(Ouvert aux chercheurs internationaux expérimentés)

Projet de recherche : JUNON : des jumeaux numériques au service des ressources naturelles

Domaines de recherche :  Informatique, IA, données, environnement

CONTEXTE

LE STUDIUM Institut d'Etudes Avancées du Val de Loire recrute un scientifique international expérimenté spécialisé en informatique avec des compétences et une expérience en apprentissage automatique et en intégration de données. Le candidat retenu sera invité à une bourse d'un an pour travailler avec l'équipe de recherche PRISME (PRISME Université d'Orléans/INSA – EA4229) et à rejoindre un grand programme de recherche régional appelé JUNON, lancé en 2022. Le programme vise à construire le numérique jumeaux et de concevoir des services numériques pour améliorer le suivi et la compréhension de l’environnement, pour une meilleure gestion des ressources naturelles. Il met en relation un réseau bien établi de partenaires de recherche régionaux (BRGM, INRAE, CNRS, Universités d'Orléans et Tours) dans divers domaines (sols, eau, atmosphère) et de partenaires non académiques. L’ambition est de placer la recherche environnementale et numérique au cœur de la stratégie régionale d’innovation et d’apporter des données et services utiles à de multiples partenaires socio-économiques. 

En tant que Chercheur rattaché à l'Institut d'études avancées du Val de Loire, il fera partie d'une communauté scientifique et internationale pluridisciplinaire tournée vers l'extérieur et stimulante.

CONTEXTE DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE

Le candidat retenu rejoindra l'équipe de recherche PRISME (département IRAus) pour améliorer/soutenir les développements initiaux fixés pour atteindre les objectifs du projet JUNON.

Le département Images, Robotique, Automatisme et Signal (IRAuS) se positionne dans les Sciences Techniques, de l'Information et de la Communication ( https://www.univ-orleans.fr/fr/prisme ).

Au sein de Junon, PRISME collabore avec d'autres laboratoires d'Orléans et de Tours spécialisés en informatique et mathématiques appliquées. D'autres collaborations établies avec des partenaires industriels et des équipes de recherche universitaires seront discutées plus en détail au cours du processus d'entretien.

MISSION DU CHERCHEUR

Le candidat retenu possède une expérience avérée dans les projets de développement Python, d’intégration de données et d’apprentissage automatique impliquant des données hétérogènes. Il/elle devra faire preuve de créativité et produire des travaux et des recherches originaux au cours des 12 mois consécutifs de la bourse.

Le candidat devra travailler à 3 niveaux :

  1. Infrastructure (intégration de données)
  2. Intégration des algorithmes et du protocole de machine learning (voire contribution au développement)
  3. Création d'interfaces intelligentes permettant aux utilisateurs non experts de manipuler ou d'utiliser les différents jumeaux numériques de manière très conviviale.

Cela implique donc pour le candidat :

  • Comprend l'ADN des différents jumeaux en construction pour pouvoir les reformuler en package opérationnel
  • Intervient dans le développement d’un ou plusieurs jumeaux numériques.
  • Participe à certains développements informatiques spécifiques concernant les avancées.

LE STUDIUM  Institut d'Etudes Avancées du Val de Loire 1, rue Dupanloup- 45000 Orléans, France

Tél. 33 (0)2 38 21 14 82 – email :  contact@lestudium-ias.fr

COMPÉTENCES ET EXPÉRIENCE ESSENTIELLES

LE STUDIUM Institut d'Etudes Avancées du Val de Loire recherche à recruter un profil de chercheur senior avec :

  • Expérience significative dans le domaine de l’informatique avec des compétences en apprentissage automatique
  • Ancienneté dans le développement de logiciels complexes
  • Expertise démontrée en projets appliqués et applications fonctionnelles, idéalement dans le domaine environnemental
  • Connaissance et expérience en analyse de jumeaux numériques / systèmes IOT
  • Expertise démontrée dans le développement d’un cadre de bout en bout

CRITÈRE D'ÉLIGIBILITÉ

Les chercheurs candidats :

  • Être en possession d'un doctorat et d'au moins cinq ans d'expérience en recherche équivalente à temps plein après le doctorat
  • Être ressortissant ou résident de longue durée d’un pays autre que la France. Les résidents de longue durée sont des chercheurs ayant effectué une période d'activité de recherche à temps plein d'au moins 5 années consécutives (sans interruption de recherche) dans un pays autre que la France.
  • Respecter la règle de mobilité suivante : les candidats ne doivent pas avoir résidé ou exercé leur activité principale (travail, etc.) en France pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant immédiatement la date limite de candidature.

CONDITIONS D'EMPLOI

Le poste est basé à Orléans, en France et offre  12 mois consécutifs de résidence à un scientifique senior expérimenté résidant actuellement dans un pays autre que la France.

Le candidat retenu sera accueilli dans le programme JUNON, l'équipe de recherche PRISME et la faculté des chercheurs internationaux LE STUDIUM.

Les langues de travail scientifiques sont le français et l'anglais.

Les droits détaillés dans le contrat de travail français comprennent :

  • Un salaire personnel dans le cadre d'un contrat de travail français
  • Frais de location d'un appartement entièrement meublé pour le candidat et sa famille.
  • Assistance logistique et administrative par un membre de l'équipe opérationnelle LE STUDIUM avant et pendant la bourse (visa, logement, banque, assurance, scolarité…).
  • Invitations régulières à des réunions scientifiques
    • Le poste devrait être pourvu au plus tard en septembre 2024.

PROCESSUS DE DEMANDE

Candidature en ligne via la plateforme LE STUDIUM : Rubrique Postuler https://www.lestudium-ias.com/recruitment 

La date limite de candidature est le 31 mars 2024.

La candidature doit être composée de trois éléments (en anglais).

  • Un formulaire de candidature LE STUDIUM en ligne complété avec les informations personnelles et le détail des antécédents ;
  • Un curriculum vitae de cinq pages maximum comprenant des informations ne figurant pas dans la candidature en ligne ;
  • Une lettre de motivation

Téléchargez des documents sous forme de fichiers PDF.

LE STUDIUM Val de LoireInstitut d'Etudes Avancées 1, rue Dupanloup- 45000 Orléans, France

Tél. 33 (0)2 38 21 14 82 – e-mail :  aurelien.montagu@lestudium-ias.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةEnseignement et recherche scientifique

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Le visa de travail d'employeur accrédité en Nouvelle-Zélande est un visa de travail temporaire d'une durée maximale de 5 ans . Ce visa vous permet de travailler en Nouvelle-Zélande pour un employeur accrédité. Vous devez recevoir une offre d'emploi. Un employeur accrédité est autorisé par Immigration New Zealand à embaucher des travailleurs qualifiés avec le visa de travail d'employeur accrédité (AEWV). Il s’agit du principal visa de travail temporaire conçu pour permettre aux employeurs d’embaucher plus facilement des employés étrangers.

Avec ce visa, vous pouvez également étudier en Nouvelle-Zélande jusqu'à 3 mois sur 12 mois. Vous devez être payé 29,66 NZD de l'heure. De plus, si vous venez en Nouvelle-Zélande avec l'AEWV, votre employeur vous apportera une aide à l'installation. Conformément au droit du travail néo-zélandais et à d'autres engagements , votre employeur doit payer tous les coûts et frais en Nouvelle-Zélande et à l'étranger pour votre recrutement. Plus d’informations sur le processus de visa de travail pour employeur accrédité en Nouvelle-Zélande sont données ci-dessous.

Informations sur les statistiques de l’AEWV

Au 15 mars 2024, Immigration New Zealand (INZ) avait approuvé 113 497 demandes AEWV et il y avait 33 596 employeurs accrédités. ( Source ).

Conditions d'éligibilité au visa de travail d'employeur accrédité

  • Être nommé par un employeur accrédité
  • Vous devez être de bonne moralité.
  • Vous devez être en bonne santé.
  • Vous devez remplir les conditions du visa AEWV fixées pour votre pays.
  • Vous devez avoir une offre d'emploi d'un employeur accrédité .
  • Vous devez avoir les qualifications pour faire le travail.

Liste des employeurs accrédités

Un employeur accrédité approuvé par Immigration New Zealand pour employer des travailleurs de l'extérieur de la Nouvelle-Zélande avec le visa de travail d'employeur accrédité (AEWV). Seuls les employeurs accrédités peuvent soutenir un AEWV.

Depuis ce site , vous pouvez consulter la liste des employeurs accrédités.

Autres visas qui vous obligent à travailler pour un employeur accrédité

Documents requis

  • Passeport
  • Une photo
  • Certificat de police
  • Une offre d'emploi d'un employeur accrédité pour au moins 30 heures de travail par semaine.
  • Preuve que vous répondez aux exigences du poste
  • Inscription professionnelle.
  • Dans votre demande de visa, vous devez inclure :
    • une copie du contrat de travail et de la description de poste
    • une copie signée de l'offre d'emploi.

Exigences de l'emploi

Pour demander un visa de travail d'employeur accrédité, vous devez prouver vos compétences, vos qualifications et votre motivation.

  • Copies originales ou certifiées conformes de vos qualifications
  • Preuve que la New Zealand Qualifications Authority (NZQA) reconnaît votre qualification
  • Expérience professionnelle antérieure si :
    • Le travail que tu as fait
    • Les dates auxquelles vous avez travaillé
    • Combien d'heures avez-vous travaillé par semaine
    • Coordonnées de votre/vos employeur(s)
    • Dans quelle mesure votre expérience professionnelle est-elle pertinente par rapport à l'offre d'emploi que vous avez en Nouvelle-Zélande ?

Créez un CV à la néo-zélandaise

Les employeurs néo-zélandais n’aiment pas les histoires. Développez un CV pour les employeurs néo-zélandais qui souhaitent lire. En Nouvelle-Zélande, la plupart des employeurs apprécient les curriculum vitae (CV) courts et faciles à lire .

Frais de visa

Les frais de demande pour un visa de travail d'employeur accrédité s'élèvent à 750 NZD .

Durée du séjour

  • Jusqu'à 5 ans

Temps de traitement

80% des demandes sont traitées dans un délai de 7 semaines.

Comment faire une demande de visa de travail pour employeur accrédité en Nouvelle-Zélande ?

  1. Recevoir une offre d'emploi : Vous devez recevoir une offre d'emploi de votre employeur accrédité. Et votre employeur vous enverra des documents.
  2. Remplissez le formulaire de demande de visa en ligne : Après avoir reçu les documents, vous recevrez un e-mail d'Immigration New Zealand (INZ). L'e-mail contiendra le lien vers la demande de visa en ligne.
  3. Frais de visa : payez les frais requis pour un travail auprès d'un employeur accrédité lorsque vous remplissez la demande en ligne.
  4. Déposer la demande de visa

Vous pouvez demander le visa de travail d'employeur accrédité en ligne sur le site Web de l'immigration néo-zélandaise . J'espère que cela clarifie le visa de travail d'employeur accrédité en Nouvelle-Zélande.

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةLa main d'oeuvre

Le visa de travail d’employeur accrédité en Nouvelle-Zélande est un visa de travail temporaire d’une durée maximale de 5 ans . Ce visa vous permet de travailler en Nouvelle-Zélande ...View more

The University of Nevada, Reno (UNR) appreciates your interest in employment at our growing institution. We want your application process to go smoothly and quickly. Final applications must be submitted prior to the close of the recruitment.

If you need assistance or have questions regarding the application process, please contact our recruitment helpline at (775) 784-1495 or jobs@unr.edu. For UNR Med professional job postings, please contact the Office of Professional Recruitment at (775) 784-6778.

Job Description

The Department of Economics at the University of Nevada, Reno invites applications for a two-year Postdoctoral Scientist position in the area of natural resource economics. The successful candidate will take part in an interdisciplinary research project centered on divergence and/or convergence of human perceived and instrumented climate change induced impacts. The candidate will contribute to a multi-state research project funded by National Science Foundation RII Track-2 award Where We Live: Local and Place Based Adaptation to Climate Change in Underserved Rural Communities and collaborate with experts in social and environmental sciences. The ideal candidate would have experience in working with large-scale geospatial data and econometric modeling. Familiarity with hydrometeorological fields and processes is a plus. We are particularly interested in candidates with experience working on problems unique to irrigated agricultural water users and other stakeholders in rural, water scarce regions of the western United States.

The work will include three components: 1) Literature search and synthesis to describe existing knowledge and identification of knowledge gaps regarding climate change impacts and adaptation in arid rural water scarce regions. 2) Economic modeling and econometric analysis using existing large gridded geospatial data sets to address the identified knowledge gaps such as developing a socioecological systems framework for modeling irrigated agricultural users and other stakeholders' decisions to adapt to increasingly variable water supply. 3) Co-production of new knowledge, in partnership with an interdisciplinary science team and rural community stakeholders, designed specifically to assess and address the gap between perceived and instrumented climate change induced impacts on water supply.

The position is available immediately.

Required Qualifications

  • Ph.D. in Natural Resource, Agricultural, or Applied Economics, or a closely related field within Economics.
  • Strong quantitative skills including economic modeling and state of the art econometric methods.
  • Demonstrated ability to produce academic research papers and presentations; Strong written and oral communication skills.
  • Completion of a doctoral degree in the appropriate discipline is required.
  • The doctoral degree must have been completed within the five years immediately preceding the first date of appointment as a postdoctoral fellow at the University.
  • The individual cannot have held previous positions in the professional ranks.

Preferred Qualifications

Experience collaborating in interdisciplinary settings; Demonstrated ability to work with large geospatial datasets; Interest or familiarity with Agent Based Modeling; Experience and/or interest engaging community-based research partners.

Compensation Grade Postdoctoral Scholar

($70,000)

To view the salary schedule for this position, please visit: Salary Schedules. Salary is competitive and commensurate with related education and experience.

Perks of Working at UNR!

  • Health insurance options including dental and vision - Health Insurance
  • Generous annual and sick leave, life insurance – Faculty Benefits
  • E. L. Wiegand Fitness Center offers annual or semester memberships and spouse/domestic partner membership options.  E.L. Wiegand Fitness Center
  • Reno is proud to be a University town! Many local businesses offer discounts to WolfCard holders
  • Mountain EAP supports employees (and eligible dependents) through life's difficult moments. Mountain EAP is located in Reno and specializes in counseling and advising services for personal or interpersonal issues.
  • Several Diversity Committees and Affinity Groups focusing on campus-wide diversity initiatives to ensure we are working to create a diverse and welcoming campus climate. Diversity Groups
  • Faculty Senate is the principal representing body for faculty. Its membership includes representatives from each academic and administrative major unit of the University. Faculty Senate
  • No state income tax!

Faculty Dual Career Assistance Program

The University of Nevada, Reno recognizes the importance of addressing dual-career couples’ professional needs. We offer a dual career assistance program to newly hired faculty spouses/partners that provides resources and assists them to identify career opportunities in Northern Nevada. Dual Career Assistance Program

Department Information

The University of Nevada, Reno is a leading research university, which has grown substantially over the past decade thanks to our commitment to building an inclusive, diverse, and collaborative research environment. The mission of the Economics Unit is to provide high quality education through degree programs at the undergraduate and graduate levels, undertake cutting-edge economics research, and assist public and private decision makers in practical ways. Consistent with our university's land-grant mission, we serve as a resource to the community through applied scholarship, outreach programs, and economic development. Within the Department of Economics, the Economics, Society and Natural Resources (ESNR) research unit specializes in bringing an economic focus to research and applied problems related to natural resource management, environmental policy, and ecosystem change. ESNR specializes in integrated approaches to environmental problems, combining economics and other social sciences with biological and physical sciences to advance the state of knowledge about natural resource management, environmental policy, and economics.

Exempt

Yes

Full-Time Equivalent

100.0%

Required Attachment(s)

Please note, once you submit your application the only attachment/s viewable to you will be the attachment/s to the resume/CV section of the application. Any additional required attachment/s to the cover letter, references, additional documents sections of the application, will not be viewable to you after you submit your application. All uploaded attachment/s will be on the application for the committee to review. To request updates to attachments, prior to the committee review of applications, please contact the candidate helpdesk at jobs@unr.edu

Attach the following attachments to your application

1) Resume/CV

2) Cover letter emphasizing research background and interests

3) Writing sample

3) Contact Information for Three Professional References

This posting is open until filled

Qualified individuals are encouraged to apply immediately. Recruitment will close without notice when a sufficient number of applications are received or a hiring decision has been made.

Posting Close Date

Note to Applicant

A background check will be conducted on the candidate(s) selected for hire.

HR will attempt to verify academic credentials upon receipt of hiring documents. If the academic credentials cannot be verified, HR will notify the faculty member that an official transcript of their highest degree must be submitted within thirty days of the faculty member’s first day of employment.

References will be contacted at the appropriate phase of the recruitment process.

Applicants hired on a federal contract may be subject to E-Verify.

As part of the hiring process, applicants for positions in the Nevada System of Higher Education may be required to demonstrate the ability to perform job-related tasks.

For positions that require driving, evidence of a valid driver's license will be required at the time of employment and as a condition of continued employment.

Schedules are subject to change based on organizational needs.

The University of Nevada, Reno is committed to providing a place of work and learning free of discrimination on the basis of a person’s age (40 or older), disability, whether actual or perceived by others (including service-connected disabilities), gender (including pregnancy related conditions), military status or military obligations, sexual orientation, gender identity or expression, genetic information, national origin, race (including hair texture and protected hairstyles such as natural hairstyles, afros, bantu knots, curls, braids, locks and twists), color, or religion (protected classes).

About Us

The University of Nevada, Reno is a leading American public research university committed to the promise of a future powered by knowledge. Founded in 1874 as Nevada’s original land-grant university, the University serves 21,000 undergraduate and graduate students from all 50 states and 63 countries.

Classified by the Carnegie® Classification of Institutions of Higher Education as an R1 (“Very High Research”) university, it is also recognized in the Carnegie® Community Engagement classification. The University is also ranked by U.S. News & World Report among the “Best National Universities” and “Best National Public Universities.” It also ranks in the top tier of the WSJ/Times Higher Education World University Rankings and the New York Times’ “Top Colleges for Economic Diversity.”

Since 2009, nearly $1 billion has been has invested in advanced labs, facilities, and residence halls on the main campus. The University is home to Nevada’s first medical school – the University of Nevada, Reno School of Medicine – and it delivers on its original land-grant mission with outreach across the state through the University of Nevada, Reno Extension, Nevada Agricultural Experiment Station, Nevada Bureau of Mines and Geology, Nevada Small Business Development Center, the Nevada Seismological Laboratory, and Wolf Pack Athletics.

The main campus is in Reno, Nevada, a burgeoning global technology hub with a vibrant midtown and downtown. Found where the high desert of the Great Basin meets the High Sierra and Lake Tahoe, the beautiful, 290-acre main campus is also a Nevada State Arboretum. In recent years, the University has expanded to include two additional locations: the Redfield Campus in south Reno and the Wayne L. Prim campus in Incline Village, which is the home of the University of Nevada, Reno at Lake Tahoe.

 As part of the Nevada System of Higher Education – comprised of two research universities, one state college, four community colleges and an environmental research institute –  the University is committed to developing strong partnerships with each of these institutions for the benefit of all Nevadans.

Through its commitment to high-impact education, world-improving research and creative activity, and outreach that’s transforming Nevada’s communities and businesses, the University continues its nearly 150-year tradition of benefitting our state, nation and world.

The University recognizes that diversity promotes excellence in education and research. The inclusive and engaged community on campus recognizes the added value that students, faculty, and staff from different backgrounds bring to the educational experience.

Today, the University delivers on its original land-grant mission of access to education and knowledge by investing in the academics, facilities, support, engagement and vibrant campus life that promote our diverse students’ cognitive growth and academic achievement – all while remaining one of the best values in American higher education.

For more information, please visit the University’s website.

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةPostdoctoral

The University of Nevada, Reno (UNR) appreciates your interest in employment at our growing institution. We want your application process to go smoothly and quickly. Final applications must be submitt...View more

Job Title:  Post-Doctoral Researcher-Biochemistry (Full-time) Kinetoplastid Job Classification: Post-Doctoral Researcher Posting close date:  4/11/2024 Start date of this position:  5/1/2024 Required Degree: PhD in the field of Biochemistry, Molecular Biology, or adjacent field.  The required degree must be completed by the start date. Experience:   Applicants with experience in flow cytometry, cell sorting, eukaryotic parasite metabolism, and high-throughput small molecule screening are preferred. A PhD in the field of Biochemistry, Molecular Biology, or adjacent field. Duties/Expectations: Oversee and perform experiments on the metabolic regulation and function of Kinetoplastid eukaryotic parasites using genetically-encoded fluorescent protein biosensors and both acquire and prepare data for publication. The postdoctoral researcher will also help manage and train graduate and undergraduate research assistants. Information required at the time of application - Please list the individual contact information for each of your three recommenders on the faculty application. At some point during the selection process, they may be contacted to submit their letters of reference electronically Mission Alignment Statement: BYU is committed to hiring faculty members who enthusiastically embrace and energetically advance its unique mission. To this end, please include a one-page mission alignment statement as part of your application that addresses how you might, as a BYU faculty member: (1) live a life of loyalty to Jesus Christ and His restored Church and align yourself with doctrines and teachings declared by living prophets, seers, and revelators; (2) demonstrate intentionality in building faith in Jesus Christ and testimony of His restored gospel among students and others in the BYU community; and (3) teach your subject matter with the Spirit of God and strive to keep it ¿bathed in the light and color of the restored gospel¿ (Spencer W. Kimball). Applicants who are not members of The Church of Jesus Christ of Latter-day Saints include a one-page mission alignment statement that describes understanding of and commitment to the Mission of Brigham Young University and the AIMS of a BYU Education (https://aims.byu.edu/). Document(s) required at the time of application - Please attach your Mission Alignment Statement, updated Curriculum Vitae, and cover letter to the faculty application. #LI-DNI Equal Opportunity Employer: m/f/Vets/Disability Brigham Young University is an equal opportunity employer.  All faculty are required to abide by the university's Honor Code and Dress & Grooming Standards. Preference is given to qualified candidates who are members in good standing of the affiliated church, The Church of Jesus Christ of Latter-day Saints. Successful candidates are expected to support and contribute to the academic and religious missions of the university within the context of the principles and doctrine of the affiliated church. All new employees who are members of The Church of Jesus Christ of Latter-day Saints will be required to hold and be worthy to hold a current temple recommend.

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةPostdoctoral

Job Title:  Post-Doctoral Researcher-Biochemistry (Full-time) Kinetoplastid Job Classification: Post-Doctoral Researcher Posting close date:  4/11/2024 Start date of this position:  5/1/2024 Requ...View more

Athens - Grèce
MSCA - Doctorant (DC3) - Bourse de doctorat en production de données multi-omiques lors de la fermentation des olives.
  • Biologie
  • Biochimie
  • biotechnologie
Données omiques, Chimie alimentaire, Chimie analytique, Biotechnologie, Microbiologie alimentaire

Description du sujet

Titre : DC3, bourse de doctorat en production de données Multi-omics lors de la fermentation des olives. Profil chercheur : Doctorant. Type de contrat : Temporaire. Statut d'emploi : Temps plein. Durée : 36 mois. Date limite de candidature : 15/05/2024 23:59 - Europe/Bruxelles. Date de début de poste envisagée : octobre 2024. Comment postuler : soumettez votre formulaire de candidature via le site FAIRomics. Veuillez noter que ce poste de doctorat conduira à l'obtention d'un  double diplôme  après l'achèvement d'un séjour dans chacune de ces organisations : l'  Université nationale et capodistrienne d'Athènes (NKUA), Grèce et l'  Université de Wageningen (WU), Pays-Bas. Description du projet: L'initiative FAIROmics, un programme de recherche interdisciplinaire, rassemblera des universités, des centres de recherche et des entreprises privées pour permettre la FAIRification de l'interopérabilité des données et des bases de données omiques et développer des graphiques de connaissances pour une prise de décision basée sur les données afin de concevoir rationnellement des communautés microbiennes pour conférer les caractéristiques souhaitables aux plantes. à base d'aliments fermentés dans le contexte de la science ouverte et de sa réglementation. Le programme de formation FAIROmics vise à développer les compétences des doctorants à l'interface entre l'intelligence artificielle, les sciences de la vie, les sciences humaines et sociales. Contexte scientifique : Les alternatives végétales aux produits laitiers et à la viande ont gagné en popularité ces dernières années pour diverses raisons, notamment la durabilité et les bienfaits pour la santé, ainsi que les tendances de style de vie et les restrictions alimentaires. Cependant, les produits alimentaires à base de plantes peuvent être déséquilibrés sur le plan nutritionnel et leurs profils aromatiques peuvent limiter leur acceptation par les consommateurs. Les micro-organismes sont utilisés dans la fabrication de produits alimentaires depuis des millénaires. Cependant, la diversité des communautés microbiennes à l’origine des fermentations végétales, ainsi que leurs principales caractéristiques génétiques et phénotypiques ainsi que les synergies potentielles entre les membres de la communauté, restent mal caractérisées. De nombreuses données existent, mais elles sont réparties dans différentes littératures (scientifiques et grises) ou, dans le meilleur des cas, dans différentes bases de données. Cependant, elles ne sont pas toujours réutilisables car difficiles à trouver et à accéder et parce que les bases de données ne sont pas systématiquement interopérables. Objectifs: Nous recherchons un doctorant (DC) pour rejoindre notre projet sur plusieurs sites dans l'UE avec une maîtrise dans une discipline pertinente (chimie alimentaire, chimie analytique, biotechnologie, microbiologie alimentaire) intéressé par la production de données multi-omiques et la composition complète. compréhension pendant la fermentation des olives. Les principaux objectifs de ce projet de recherche sont d'étudier les communautés microbiennes et de concevoir une production alimentaire à base de plantes, d'explorer les aliments fermentés et de produire des données multi-omiques lors de la fermentation des olives. La métagénomique et la transcriptomique couplées à des approches métabolomiques seront utilisées pour caractériser de manière exhaustive l'impact du microbiome sur la composition chimique des olives de table et d'autres substrats végétaux et définir les changements dynamiques des métabolites clés, déterminant leurs qualités nutritionnelles et sensorielles au cours du processus de fermentation. Les données métagénomiques, transcriptomiques et métabolomiques seront produites selon les principes FAIR, en utilisant des méthodologies analytiques de pointe et des techniques chimiométriques avancées. L'analyse des données métabolomique, métagénomique et transcriptomique permettra d'identifier les communautés microbiennes, les microbes, les métabolites et les gènes fonctionnels et leur rôle dans la fermentation des olives. L'élucidation des voies métaboliques sous-jacentes à la production des composants déterminants pour la qualité et la saveur peut conduire à l'optimisation du processus de fermentation et à la surveillance efficace des changements de qualité des aliments. Localisation et secondaires prévus : Le doctorant sera principalement basé à NKUA à Athènes, en Grèce, pendant 27 mois . Deux détachements sont prévus :
  • Un au sein de la NIZO Research Company à Ede, aux Pays-Bas pendant 3 mois pour vérifier la croissance, la production acide et la production volatile de souches de L. plantarum sur différents substrats végétaux.
  • Un à l'Université de Reading, au Royaume-Uni, pendant 6 mois pour faire du séquençage par fusil de chasse et de la méta-transcriptomique.
Inscription au doctorat : Organisme délivrant le 1er degré : Université nationale et capodistrienne d'Athènes, https://en.uoa.gr/ Organisme délivrant le 2e degré : Université de Wageningen, https://www.wur.nl/en/wageningen-university.htm Équipe de superviseurs : L'équipe du superviseur sera composée du professeur adjoint Marilena Dasenaki et du professeur agrégé Vasilis Valdramidis de NKUA, du professeur agrégé Kimon-Andreas Karatzas de l'UREAD, du Dr Marjon Wells-Bennik de NIZO et du professeur Marcel Zwietering de l'Université de Wageningen. Tous possèdent une vaste expérience en chimie et microbiologie alimentaires et ont encadré de nombreux doctorants. Le Dr Marilena Dasenaki (F) est professeur adjoint au Laboratoire de chimie alimentaire de l'Université nationale et capodistrienne d'Athènes. Son activité de recherche se concentre sur l’étude de la métabolomique alimentaire à l’aide de techniques de spectrométrie de masse de pointe et d’outils chimiométriques avancés. Dans l'ensemble, les recherches du Dr Dasenaki ont été publiées dans 45 articles évalués par des pairs et quatre chapitres de livres, attirant plus de 1 100 citations, avec un indice h de 18, et ses travaux ont été présentés lors de plusieurs conférences scientifiques internationales. Le Dr Vasilis Valdramidis (M) est professeur associé à l'Université nationale et capodistrienne d'Athènes (Département de chimie). Il est titulaire d'un doctorat. diplôme en génie chimique de l'Université catholique de Louvain, Belgique et diplôme primaire en agriculture (sciences et technologies alimentaires) de l'Université Aristote de Thessalonique (Grèce). Il a environ 100 publications dans des revues et chapitres à comité de lecture. Il a supervisé/dirigé huit chercheurs postdoctoraux et plus de 10 doctorats (en tant que directeur principal ou co-directeur) et a agi en tant qu'examinateur externe de plusieurs thèses de doctorat à travers l'Europe. Dr. Kimon AG Karatzas(M) est membre du corps professoral (professeur agrégé de microbiologie alimentaire) du Département des sciences de l'alimentation et de la nutrition de l'Université de Reading. Ses productions scientifiques comprennent plus de 55 articles dans des revues à fort impact (indice h de 23 basé sur SCOPUS), un brevet international et divers chapitres de livres. Il est également membre de l'ASM et du SGM ainsi que du comité de rédaction de Microbial Physiology and Metabolism, Frontiers in Microbiology et de la revue Foods. Actuellement, son groupe comprend 6 doctorants (dont 2 termineront leurs études dans quelques mois) tandis qu'il est co-encadrant de 3 autres doctorants. Dans le passé, il a supervisé avec succès 9 doctorants en tant que PI principal et douze en tant que Co-I et neuf chercheurs postdoctoraux et scientifiques invités. Il possède une longue expérience en physiologie microbienne du stress et en biologie moléculaire et plus de 22 ans d'expérience dans les fermentations alimentaires. Il a mené l'une des premières études portant sur les propriétés probiotiques des isolats issus de fermentations d'olives, ce qui est très pertinent pour ce projet. Il possède également une longue expérience dans la fermentation de produits traditionnels ; il a mené les premiers travaux d'analyse du microbiote et d'utilisation de cultures starter pour la production de lafun, un produit nigérian traditionnel fermenté à base de manioc. Il entretient également une étroite collaboration avec diverses entreprises concernées et d’autres scientifiques du domaine. Le Dr  Marjon Wells-Bennik (F) est scientifique principale chez NIZO et possède une vaste expertise en microbiologie alimentaire, y compris la fermentation et la sécurité des alternatives laitières à base de plantes. Elle a initié divers projets de consortium avec de multiples acteurs académiques et industriels, dont un récent projet sur les « Contaminants microbiens dans les ingrédients protéiques d'origine végétale ». Depuis 2002, elle a encadré 8 doctorants ; 2 sont en cours et 6 ont obtenu leur diplôme. Elle a publié plus de 70 articles de recherche et déposé deux brevets. Elle peut transférer des connaissances fondamentales vers une recherche plus appliquée. (ETP : 0,1) Le Dr MH Zwietering (M) est le chef du WU-FHM qui regroupe deux professeurs personnels, deux professeurs associés et un professeur assistant et environ 30 scientifiques qui visent à comprendre le comportement des microbes associés aux aliments pour garantir la qualité et la sécurité des aliments. . Les domaines de recherche vont de la génomique et de l'écophysiologie à l'évaluation des risques liés aux micro-organismes associés à l'alimentation dans les chaînes d'approvisionnement alimentaire. Les deux aspects de la sécurité alimentaire, de la détérioration des aliments et de la fermentation sont étudiés. Nous offrons:
  • Un programme de formation complet, interactif et international couvrant les aspects plus larges et l'interface entre les sciences de la vie, la science des données, l'intelligence artificielle et les sciences humaines et sociales, ainsi que les compétences transférables.
  • Une équipe enthousiaste de professionnels avec qui coopérer.
  • Plan Personnel de Développement de Carrière (PDCP) pour préparer les jeunes chercheurs à leur future carrière
  • Chaque DC suivra une formation individuelle dans des instituts individuels selon la description du PCDP.
  • Une rémunération attractive et conforme au règlement du programme MSCA-DN pour les doctorants. Le salaire exact sera confirmé et sera basé sur une allocation de subsistance de 3400€/mois (facteur de correction à appliquer par pays) + allocation de mobilité de 600€/mois. Par ailleurs, les chercheurs peuvent également bénéficier d'une allocation familiale* de 660€/mois, selon leur situation familiale. Des déductions fiscales et sociales (y compris les pensions) basées sur les réglementations nationales et celles de l'entreprise s'appliqueront. 
*famille = être marié/être dans une relation de statut équivalent à un mariage reconnu par la législation du pays ou de la région où il a été formalisé/avoir des enfants à charge qui sont entretenus par le chercheur.

Prise de fonction :

01/10/2024

Nature du financement

Financement de l'Union européenne

Précisions sur le financement

Horizon Europe - Action Marie Skłodowska-Curie (MSCA) - Doctorat conjoint.

Présentation établissement et labo d'accueil

UNIVERSITÉ NATIONALE ET CAPODISTRIENNE D'ATHÈNES.
Descriptions des établissements d'accueil : L' Université nationale et capodistrienne d'Athènes ( NKUA), officiellement fondée le 14 avril 1837, est la première université non seulement de Grèce mais aussi de la péninsule balkanique et de la région de la Méditerranée orientale. Les principales sources de financement de NKUA sont des fonds européens, internationaux et nationaux, comme par exemple l'accord de partenariat (AP) pour le cadre de développement 2014-2020 (Fonds structurel et d'investissement européen ESIF), Horizon 2020, ainsi que des partenariats avec des organismes publics. et les organismes du secteur privé, la fourniture de services aux personnes morales et aux personnes physiques, les subventions et les dons. Le Département de chimie (DoC) sera impliqué dans le projet. DoC dispose d'une expertise, d'infrastructures et d'installations de pointe pour effectuer des recherches dans les domaines de la science alimentaire, de la chimie alimentaire, de la chimie environnementale et du diagnostic de l'eau. Il possède également une expertise dans la coordination et la mise en œuvre d'activités de recherche et de développement, de diffusion et d'exploitation avec des parties prenantes principalement nationales, par exemple l'Autorité alimentaire hellénique et des entreprises alimentaires privées qui exportent dans le monde entier. Les principales installations du Département de chimie de NKUA comprennent des systèmes de spectrométrie de masse de pointe à haute résolution (LC-TIMS-TOF/MS, LC-QTOF/MS, GC-APCI-QTOF/MS) utilisés pour l'analyse HRMS de l'empreinte moléculaire d'un produit alimentaire suite à des flux de travail avancés de criblage de cibles et de non-cibles. De plus, il existe un accès complet à l’analyse microbiologique appliquée des bactéries et des contaminants fongiques ainsi qu’aux techniques d’identification des mycotoxines. L'Université de Wageningen  est une organisation d'enseignement et de recherche de premier plan au niveau international dans le domaine des sciences de la vie, avec plus de 10 000 étudiants (dont 25 % étrangers). WU participe par l'intermédiaire du Laboratoire de microbiologie alimentaire, FHM (www.wur.nl/fhm). WU-FHM est dirigé par le professeur MH Zwietering et regroupe deux professeurs personnels, deux professeurs associés et un professeur assistant ainsi qu'environ 30 scientifiques qui visent à comprendre le comportement des microbes associés aux aliments afin de garantir la qualité et la sécurité des aliments. Les domaines de recherche vont de la génomique et de l'écophysiologie à l'évaluation des risques liés aux micro-organismes associés à l'alimentation dans les chaînes d'approvisionnement alimentaire. Les deux aspects de la sécurité alimentaire, de la détérioration des aliments et de la fermentation sont étudiés. L'Université de Wageningen dispose de laboratoires microbiologiques entièrement équipés pour la recherche sur la fermentation et pour la recherche sur la sécurité alimentaire (MLII).

Site Web :

Intitulé du doctorat

Bourse de doctorat en production de données multi-omiques pendant la fermentation des olives.

Pays d'obtention du doctorat

Grèce

Etablissement délivrant le doctorat

Université nationale et capodistrienne d'Athènes.

Thèse en cotutelle

Oui

Pays d'obtention du doctorat en cotutelle

Pays-Bas

Etablissement délivrant le doctorat en cotutelle

Université de Wageningen

Profil du candidat

Compétences/qualifications requises :
  • Master en Chimie Alimentaire, Chimie Analytique, Biotechnologie, Microbiologie Alimentaire.
  • Solide expérience en techniques analytiques avancées (spectrométrie de masse, RMN) et en approches omiques.
  • Expérience antérieure en programmation d’analyse de données et compétences statistiques.
  • Joueur d'équipe et ayant une attitude collaborative.
  • Des connaissances en bioinformatique seront considérées comme un atout.
  • Compétences en réseautage et en communication dans un environnement multiculturel et multidisciplinaire.
  • Volonté de voyager à l'étranger à des fins de recherche, de formation et de diffusion.
Critère d'éligibilité:
  • N'importe quelle nationalité
  • Candidat au doctorat (DC) :  Le candidat ne doit pas avoir obtenu de doctorat.
  • Règle de mobilité :  Le DC ne doit pas avoir résidé ou exercé une activité principale (travail, études, etc.) dans le pays de son organisation d'accueil pendant plus de 12 mois* au cours des trois années précédant immédiatement la date de sélection dans le même organisme de nomination. organisation internationale.
* EXCLUS : les courts séjours tels que les vacances, les services nationaux obligatoires tels que le service militaire obligatoire et les procédures d'obtention du statut de réfugié au titre de la Convention générale.
  • Langue :  les candidats doivent démontrer des capacités de lecture, d'écriture et d'expression orale courantes en anglais (B2).
15/05/2024

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Lieu de travail Athens – Grèce Intitulé du sujet MSCA – Doctorant (DC3) – Bourse de doctorat en production de données multi-omiques lors de la fermentation des olives. Champs scie...View more

Description

Le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo (CCHFV) [genre Orthonairovirus, famille Nairoviridae, ordre Bunyavirales), est transmis principalement par les tiques affectant hommes et animaux. La maladie passe presque inaperçue chez les hôtes animaux mais peut provoquer chez l'homme une fièvre hémorragique grave. Actuellement le virus circule en Afrique, en Asie et en Europe de l'Est. Depuis 2016, l'Espagne est confrontée à des cas humains, dont certains mortels, qui ont montré que le CCHFV circulait à bas bruit en Europe du Sud. Cette situation nous a incités à construire un projet pour une meilleure connaissance du CCHFV avant l'apparition de cas humains, c'est-à-dire dès les premiers stades d’'endémisation, afin d’en comprendre les mécanismes et de contribuer à l'atténuation et au contrôle des risques sanitaires associés à ces stades précoces. La présence du vecteur connu Hyalomma marginatum et la découverte récente de H. lusitanicum dans le sud de la France ont motivé la localisation de l'étude dans le sud de la France continentale et en Corse. Le risque d’émergence de la CCHF en France augmente donc du fait de : i) l'établissement de H. marginatum et H. lusitanicum dans le sud de la France ; ii) des preuves croissantes d'animaux domestiques et sauvages séropositifs, ainsi que iii) de l'apparition de cas humains de CCHF en Espagne au cours des dernières années. La description récente de ruminants possédant des anticorps anti-CCHF en Corse et sur le continent en France, en absence de cas humains diagnostiqués, peut s’expliquer par plusieurs scénarios qui ne s'excluent pas mutuellement. Un premier scénario suppose que le CCHFV a déjà été introduit en France et qu'il circule à bas bruit chez les tiques et les vertébrés en Corse et dans le sud de la France. La transmission du CCHFV dépend de l'exposition des animaux et des humains (hôtes accidentels du CCHFV) aux tiques vectrices et du degré d'infection de ces tiques par le virus. Ces deux paramètres peuvent être influencés par divers facteurs biotiques et abiotiques non contrôlés et non surveillés liés à l'hôte et son environnement (e.g. démographie, sensibilité à l'infection virale, comportements à risque, pratiques d'élevage, habitat et climat), qui peuvent survenir indépendamment ou conjointement selon la zone géographique. Un deuxième scénario suppose la circulation locale d'un virus suffisamment proche du CCHFV pour donner des sérologies positives chez le bétail, mais ne présentant pas de pathogénicité humaine, ce qui n'exclut pas le risque d’introduction du CCHFV à partir des pays endémiques vers la France. Dans ce contexte, l'évaluation de la situation épidémiologique est urgente, afin de comprendre la probabilité d'endémicité et les facteurs d'émergence du CCHFV dans la population humaine. La prévention et le contrôle de cas humains de CCHF nécessite de comprendre et de quantifier les processus d'émergence à l'interface animaux/tiques, ainsi que la manière dont les humains sont exposés. Grâce à une approche multidisciplinaire "One Health", alliant les sciences sociales, l'épidémiologie, la médecine, l'écologie, l'ornithologie, l'acarologie et la virologie, le projet ARCHE vise à comprendre les déterminants de l'émergence du CCHFV dans différentes régions du sud de la France où des animaux séropositifs ont été détectés. Les différentes parties permettront : (i) d'identifier les multiples facteurs favorisant à la fois l'émergence et les risques de transmission, (ii) d'améliorer les méthodes de détection du CCHFV et d'estimer la circulation de ce virus et d'autres orthonairovirus, (iii) de modéliser la dynamique de transmission du CCHFV, (iv) de co-construire et de diffuser des actions préventives grâce à des approches socio-écologiques et de sciences participatives. Le projet est conçu à travers six work packages complémentaires intégrés et implique 11 équipes de chercheurs reconnues internationalement et disposant de l'expertise interdisciplinaire requise. Le doctorant sera impliqué dans les objectifs 1 et 2.

Offre financée

Type de financement
INSERM, Région

Dates

Date limite de candidature 20/04/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création29/03/24

Langues

Niveau de français requisB2 (intermédiaire)

Niveau d'anglais requisB2 (intermédiaire)

Possibilité de faire sa thèse en anglais

Divers

Frais de scolarité annuels0 € / an

Responsable

Docteur Alessandra FALCHI

Contact

Docteur Alessandra FALCHI

 falchi_a@univ-corse.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description Le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo (CCHFV) [genre Orthonairovirus, famille Nairoviridae, ordre Bunyavirales), est transmis principalement par les tiques affectant hom...View more

Description

Les modifications post-traductionnelles des protéines (PTM) sont des modifications chimiques réversibles et irréversibles déposées sur la chaîne latérale des acides aminés de la plupart des protéines. Ces décorations peuvent être dynamiques et utilisées comme un switch moléculaire efficace et rapide permettant aux cellules d’ajuster l'activité de la protéine en réponse aux signaux environnementaux. Par conséquent, l'étude de la régulation des PTM chez des organismes sessiles comme les plantes est particulièrement intéressant dans le contexte du changement climatique. Parmi ces PTM, la méthylation de l'arginine/du résidu R (R-met) est une modification très conservée et assurée par une famille d'enzymes arginine/méthyltransférase (PRMT). Les voies régulées par R-met sont impliquées dans des processus biologiques clés, principalement étudiés chez les animaux, tels que la réponse aux dommages de l'ADN, le cycle et la différenciation cellulaire, le transport, la signalisation et l'expression des gènes (réf. 1-2). Cependant, le rôle de la régulation par R-met dans le développement des plantes et dans leur réponse aux stress est encore largement sous-estimé (réf. 3-5). Les PRMT sont classées en trois groupes (type I, II et III) selon la nature du groupe de méthylation déposé sur leur substrat (réf. 6). Nos travaux sur la plante modèle Arabidopsis thaliana ont révélé l'existence d'interactions fonctionnelles entre les enzymes PRMTs, mécanisme qui demeure jusqu'à présent non décrit chez les plantes. Nous proposons un sujet de thèse qui s’intègre dans un projet visant à étudier la pertinence biologique de ces connexions PRMTs dans le développement des plantes et en réponse à l'environnement. Il sera plus précisément orienté vers l’étude de la contribution de ces connexions sur la régulation des voies de RNA silencing chez A. thaliana (ref 7), notamment dans des contextes de stress biotiques et abiotiques. 1. Lorton BM, Shechter D. Cellular consequences of arginine methylation. Cell Mol Life Sci. 2019 Aug;76(15):2933-2956. 2. Kim H, Ronai ZA. PRMT5 function and targeting in cancer. Cell Stress. 2020 Jul 13;4(8):199-215. 3. Pei Y, Niu L, Lu F, Liu C, Zhai J, Kong X, Cao X. Mutations in the Type II protein arginine methyltransferase AtPRMT5 result in pleiotropic developmental defects in Arabidopsis. Plant Physiol. 2007 Aug;144(4):1913-23. 4. Scebba F, De Bastiani M, Bernacchia G, Andreucci A, Galli A, Pitto L. PRMT11: a new Arabidopsis MBD7 protein partner with arginine methyltransferase activity. Plant J. 2007 Oct;52(2):210-22. 5. Niu L, Zhang Y, Pei Y, Liu C, Cao X. Redundant requirement for a pair of PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE4 homologs for the proper regulation of Arabidopsis flowering time. Plant Physiol. 2008 Sep;148(1):490-503. 6. Blanc RS, Richard S. Arginine Methylation: The Coming of Age. Mol Cell. 2017 Jan 5;65(1):8-24. 7. Hu P, Zhao H, Zhu P, Xiao Y, Miao W, Wang Y, Jin H. Dual regulation of Arabidopsis AGO2 by arginine methylation. Nat Commun. 2019 Feb 19;10(1):844.

Compétences requises

Recherche candidat motivé par la recherche et détenteur d'un Master de biologie ayant une composante significative d'enseignements de génétique, de biologie moléculaire et de physiologie végétale. L’utilisation du logiciel R serait un plus.

Bibliographie

1. Lorton BM, Shechter D. Cellular consequences of arginine methylation. Cell Mol Life Sci. 2019 Aug;76(15):2933-2956. 2. Kim H, Ronai ZA. PRMT5 function and targeting in cancer. Cell Stress. 2020 Jul 13;4(8):199-215. 3. Pei Y, Niu L, Lu F, Liu C, Zhai J, Kong X, Cao X. Mutations in the Type II protein arginine methyltransferase AtPRMT5 result in pleiotropic developmental defects in Arabidopsis. Plant Physiol. 2007 Aug;144(4):1913-23. 4. Scebba F, De Bastiani M, Bernacchia G, Andreucci A, Galli A, Pitto L. PRMT11: a new Arabidopsis MBD7 protein partner with arginine methyltransferase activity. Plant J. 2007 Oct;52(2):210-22. 5. Niu L, Zhang Y, Pei Y, Liu C, Cao X. Redundant requirement for a pair of PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE4 homologs for the proper regulation of Arabidopsis flowering time. Plant Physiol. 2008 Sep;148(1):490-503. 6. Blanc RS, Richard S. Arginine Methylation: The Coming of Age. Mol Cell. 2017 Jan 5;65(1):8-24. 7. Hu P, Zhao H, Zhu P, Xiao Y, Miao W, Wang Y, Jin H. Dual regulation of Arabidopsis AGO2 by arginine methylation. Nat Commun. 2019 Feb 19;10(1):844.

Mots clés

Modifications post-traductionnelles, Plantes, Réponse aux stress, RNA silencing, PRMT Protein arginine methyl transferase)

Offre boursier / non financée

Ouvert à tous les pays

Dates

Date limite de candidature 01/06/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisB1 (pré-intermédiaire)

Niveau d'anglais requisB1 (pré-intermédiaire)

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Responsable

Monsieur Thierry LAGRANGE

Contact

Monsieur Thierry LAGRANGE

 04 68 66 21 17

 thierry.lagrange@univ-perp.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description Les modifications post-traductionnelles des protéines (PTM) sont des modifications chimiques réversibles et irréversibles déposées sur la chaîne latérale des acides aminés de la pl...View more

Description

Contexte scientifique: La régulation post transcriptionnelle permet de moduler finement le devenir des transcrits. Chez les animaux, une famille de protéines, les MUSASHI, est particulièrement impliquée dans ce processus et participe ainsi au contrôle de la différenciation cellulaire et du devenir des cellules (https://doi.org/10.3390/biology10050407). Nous avons récemment identifié chez la plante modèle Arabidopsis thaliana une famille de protéines (MSIlike) qui présente les mêmes caractéristiques que les MSI animales (https://doi.org/10.7554/eLife.88207.1). Les objectifs de ce projet de thèse, font partie d'un projet ANR, et ont pour but d’identifier tous les transcrits ciblés par les protéines MSIlike chez Arabidopsis thaliana (P1) et caractériser leur mode d’action (P2). L’implication des protéines MSIlike dans la réponse aux stress sera également étudiée (P3). P1. Afin d'identifier tous les transcrits directement et spécifiquement recrutés par les MSIlike il est nécessaire d’adopter une approche la plus spécifique possible telle que la technique HyperTRIBE (Targets of RNA-binding proteins Identified By Editing) qui permet d’éditer spécifiquement les transcrits liés à la protéine d’intérêt (https://doi.org/10.1038/s41467-020-15814-8). Pour cela la séquence codante des MSIlike sera fusionnée avec celle du domaine catalytique de l’adénosine déaminase du mutant catalytique E488Q de drosophile (DmADARE488Qcd). Une fois introduite dans le mutant msilike la protéine fusion MSIlike::DmADAR fixera les transcrits ciblés, les éditera et un séquençage des transcrits (RNA seq) permettra alors d’identifier les cibles directes des MSIlike. Des approches complémentaires pour SELEX (Systematic Evolution of Ligands by EXponential Enrichment) et/ou RIP pourront aussi être réalisées (https://doi: 10.2144/000114567). Les cibles potentielles seront ensuite confirmées. P2. Les cibles identifiées par WP1 serviront d’outils d’analyse pour caractériser le mode d’action des MSILike chez Arabidopsis. Les profils d’accumulation des cibles et des protéines qu’elles codent seront analysés à la fois dans des plants sauvages, mais aussi mutés dans les gènes MSIlike. La stabilité des transcrits, leurs maturations ainsi que les profils de polysomes seront alors caractérisés . Parce que les protéines MSIlike possèdent des sites de fixation de protéines Argonautes (AGO) le rôle de ces dernières sera sera étudié au même titre que l'implication de petits ARN régulateurs. P3. En raison de caractéristiques particulières des protéines MSIlike leur implication dans la réponse aux stress sera analysée en comparant la résistance de plantes sauvages et de mutants msil. Ce projet de thèse reposera sur l’utilisation de nombreux outils de biologie moléculaire, de biochimie des protéines, des immunoprécipitations d’ARN et des analyses de RNAseq seront aussi développés.

Compétences requises

Le(la) candidat(e) devra être passionné et investi dans son travail. Savoir travailler en équipe et être rapidement autonome pour la réalisation des expérimentations classiques. Il(elle) devra s'intégrer au fonctionnement du laboratoire et pourra si il (elle) le veut réaliser au cours de la thèse des enseignements. Il (elle) devra avoir des connaissances en biologie moléculaire, biochimie, génétique et physiologie.

Bibliographie

Arribas-Hernández, L., Rennie, S., Schon, M., Porcelli, C., Enugutti, B., Andersson, R., Nodine, M. D., & Brodersen, P. (2021). The YTHDF proteins ECT2 and ECT3 bind largely overlapping target sets and influence target mRNA abundance, not alternative polyadenylation. ELife, 10, e72377. https://doi.org/10.7554/eLife.72377 Cragle, C. E., MacNicol, M. C., Byrum, S. D., Hardy, L. L., Mackintosh, S. G., Richardson, W. A., Gray, N. K., Childs, G. V., Tackett, A. J., & MacNicol, A. M. (2019). Musashi interaction with poly(A)-binding protein is required for activation of target mRNA translation. Journal of Biological Chemistry, 294(28), 1096910986. https://doi.org/10.1074/jbc.RA119.007220 Fox, R. G., Park, F. D., Koechlein, C. S., Kritzik, M., & Reya, T. (2015). Musashi Signaling in Stem Cells and Cancer. Annual Review of Cell and Developmental Biology, 31(1), 249267. https://doi.org/10.1146/annurev-cellbio-100814-125446 Jadhav, S., Ajay, A. K., Trivedi, P., Seematti, J., Pellegrini, K., Craciun, F., & Vaidya, V. S. (2016). RNA-binding Protein Musashi Homologue 1 Regulates Kidney Fibrosis by Translational Inhibition of p21 and Numb mRNA. Journal of Biological Chemistry, 291(27), 1408514094. https://doi.org/10.1074/jbc.M115.713289 Kairouani, A., Pontier, D., Picart, C., Mounet, F., Martinez, Y., Le-Bot, L., Fanuel, M., Hammann, P., Belmudes, L., Merret, R., Azevedo, J., Carpentier, M.-C., Gagliardi, D., Couté, Y., Sibout, R., Bies-Etheve, N., & Lagrange, T. (2023). Cell type-specific control of secondary cell wall formation by Musashi-type translational regulators in Arabidopsis [Preprint]. elife. https://doi.org/10.7554/eLife.88207.1 Kawahara, H., Okada, Y., Imai, T., Iwanami, A., Mischel, P. S., & Okano, H. (2011). Musashi1 Cooperates in Abnormal Cell Lineage Protein 28 (Lin28)-mediated Let-7 Family MicroRNA Biogenesis in Early Neural Differentiation. Journal of Biological Chemistry, 286(18), 1612116130. https://doi.org/10.1074/jbc.M110.199166 Nahas, G. R., Murthy, R. G., Patel, S. A., Ganta, T., Greco, S. J., & Rameshwar, P. (2016). The RNA‐binding protein Musashi 1 stabilizes the oncotachykinin 1 mRNA in breast cancer cells to promote cell growth. The FASEB Journal, 30(1), 149159. https://doi.org/10.1096/fj.15-278770 Nakamura, M., Okano, H., Blendy, J. A., & Montell, C. (1994). Musashi, a neural RNA-binding protein required for drosophila adult external sensory organ development. Neuron, 13(1), 6781. https://doi.org/10.1016/0896-6273(94)90460-X Nguyen, D. T. T., Lu, Y., Chu, K. L., Yang, X., Park, S.-M., Choo, Z.-N., Chin, C. R., Prieto, C., Schurer, A., Barin, E., Savino, A. M., Gourkanti, S., Patel, P., Vu, L. P., Leslie, C. S., & Kharas, M. G. (2020). HyperTRIBE uncovers increased MUSASHI-2 RNA binding activity and differential regulation in leukemic stem cells. Nature Communications, 11(1), 2026. https://doi.org/10.1038/s41467-020-15814-8 Reichel, M., Liao, Y., Rettel, M., Ragan, C., Evers, M., Alleaume, A.-M., Horos, R., Hentze, M. W., Preiss, T., & Millar, A. A. (2016). In Planta Determination of the mRNA-Binding Proteome of Arabidopsis Etiolated Seedlings. The Plant Cell, 28(10), 24352452. https://doi.org/10.1105/tpc.16.00562 Shibata, S., Umei, M., Kawahara, H., Yano, M., Makino, S., & Okano, H. (2012). Characterization of the RNA-binding protein Musashi1 in zebrafish. Brain Research, 1462, 162173. https://doi.org/10.1016/j.brainres.2012.01.068 Sutherland, J. M., Fraser, B. A., Sobinoff, A. P., Pye, V. J., Davidson, T.-L., Siddall, N. A., Koopman, P., Hime, G. R., & McLaughlin, E. A. (2014). Developmental Expression of Musashi-1 and Musashi-2 RNA-Binding Proteins During Spermatogenesis : Analysis of the Deleterious Effects of Dysregulated Expression1. Biology of Reproduction, 90(5). https://doi.org/10.1095/biolreprod.113.115261 Sutherland, J. M., Sobinoff, A. P., Fraser, B. A., Redgrove, K. A., Davidson, T., Siddall, N. A., Koopman, P., Hime, G. R., & McLaughlin, E. A. (2015). RNA binding protein Musashi‐1 directly targets Msi2 and Erh during early testis germ cell development and interacts with IPO5 upon translocation to the nucleus. The FASEB Journal, 29(7), 27592768. https://doi.org/10.1096/fj.14-265868 Uren, P. J., Vo, D. T., de Araujo, P. R., Pötschke, R., Burns, S. C., Bahrami-Samani, E., Qiao, M., de Sousa Abreu, R., Nakaya, H. I., Correa, B. R., Kühnöl, C., Ule, J., Martindale, J. L., Abdelmohsen, K., Gorospe, M., Smith, A. D., & Penalva, L. O. F. (2015). RNA-Binding Protein Musashi1 Is a Central Regulator of Adhesion Pathways in Glioblastoma. Molecular and Cellular Biology, 35(17), 29652978. https://doi.org/10.1128/MCB.00410-15 Vo, D. T., Subramaniam, D., Remke, M., Burton, T. L., Uren, P. J., Gelfond, J. A., de Sousa Abreu, R., Burns, S. C., Qiao, M., Suresh, U., Korshunov, A., Dubuc, A. M., Northcott, P. A., Smith, A. D., Pfister, S. M., Taylor, M. D., Janga, S. C., Anant, S., Vogel, C., & Penalva, L. O. F. (2012). The RNA-Binding Protein Musashi1 Affects Medulloblastoma Growth via a Network of Cancer-Related Genes and Is an Indicator of Poor Prognosis. The American Journal of Pathology, 181(5), 17621772. https://doi.org/10.1016/j.ajpath.2012.07.031

Mots clés

regulation traductionelle, ARN messagers, développement, différenciation cellulaire, stress granule

Offre financée

Type de financement
Contrat Doctoral
Pays

Mexique (Conacyt)

Si vous êtes une institution d'accueil française, vous trouverez plus d'information sur ce programme à cette page

Chine (CSC)

Dates

Date limite de candidature 30/04/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/09/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisB2 (intermédiaire)

Niveau d'anglais requisB2 (intermédiaire)

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Site web

Responsable du programme

Madame Natacha BIES-ETHEVE

Contact

Madame Natacha BIES-ETHEVE

 04 68 66 22 26

 nbies@univ-perp.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description Contexte scientifique: La régulation post transcriptionnelle permet de moduler finement le devenir des transcrits. Chez les animaux, une famille de protéines, les MUSASHI, est particuli...View more

Cette bourse est une initiative conjointe avec le  Mo IbrahimFondation. Il offre aux candidats en début ou à mi-parcours de leur carrière la possibilité de passer dix mois à Chatham House pour travailler sur un projet de recherche individuel de leur choix.

Les boursiers participent aux travaux de base de l'Institut, développant leurs compétences grâce au programme de leadership et approfondissant leur réseau professionnel dans le domaine des affaires internationales.

Les candidatures sont ouvertes de 18h00 GMT le 25 mars à 11h00 BST le 22 avril 2024.

Exigences et structure de la bourse

Citoyenneté

La bourse est ouverte aux citoyens de n’importe quel pays africain. Les candidatures seront également acceptées des candidats ayant une double nationalité qui inclut n’importe quel pays africain.

Éducation

Les candidats doivent être titulaires d’un baccalauréat ou équivalent et avoir de l’expérience dans la conduite de recherches.

Carrière

Le candidat idéal doit être au début ou au milieu de sa carrière et provenir de l'un des domaines ou travaux suivants : milieu universitaire, ONG, entreprises, ministères gouvernementaux, société civile ou médias. Tous les candidats doivent posséder une connaissance et un intérêt pour les affaires internationales, le domaine de recherche qu'ils ont choisi, ainsi que la mission et la recherche de Chatham House.

Restrictions d'âge

Nous n'imposons aucune restriction d'âge aux candidats.

Puis-je entreprendre un autre travail ou étudier en même temps que ma bourse ?

Les boursiers sont censés travailler à temps plein pour obtenir leur bourse et il n'est donc pas possible d'entreprendre une bourse en même temps qu'ils poursuivent un travail ou des études.

Les candidatures sont ouvertes de 18h00 GMT le 25 mars à 11h00 BST le 22 avril 2024.

Durée

Les Academy Fellows passeront dix mois à Chatham House entre octobre 2024 et juillet 2025.

Emplacement

Le boursier sera basé à temps plein à Chatham House, Londres, avec un travail hybride également possible.

Le temps d'un boursier sera réparti entre trois domaines clés : 
  • Réalisation d'un projet de recherche personnel : le boursier choisira et concevra un projet personnel à entreprendre avec les conseils d'un expert de Chatham House (environ 60 %).
  • Programme de leadership : c'est un élément clé de toutes les bourses. Il vise à développer les connaissances des boursiers, leur réseau, leur conscience de soi et à les doter de compétences importantes sur lesquelles ils pourront s'appuyer dans leur future carrière en tant que leaders dans leur domaine (environ 20 %).
  • Contribuer aux activités de recherche en cours : en travaillant avec leur équipe de recherche hôte et d'autres équipes de Chatham House, le cas échéant, les boursiers contribueront aux priorités de recherche existantes conformément à la mission de Chatham House (environ 20 %).

Programme de leadership

Tous les boursiers participent et contribuent au programme de leadership qui comprend les éléments suivants :
  • Semaine d'intégration intensive Les bourses de l'Académie commencent par une semaine d'intégration intensive de cinq jours pour se familiariser avec les éléments des bourses, rencontrer leur programme de recherche d'accueil et bénéficier de leur première séance de coaching de développement personnel.
  • Séminaires de discussion Au cours de ces sessions, les boursiers se réunissent et discutent des défis actuels des affaires internationales avec des experts en la matière de Chatham House et d'ailleurs. Les sessions couvrent les principaux domaines de fond et de compétences essentiels à un leadership international informé et efficace. Les boursiers président généralement ces sessions et sont censés contribuer et apprendre de l'expérience de chacun.
  • Ateliers de leadership Tous les deux mois, les boursiers participent à des ateliers d'une demi-journée axés sur le développement des compétences dans des aspects spécifiques du leadership tels que « Le leadership dans un nouveau rôle » et « Favoriser l'innovation et l'entrepreneuriat ».
  • Présentations de projets Les boursiers présentent des mises à jour sur leurs projets de recherche pour aider à développer leurs compétences en matière de présentation, fournir un forum d'évaluation par les pairs et analyser des questions en dehors de leur propre domaine d'expertise.
  • Coaching de développement personnel Les boursiers ont accès à des séances individuelles avec un coach dédié afin de développer leur conscience de soi. Les boursiers travaillent avec le coach pour fixer des objectifs de développement personnel qu'ils s'efforcent d'atteindre pendant leur bourse et au-delà.
  • Formation aux médias Les boursiers acquièrent les compétences d'interview efficaces nécessaires à la télévision et à la radio, aboutissant à une simulation d'interview à partir de laquelle ils reçoivent des commentaires sur le style et les domaines d'amélioration.
  • Petits-déjeuners d'information «Le leadership au 21e siècle» Tous les boursiers bénéficient d'un accès prioritaire à la série de petits-déjeuners d'information «Le leadership au 21e siècle». Là, ils ont l'occasion de discuter de leurs expériences de leadership et d'apprendre dans un cadre informel avec des dirigeants du gouvernement, du monde des affaires, des médias et des secteurs à but non lucratif.
  • Mentorat de carrière (facultatif) Le développement des boursiers est facilité et soutenu en les associant à des mentors pour améliorer leurs perspectives et leur cheminement de carrière.

Rémunération et avantages

Le boursier recevra une allocation mensuelle de 2 365 £ qui couvrira les frais de subsistance à Londres, y compris l'hébergement, les services publics, la nourriture, le transport et d'autres dépenses de base. L’Académie couvre les frais raisonnables liés à :
  • Déménagement, par exemple vols, train, autres moyens de transport vers et depuis le Royaume-Uni, trois nuits d'hébergement, visas, valises ou cartons supplémentaires, etc. ;
  • Paiement de l'Immigration Healthcare Surcharge du Royaume-Uni qui permet d'accéder au National Health Service du Royaume-Uni (Remarque : vous devrez peut-être payer pour des traitements dentaires et optiques et des médicaments prescrits par un médecin) ; et
  • Frais de recherche, de sensibilisation et de diffusion, par exemple travaux sur le terrain, déplacements, conférences, publications, tables rondes, événements, etc.
Après avoir terminé avec succès leur bourse, les anciens élèves bénéficient d'un accès à :
  • Les professeurs et anciens élèves de l’Académie ; et 
  • Adhésion de cinq ans à Chatham House.

Pour postuler à cette bourse, nous avons besoin de :

  • Le CV du candidat
  • Les noms de  deux  arbitres
  • La proposition du candidat pour un projet de recherche basé sur l' orientation thématique

Les critères de sélection:

  • Répondre aux critères de nationalité ;
  • Avoir de l'expérience dans la conduite de recherches indépendantes et détenir un diplôme de premier cycle ou de troisième cycle ou avoir une formation ou une expérience professionnelle équivalente dans un domaine pertinent ;
  • Posséder une expérience pertinente, y compris une expérience dans le domaine de la recherche proposée, telle que démontrée par un CV ;
  • Avoir une expérience ou un potentiel avéré en leadership ;
  • Faire preuve d'engagement envers la mission, les objectifs et les valeurs de Chatham House et identifier des solutions fondées sur des preuves à certains des défis internationaux les plus urgents au monde ;
  • Être capable de communiquer comment la bourse leur permettra de créer un impact positif, conformément à la mission de Chatham House et à l'objectif primordial des bourses de l'Académie, comme indiqué ci-dessus ;
  • Faire preuve de motivation pour entreprendre la bourse, atteindre tous les livrables de la bourse et profiter pleinement des réseaux, des événements et des opportunités offerts à Chatham House ; et
  • Démontrer la maîtrise de l’anglais parlé.

Processus de sélection:

  • Première étape : compléter le dossier. Une fois la période de soumission terminée, toutes les candidatures seront examinées et présélectionnées par notre comité de sélection.
  • Deuxième étape : les candidats présélectionnés seront invités à un entretien via Zoom. Les entretiens sont menés par un membre de la haute direction de Chatham House et des représentants du programme concernés. Après ce tour, les boursiers seront sélectionnés et informés par e-mail.

Appliquer

Les candidatures sont ouvertes

Postulez pour la bourse de l’Académie Mo Ibrahim. Les candidatures sont ouvertes de 18h00 GMT le 25 mars à 11h00 BST le 22 avril 2024.

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةStage et Formation

Cette bourse est une initiative conjointe avec le  Mo IbrahimFondation. Il offre aux candidats en début ou à mi-parcours de leur carrière la possibilité de passer dix mois à Chatham House pour ...View more

Description

Les simulations numériques de chromodynamique quantique (QCD) sur réseau souffrent du problème de “ralentissement critique” lorsque la maille est fine, c'est à dire lorsqu'on se rapproche de la limite du continu, qui est un point d'attraction critique. Le principal symptôme du phénomène est une croissance exponentielle du temps d'autocorrélation des observables obtenues par simulation Monte-Carlo par chaîne de Markov. Les erreurs statistiques sont alors très largement sous-estimées, les ensembles construits à ces mailles sont même biaisés. Une observable particulièrement sensible à ces effets est la charge topologique. Le sujet de thèse propose d’examiner si une alternative au Markov Chain Monte-Carlo, nommée Event Chain Monte-Carlo, est un algorithme intéressant pour les théories de champ sur réseau du point de vue du ralentissement critique. Le modèle CP(n-1) et la théorie de jauge SU(3) seront plus particulièrement explorées.

Compétences requises

Très bonne connaissance des concepts fondamentaux de la théorie statistique des champs; Implémentation d'algorithmes dans un langage 'de bas niveau', typiquement en C/C++

Bibliographie

S. Schaefer et al. [ALPHA], ``Critical slowing down and error analysis in lattice QCD simulations,'' Nucl. Phys. B 845, 93-119 (2011) doi:10.1016/j.nuclphysb.2010.11.020 [arXiv:1009.5228 [hep-lat]]. A. Laio, G. Martinelli and F. Sanfilippo, ``Metadynamics surfing on topology barriers: the $CP^{N−1}$ case,'' JHEP 07, 089 (2016) doi:10.1007/JHEP07(2016)089 [arXiv:1508.07270 [hep-lat]]. T. Eichhorn, G. Fuwa, C. Hoelbling and L. Varnhorst, ``Parallel Tempered Metadynamics: Overcoming potential barriers without surfing or tunneling,'' [arXiv:2307.04742 [hep-lat]]. Thèse de Manon Michel sur 'Event-Chain Monte-Carlo': https://theses.hal.science/tel-01394204

Mots clés

Simulations Monte-Carlo proches du point critique, Théorie de Yang-Mills sur réseau, Event Chain Monte-Carlo et ses applications à la théorie quantique des champs

Offre boursier / non financée

Ouvert à tous les pays

Dates

Date limite de candidature 15/04/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisAucun

Niveau d'anglais requisC1 (autonome)

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Responsable

Monsieur Benoît BLOSSIER

Contact

Monsieur Benoît BLOSSIER

 benoit.blossier@ijclab.in2p3.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description Les simulations numériques de chromodynamique quantique (QCD) sur réseau souffrent du problème de “ralentissement critique” lorsque la maille est fine, c’est à dire lorsqu̵...View more

Description

La pigmentation des biominéraux d'oursins implique l'encapsulation d'une famille de molécules de naphtoquinones polyhydroxylées (PHNQ) pendant la croissance des cristaux de carbonate de calcium. Différentes teintes sont observées chez différentes espèces, mais aussi au sein d'une même espèce, à la fois dans le squelette (Figure A) et dans certaines épines (Figure B). Ces différentes couleurs sont probablement dues à la présence de différents complexes de type PHNQs-macromolécules (thèse de C. dos Reis Ferreira). Cependant, l'origine de la distribution spatiale spécifique probablement en relation avec la microstructure (Figure D) et E) reste inconnue. Par conséquent, dans cette thèse, nous proposons 1) d'étudier la distribution spatiale des complexes PHNQ-macromolécules dans le squelette et les épines de différentes espèces en relation avec le réseau 3D trabéculaire et 2) de comprendre la formation d'une telle structure par des approches biomimétiques impliquant la synthèse de matrices 3D. Un large panel de techniques d'imagerie sera utilisé incluant les microscopies optique, multi-spectrale, à photoémission, SHG et la spectroscopie Raman dont certaines ont déjà montré leur pertinence pour la problématique soulevée dans le point 1) ci-dessus. Les propriétés d'auto-assemblage des PHNQs et des complexes PHNQ-macromolécules après extraction des biominéraux seront étudiées ainsi que celles des molécules analogues telles que la naphtazarine qui constituent de bons modèles (doctorat de V. Sardhalia). Enfin, des matrices biomimétiques seront produites sous forme d'hydrogels contenant des complexes PHNQ-macromolécules précédemment extraits et des molécules analogues afin de comprendre et de valider les mécanismes de formation de ces structures colorées.

Compétences requises

Le candidat doit avoir un Master 2 en chimie. Des connaissances dans le domaine de la biominéralisation sont grandement appréciées notamment sur les invertébrés.

Bibliographie

PhD manuscript of V. Sardhalia

Mots clés

Biominéralisation, pigments organiques , Biomimétisme, Matrice en 3D, Oursins, couleurs

Offre financée

Type de financement
Contrat Doctoral

Dates

Date limite de candidature 15/04/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisAucun

Niveau d'anglais requisAucun

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Responsable

Madame Nadine NASSIF

Contact

Madame Nadine NASSIF

 nadine.nassif@sorbonne-universite.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description La pigmentation des biominéraux d’oursins implique l’encapsulation d’une famille de molécules de naphtoquinones polyhydroxylées (PHNQ) pendant la croissance des crista...View more

Description

La production de polymères à partir d’acide gras permet d’obtenir des résines polyamides performantes par exemple pour la production d’adhésifs. Patrice Castignolles a ainsi participé au développement d’un adhésif thermofusible industriel à base de résines polyamides. Les acides gras permettent de synthétiser un mélange de monomères, nommé acide dimère. La production de polyamides à partir d’acides dimères se heurte au problème, courant en biosourçage, de variabilité de la biomasse selon l’huile et acide gras de départ. Les résines polyamides sont confinées à des marchés de niches, comme polymères de spécialité. Une stratégie consiste à purifier les acides dimères avant de les polymériser. Elle a été explorée avec succès par Philippe Guégan, mais son impact est limité par les coûts, financiers et environnementaux, de la purification pour une pureté quand même inférieure à celle des équivalents pétrosourcés. Le projet ANR mono-équipe 3DBIOBASED, porté par Patrice Castignolles et avec Philippe Guégan, a commencé en décembre 2023. Il explore une voie alternative : polymériser les acides dimères sans les purifier. Le projet a notamment déjà montré que des dizaines de molécules différentes sont présentes dans ces acides dimères, avec des agents de terminaison (monoacides), des monomères difonctionnels (diacides) et des monomères trifonctionnels (triacides). Les triacides donnent naissance à un polyamide ramifié, donc une résine et non un nylon. L’objectif de ce projet est d’établir les relations entre la composition chimique des acides dimères et la structure (masses molaires, ramifications) des polyamides ainsi que leurs propriétés thermiques voire mécaniques. Ces objectifs pourront d’abord être remplis en s’appuyant sur les nouvelles méthodes de séparation et caractérisation développées dans le projet ANR 3DBIOBASED. Ces méthodes seront adaptées au suivi de la conversion des différentes molécules dans les acides dimères lors de la polymérisation. Il n’y a ensuite pas de méthode établie pour caractériser les ramifications dans les polyamides (degré de ramification, longueur des branches, répartition des branches sur le squelette, hétérogénéité des ramifications entre les macromolécules) ou même leurs masses molaires. Ceci est notamment dû à l’absence de connaissances fondamentales sur la solubilité des résines polyamides dans les solvants disponibles en analyses RMN et chromatographique. Les solubilités macroscopiques, macromoléculaire et moléculaire (solvatation) seront caractérisées dans ce travail pour permettre la détermination des méthodes de caractérisation possibles. Les masses molaires, degrés de ramification et leurs hétérogénéités (dispersités) seront déterminées ainsi que leur précision et leur justesse. Cela permettra d’établir mais aussi de valider les relations synthèse-structure-propriétés. La caractérisation sera effectuée par des méthodes conventionnelles, disponibles et maîtrisées à l’IPCM : RMN, chromatographie d’exclusion stérique, avec évaluation de leurs performances et limitations. Des méthodes nouvelles seront aussi appliquées à ces polymères : électrophorèse capillaire et spectrométrie de masse electrospray (ESI-MS) pour les monomères biosourcés, analyse de la dispersion de Taylor pour les polyamides. L’électrophorèse capillaire, méthode très utilisée en biologie et biochimie, est appliquée aux polymères biosourcés avec succès par Patrice Castignolles. La MS se fait en collaboration avec l’équipe CSOB de l’IPCM et l’analyse de la dispersion de Taylor avec le groupe du Prof. Hervé Cottet (Université de Montpellier). Les preuves de concept acquises à travers ce programme de doctorat, et la recherche fondamentale accomplie ici, permettront de continuer le projet (à l’issue du doctorat) par des collaborations non seulement avec les producteurs des monomères biosourcés français ou étrangers, mais aussi avec les utilisateurs, actuels ou potentiels, de résines polyamides.

Compétences requises

Chimie des polymères: polymérisation. Séparation et caractérisation des polymères: SEC. Caractérisation des polymères: RMN, DSC.

Bibliographie

[1] KA Bhullar, A Meinel, K Maeder, R Wuhrer, M Gaborieau, P Castignolles, Advanced spectroscopy, microscopy, diffraction and thermal analysis of polyamide adhesives and prediction of their functional properties [...], Polymer Chemistry 12 (2021) 1487-97. [2] PJ Roumanet, N Jarroux, L Goujard, J Le Petit, Y Raoul, V Bennevault, P Guegan, Synthesis of linear polyesters from monomers based on 1,18-(Z)-octadec-9-enedioic acid and their biodegradability, ACS Sustainable Chemistry & Engineering 8 (2020) 16853-60. [3] JD Oliver, M Gaborieau, EF Hilder, P Castignolles, Simple and robust determination of monosaccharides in plant fibers in complex mixtures by capillary electrophoresis and high performance liquid chromatography, Journal of Chromatography A 1291 (2013) 179-86. [4] M Gaborieau, TJ Causon, Y Guillaneuf, EF Hilder, P Castignolles, Molecular weight and tacticity of oligoacrylates by CE-MS, Australian Journal of Chemistry 63 (2010) 1219-26. [5] JJ Thevarajah, JC Bulanadi, M Wagner, M Gaborieau, P Castignolles. Towards a less biased dissolution of chitosan. Analytica Chimica Acta, 935 (2016) 258-68. [6] M Gaborieau, P Castignolles, Size-exclusion chromatography (SEC) of branched polymers and polysaccharides. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 399 (2011) 1413-23.

Mots clés

monomères biosourcés, résines polyamides, acide dimère, relations structure-synthèse, ramifications, masses molaires

Offre financée

Type de financement
Contrat Doctoral

Dates

Date limite de candidature 15/04/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisAucun

Niveau d'anglais requisA2 (élémentaire)

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Responsable

Monsieur Patrice CASTIGNOLLES

Contact

Monsieur Patrice CASTIGNOLLES

 +33767259276

 patrice.castignolles@sorbonne-universite.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description La production de polymères à partir d’acide gras permet d’obtenir des résines polyamides performantes par exemple pour la production d’adhésifs. Patrice Castignolles a ainsi partici...View more

Doctorat Doctorat complet
Disciplines
Génie Civil
Laboratoire
LABORATOIRE MATERIAUX ET DURABILITE DES CONSTRUCTIONS (LMDC) - EA 3027
Institution d'accueil
Ecole doctorale
Mécanique, énergétique, génie civil, procédés (MEGEP) - ED 468

Description

Les objectifs de neutralité carbone d'ici à 2050 représentent un véritable défi pour le secteur de la construction, exigeant une réduction urgente de l'impact environnemental de la production de ciment. Actuellement, l'une des approches les plus prometteuses pour réduire la consommation d'énergie et les émissions de CO2 à moindre coût consiste à améliorer la durabilité du béton en optimisant les propriétés des matériaux cimentaires existants et à développer de nouveaux matériaux respectueux de l'environnement. Ces matériaux à faible émission de carbone sont principalement basés sur des liants substitués (à faible teneur en calcium), faisant usage d'additifs minéraux. Dans cette catégorie de matériaux, la phase solide prédominante est constituée de silicates de calcium hydratés (C- S-H), capables d'incorporer divers éléments mineurs (Al, Na, …), en fonction de la composition initiale des additifs utilisés. La durabilité de ces nouveaux liants dépend principalement de la stabilité et de la réactivité du C-S-H dans divers environnements chimiques. Ainsi, une meilleure connaissance fondamentale de ces matériaux ainsi que de leurs dégradations, notamment dans des conditions sévères, est essentielle pour optimiser leur performance et prolonger leur durée de vie. Différentes compositions de solutions aqueuses (concentration des éléments, pH, CO2 dissous) sont considérées comme des environnements sévères, car leur contact entraîne une dégradation naturelle des matériaux cimentaires au fil du temps. Dans de telles conditions, les phases C-S-H subissent des altérations entraînant la précipitation de nouvelles phases (M-S-H, carbonates de calcium, etc.). Pourtant, les mécanismes de cette altération, dépendant de la minéralogie initiale du C-S-H, ne sont pas complètement élucidés. Récemment, la modélisation moléculaire a émergé comme un domaine de recherche prometteur dans la science des matériaux. Elle permet de relier notre compréhension de certains mécanismes élémentaires, généralement à l'échelle microscopique, aux comportements observés à l'échelle macroscopique. Cette approche offre une opportunité unique pour faire progresser le développement de matériaux cimentaires durables, susceptibles de remplacer potentiellement les matériaux de construction conventionnels. Ainsi, l'objectif globale de ce projet de thèse est d'étudier le processus de dégradation de la structure C-S-H dans divers environnements en utilisant des méthodes de simulation atomistique et de fournir des informations détaillées sur les mécanismes microscopiques impliqués. Ce projet de thèse a pour but d’explorer l'impact des éléments sur le mécanisme microscopique de la dégradation du C-S-H et d’approfondir la compréhension des aspects encore non résolus, notamment l'incorporation de ces éléments et la dissolution des atomes de calcium. Dans cette optique, différentes structures de C-S-H, caractérisées par une stœchiométrie variable avec des rapports Ca/Si et des polymorphismes silicatés différents, seront examinées au contact de solutions aqueuses riches en divers éléments tels que Mg2+, Cl-, Na+, HCO3 , etc. De plus, les propriétés structurales seront étudiées en profondeur afin de bien comprendre l'environnement chimique des atomes, la distribution des défauts ponctuels dans le réseau tétraédrique des silicates, ainsi que la quantité de molécules d'eau et l'espace inter-couche dans chaque structure C-S-H.

Offre financée

Type de financement
Contrat Doctoral

Dates

Date limite de candidature 05/05/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisAucun

Niveau d'anglais requisAucun

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Responsable

Madame Laurie LACARRIERE

Contact

Madame Laurie LACARRIERE

 laurie.lacarriere@insa-toulouse.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Doctorat Doctorat complet Sciences pour l’Ingénieur Disciplines Génie Civil Laboratoire LABORATOIRE MATERIAUX ET DURABILITE DES CONSTRUCTIONS (LMDC) – EA 3027 Institution d’accuei...View more

Description

Les théories au-delà du Modèle Standard de la physique des particules sont caractérisées par de nouvelles échelles d’énergie. C’est intéressant d’investiguer quels états peuvent être paramétriquement légers par rapport à une telle échelle. Ce projet se propose d’étudier l’origine théorique et les effets observables des particules accidentellement légères. Dans la théorie des champs scalaires, la hiérarchie des masses est déterminée par la structure des symétries et de leur brisure. Les scalaires légers peuvent être d’intérêt en cosmologie (inflation, défauts topologiques), ainsi qu’en physique des particules (boson de Higgs, matière sombre). Par ailleurs, les champs scalaires légers peuvent apparaître comme des états composites, engendrés par une nouvelle dynamique fortement couplée. Quelques modèles-jouet de scalaires accidentellement légers sont connus, mais la construction de modèles plus réalistes reste un défi à relever pendant le doctorat. Des nouveaux fermions ou bosons vecteurs légers sont aussi un sujet d’investigation prometteur, en connexion avec le problème de la saveur, et avec les mesures de précision à la frontière d’intensité. Un autre objectif de la thèse sera d’explorer les liens entre ces nouveaux états, les neutrinos, et la matière sombre.

Compétences requises

Master en physique théorique. Théorie quantique des champs, phénoménologie du Modèle Standard, théorie des groupes, cosmologie.

Bibliographie

Some introductory texts: • A.Zee at https://press.princeton.edu/books/hardcover/9780691162690/group-theory-in-a-nutshell-for-physicists • Schwartz at https://schwartzqft.fas.harvard.edu/ • S.Coleman, Aspects of Symmetry • E.W.Kolb & M.S.Turner, The Early Universe • A.Zee at https://press.princeton.edu/books/hardcover/9780691140346/quantum-field-theory-in-a-nutshell • S.P.Martin at https://www.niu.edu/spmartin/primer/ • G.Panico & A.Wulzer at https://inspirehep.net/literature/1374915

Mots clés

Physique des particules, Théorie quantique des champs, Cosmologie

Offre financée

Type de financement
Contrat Doctoral

Dates

Date limite de candidature 12/05/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisAucun

Niveau d'anglais requisB1 (pré-intermédiaire)

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Responsable

Monsieur Michele FRIGERIO

Contact

Monsieur Michele FRIGERIO

 04 67 14 35 63

 michele.frigerio@umontpellier.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description Les théories au-delà du Modèle Standard de la physique des particules sont caractérisées par de nouvelles échelles d’énergie. C’est intéressant d’investiguer quels états peuven...View more

Description

La Méditerranée occidentale s’est ouverte au détriment de la Téthys à partir de l’Oligocène. Lors de cette ouverture, les marges téthysiennes ont été en partie, inversées, perdues en subduction et incorporées dans les chaînes alpines du Tell et du Rif (Leprêtre et al., 2018 ; Gimeno-Vives et al., 2019, 2020). Là, les portions proximales de marge sont encore accessibles, mais les parties distales et la nature de la croûte téthysienne restent quasi-inconnues, à l’exception du Tell oriental algérien où a été décrit au moins un exemple de succession ophiolitique représentant la croûte téthysienne, ici clairement de nature océanique (Boukaoud et al., 2021). Ainsi, le Tell occidental, entre Oran et la frontière marocaine constitue une zone clef. Dans cette zone sous-explorée (2 thèses en 50 ans : Guardia, 1975 ; Ciszak, 1993), une particularité réside dans ce que l’on appelle les massifs à schistosité. En effet, un métamorphisme affecte ici des roches qui appartiennent au domaine externe de la chaîne de montagnes. De plus, ces massifs seraient liés à des processus de subduction (ex Rif : Negro et al., 2007, 2008) d’âge oligocène ou plus ancien. Dans le Rif, ces massifs à schistosité ne présentent que des roches d’origine continentale mais le Tell occidental dans l’Oranais présente lui, en association avec certains massifs à schistosité (Guardia, 1975), des roches ultramafiques, qui sont vraisemblablement des morceaux de croûte océanique mais dont l’étude détaillée n’a jamais été entreprise. Deuxièmement, la région oranaise offre également un échantillonnage naturel de roches de socle qui affleurent dans les diapirs de sel triasique, en dévoilant des roches d’un très haut degré métamorphique, voire même du manteau. Midoun & Perthuisot (1992) en ont fait une interprétation suggérant qu’il s’agit de vestiges de la marge téthysienne, remontés grâce aux propriétés particulières du sel. La région oranaise est donc bien une zone clef, car elle offre deux possibilités d’échantillonnages complémentaires pour comprendre et reconstituer l’évolution de la marge sud téthysienne, depuis sa formation jusqu’à sa disparition pendant l’ouverture méditerranéenne. L’objectif de ce travail de thèse est donc d’exploiter au mieux ces deux types d’affleurements. La zone d’étude et les affleurements clefs sont localisés depuis les thèses de Guardia (1975) et Midoun (1989). Ils ont récemment fait l’objet d’une campagne de terrain (Mai 2023) pour en préciser les localisations et les potentialités, avec un échantillonnage sommaire. A la lumière de la bibliographie et de ces affleurements, le travail de décryptage sur l’évolution de la Téthys portera sur : - une caractérisation renouvelée et moderne des échantillons de socle affleurant dans le Trias salifère (pétrographie, géochimie, datations absolues du protolithe et des déformations), afin de suivre l’évolution de la marge au cours du temps depuis sa mise en place jusqu’à sa déformation cénozoïque. - une étude tectono-métamorphique des massifs à schistosité, et plus particulièrement les unités à « affinité rifaine » de Guardia (1975), dont sa carte géologique localise précisément les affleurements, souvent associés à des roches ultramafiques non étudiées, et métamorphiques. Dans ces massifs, la déformation doit faire l’objet d’un ré-examen poussée, avec une caractérisation métamorphique moderne. Les conditions (P, T) de ce métamorphisme seront évaluées avec des outils classiques (terrain, pétrographie) et modernes (spectroscopie Raman, thermométrie chlorite, pseudo-sections métamorphiques), combinés à des outils de datation absolue (U/Pb sur zircon/monazite ; Ar/Ar sur micas) pour contraindre le timing des événements. - une reconsidération de la géométrie et de la nature de cette marge téthysienne qui reste très peu connue. Le/la doctorant(e) proposera ainsi une mise au point essentielle pour compléter une lacune notable dans la compréhension de l’évolution des systèmes orogéniques péri-méditerranéens.

Compétences requises

Les étudiant·e·s intéressé·e·s par le sujet devront montrer dans leur lettre de candidature un profil en adéquation avec leur intérêt pour la pétrographie métamorphique et les travaux de terrain. Un master avec des orientations géodynamique/pétrographie/terrain sera un plus. Le bagage de pétrographie doit être conséquent, sachant que cette expertise constituera une part importante du travail. Une pré-sélection des candidatures mènera pour les quelques étudiants retenus à un entretien individuel. Dans la mesure où les campagnes de terrain prévues sont en Algérie, il est du ressort des candidat·e·s de vérifier de leur côté que leur pays d’origine autorise ses ressortissants à voyager sans aucune difficulté entre la France et l’Algérie. Cette condition est primordiale.

Bibliographie

Boukaoud, E. H., Godard, G., Chabou, M. C., Bouftouha, Y., & Doukkari, S., 2021. Petrology and geochemistry of the Texenna ophiolites, northeastern Algeria: Implications for the Maghrebian flysch suture zone. Lithos, 390, 106019. https://doi.org/10.1016/j.lithos.2021.106019. Ciszak, R., 1993. Evolution géodynamique de la chaîne tellienne en Oranie (Algérie occidentale) pendant le Paléozoïque et le Mésozoïque, PhD, Univ. Toulouse. Gimeno‐Vives, O., Mohn, G., Bosse, V., Haissen, F., Zaghloul, M. N., Atouabat, A., & Frizon de Lamotte, D., 2019. The Mesozoic margin of the Maghrebian Tethys in the Rif belt (Morocco): Evidence for polyphase rifting and related magmatic activity, Tectonics, 38(8), 2894-2918. ttps://doi.org/10.1029/2019TC005508 Gimeno-Vives, O., Frizon de Lamotte, D., Leprêtre, R., Haissen, F., Atouabat, A., Mohn, G., 2020. The structure of the Central-Eastern External Rif (Morocco); Poly-phased deformation and role of the under-thrusting of the North-West African paleo-margin, Earth-Science Review, 205, doi : 10.1016/j.earscirev.2020.103198. Guardia, P., 1975. Géodynamique de la marge alpine du continent africain d'après l'étude de l'Oranie nord-occidentale : relations structurales et paléogéographiques entre le Rif externe, le Tell et l'avant-pays atlasique. PhD, Univ. Nice. Leprêtre, R., Frizon de Lamotte, D., Combier, V., Gimeno, O., Mohn, G., Eschard, R., 2018b. The Tell-Rif orogenic system (Morocco, Algeria, Tunisia) and the complex inheritance of the southern Tethys margin, BSGF-Earth Sci. Bull, 189(10), doi: 10.1051/bsgf/2018009. Midoun, M., 1989. Etude du trias d'Oranie (Algerie) et de ses relations avec le socle polymetamorphique : implications geodynamiques regionales, PhD, Univ. Orléans. Midoun, M. & Perthuisot, V., 1992. Les élèments de socle inclus dans les évaporites du Trias (région d'Oran, Algérie). Implications sur les caractéristiques du substratum et sur l'amincissement lithosphérique triasique, Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série II. Mechanics. Physics. Chemistry. Space sciences. Earth sciences, Vol 315, Num 5, pp 571-577. Negro F., Agard, P., Goffé, B., Saddiqi, O., 2007. Tectonic and metamorphic evolution of the Temsamane units, External Rif (northern Morocco): implications for the evolution of the Rif and the Betic-Rif arc. Journal of the Geological Society 164(4): 829–842. Negro, F., De Sigoyer, J., Goffé, B., Saddiqi, O., Villa, I.M., 2008. Tectonic evolution of the Betic-Rif arc: new constraints from 40Ar/39Ar dating on white micas in the Temsamane units (External Rif, northern Morocco). Lithos 106(1): 93–109. Recanati, A., Missenard, Y., Leprêtre, R., Gautheron, C., Barbarand, J., Abbassène, F., Abdallah, N., Ouabadi, A., Derder, M., Boukari, C., Pinna-Jamme, R., Haurine, F., 2019. A Tortonian onset for the Algerian margin inversion: first evidence from low-temperature thermochronology, Terra Nova, 31(1), pp.39-48, doi: 10.1111/ter.12367.

Mots clés

Métamorphisme, Tell externe, Tethys, Marge passive, Diapir, Manteau

Offre financée

Type de financement
Contrat Doctoral

Dates

Date limite de candidature 10/05/24

Durée36 mois

Date de démarrage01/10/24

Date de création30/03/24

Langues

Niveau de français requisC1 (autonome)

Niveau d'anglais requisB2 (intermédiaire)

Divers

Frais de scolarité annuels400 € / an

Responsable

Monsieur Geoffroy MOHN

Contact

Monsieur Geoffroy MOHN

 geoffroy.mohn@cyu.fr

خصائص الوظيفة

تصنيف الوظيفةDoctorat

Description La Méditerranée occidentale s’est ouverte au détriment de la Téthys à partir de l’Oligocène. Lors de cette ouverture, les marges téthysiennes ont été en partie, inversées, perd...View more