meilleurs chercheurs en cancérologie et en biologie computationnelle du CRIG, de l’UGent et des partenaires du projet à la KUL et au SCK-CEN.
• Vous aurez accès à des technologies et à une infrastructure informatique de pointe.
• Vous aurez l’occasion d’assister à des conférences internationales, de publier vos résultats dans des revues de premier plan et de visiter des instituts de recherche pertinents.
• Vous aurez la chance de guider des étudiants de premier cycle et des stagiaires.
• Vous recevrez une rémunération compétitive comprenant un large éventail de possibilités de formation et d’éducation (sur le terrain et via le programme de l’école doctorale de l’UGent par exemple), 36 jours de congés, une indemnité vélo et des éco-chèques.
• Vous aurez la possibilité d’obtenir un doctorat. Nous proposons un poste d’une durée d’un an, qui sera normalement prolongé à 4 ans en cas d’évaluation positive. A noter que cette dernière peut nécessiter une candidature à une bourse doctorale FWO/BOF (vérifiez votre éligibilité sur «Profil et conditions» sur https://www.fwo.be/fr/fellowships-funding/phd-fellowships/phd-fellowship-fundamental -recherche/ ).

comment s’inscrire

Soumettez les documents suivants, fusionnés dans un seul fichier pdf, par email à vanessa.vermeirssen@ugent.be :

• Lettre de motivation
• CV
• Noms et contacts d’au moins 2 références
• Copie du diplôme

Les candidats les mieux classés seront invités à un entretien (soit sur place, soit via MS Teams/Zoom).

Pour toute demande concernant le poste, contactez le Prof. Dr. ir. Vanessa Vermeirssen ( vanessa.vermeirssen@ugent.be ).