Référence : PV-2024-1408/1 Département/Bureau : Durée en mois :36 Date de début : Date limite de dépôt des candidatures :15/04/2024

Domaines généraux de responsabilité

Présentation du département, de l'unité de recherche ou du laboratoire

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l'IFREMER s'inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Le Département des ressources physiques et des écosystèmes profonds (REM) relève les défis scientifiques et technologiques. Ses recherches portent sur l'étude des fonds marins et sous-marins, de l'évolution géologique des plateaux continentaux, des variations climatiques passées, des risques géologiques, de la biodiversité et de la dynamique des écosystèmes des grands fonds et des interactions entre la biosphère et la géosphère à des échelles allant des bactéries aux cycles glaciaires.

Les écosystèmes des grands fonds se caractérisent par une très grande biodiversité façonnée par la variabilité naturelle des environnements benthiques des grands fonds. La biodiversité et la dynamique de ces écosystèmes éloignés sont encore mal connues. L'intérêt pour les fonds marins augmente pour l'exploitation de leurs ressources naturelles. L'Unité Biologie et Ecologie des Environnements marins Profonds (BEEP) développe des projets de recherche pour accroître nos connaissances sur la biodiversité et le fonctionnement de ces écosystèmes afin de fournir des recommandations sur l'exploitation des ressources des grands fonds.

Résumé

La quête de minéraux et métaux rares est forte en raison des besoins industriels pressants liés à la transition vers des sources d’énergie propres. Les fonds marins constituent un réservoir important de gisements minéraux. Malgré le fait que la méiofaune joue un rôle fondamental dans les écosystèmes des grands fonds et qu'elle soit reconnue comme une sentinelle précoce des impacts anthropiques, nos connaissances sur ce compartiment sont encore très limitées. MIND se concentrera sur la diversité et l'écologie de la méiofaune métazoaire issue des nodules polymétalliques et des sédiments inactifs des deux contrats d'exploration français. L'interaction entre les compartiments benthiques (micro-organismes, protozoaires, méiofaune et macrofaune) ainsi que les contraintes environnementales façonnant les communautés seront étudiées. En appliquant et en testant des approches automatiques, ce projet vise également à identifier les espèces bioindicatrices clés et les traits fonctionnels pour la détection des impacts dans le contexte de l'exploitation minière en haute mer. MIND est bien placé pour apporter des découvertes majeures sur la biodiversité des grands fonds et pour fournir des recommandations essentielles aux décideurs concernant l'exploitation des ressources des grands fonds.

Mots clés

Exploitation minière en haute mer, biosurveillance, méiofaune

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

• Parcours Master/Ingénieur : biologie marine (grands fonds), environnements, taxonomie, écologie.
• Solide connaissance de la taxonomie benthique marine.
• Compétences en microscopie et biostatistique requises.
• Bonnes capacités relationnelles pour travailler dans un contexte collaboratif et multidisciplinaire.
• Bon niveau en anglais (parlé, écrit).

Conditions de travail spécifiques

• Participation à une campagne océanographique prévue

La thèse est une véritable opportunité de travailler sur les thématiques scientifiques et technologiques prioritaires de l'Ifremer. Elle donne droit à un salaire mensuel brut de 2300 euros brut pour une durée de 3 ans, non cumulable avec d'autres bourses. 

Comment postuler pour ce poste

Votre dossier de candidature doit comprendre :

• un curriculum vitae 
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes académique (Bachelor + Master 1 et premier semestre Master 2)

Votre candidature doit être compilée en 2  fichiers PDF  , jusqu'à 3 Mo pour chaque fichier.

La date limite de candidature est le 15 avril 2024 . Nous vous invitons néanmoins vivement à nous faire part au plus tôt de votre intention de postuler, en contactant le responsable du sujet : Daniela.Zeppilli@ifremer.fr et Pierre.Antoine.Dessandier@ifremer.fr

Les contrats des doctorants débuteront à compter du 1er octobre 2024 , sous réserve du dépôt des documents administratifs autorisant l'Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de Master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors UE).

L'Institut et le service de recrutement

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l'IFREMER s'inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l’expertise et l’innovation pour :

- Protéger et restaurer l'océan

- Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société

- Créer et partager des données, des informations et des connaissances sur les océans.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long des côtes françaises sur plus de 20 sites, l'Institut explore les 3 grands océans : les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader dans les sciences océaniques, l'IFREMER gère la flotte océanographique française et ses scientifiques dévoués créent des technologies révolutionnaires pour repousser les limites de l'exploration et de la connaissance des océans, des abysses à l'interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens ont à cœur de faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et transfèrent ces connaissances et technologies aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Notre mission consiste également à renforcer la sensibilisation du public à l’importance de comprendre l’océan et ses ressources, et à responsabiliser les générations futures de dirigeants par le biais de campagnes nationales d’éducation et de sensibilisation.

Créé en 1984, l'IFREMER est un établissement public français et son budget avoisine les 240 millions d'euros. Il opère sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, du ministère de la Mer, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature : 15/04/2024

Toutes les candidatures sont traitées exclusivement via notre site Internet. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton « Postuler ». 

Référence : PV-2024-1422/1 Département/Bureau : Durée en mois :36 Date de début : Date limite de dépôt des candidatures :15/04/2024

Domaines généraux de responsabilité

Le Laboratoire de physique des océans et de télédétection satellitaire (LOPS) est une unité mixte de recherche de l'Ifremer, du Centre national de la recherche scientifique (CNRS), de l'Institut national de recherche pour le développement durable (IRD) et de l'Université de Bretagne occidentale (UBO).

La thèse sera réalisée au sein de l'équipe LOPS 'Océan et Climat'. Cette équipe étudie le rôle de l'océan dans la régulation climatique et le changement climatique.

Résumé

Le taux d’élévation du niveau de la mer à l’échelle mondiale est d’environ 1,1 mm/an avant 1990 et de 3,1 mm/an depuis 1990. L’élévation du niveau de la mer est loin d’être spatialement uniforme, avec une variabilité régionale prononcée. Obtenir des tendances fiables à l’échelle régionale et locale (par exemple pour les décideurs politiques et les analyses d’adaptation) est très difficile pour de nombreuses raisons, parmi lesquelles la faible résolution des modèles climatiques ou une représentation erronée de certains processus dans ces modèles.

Ici, nous proposons de tirer parti des nouveaux modèles climatiques à haute résolution et des observations à long terme des marégraphes dans l'Atlantique Nord pour étudier les questions scientifiques suivantes (1) Les nouveaux modèles climatiques à haute résolution simulent-ils correctement l'élévation du niveau de la mer dans les zones côtières ? (2) Quelles sont les différentes contributions des marégraphes à l’élévation régionale du niveau de la mer ? (3) Quelle est la contribution de la variabilité climatique interne ? (4) Comment les estimations locales des tendances du niveau de la mer (présentes et futures) peuvent-elles aider les pouvoirs publics dans leurs stratégies d'adaptation ?

Mots clés

Niveau de la mer, changement climatique, modèles climatiques, marégraphes, variabilité interne

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

• Master 2 en Sciences de la Mer, Océanographie Physique, Climat ou Géosciences

Compétences techniques

• Compétences en analyse de données et en programmation scientifique (par exemple, Python, Matlab, Fortran)
• Capacité à analyser et résumer des publications et des résultats scientifiques
• Compétences en présentation écrite et orale
• Anglais (compréhension écrite et orale, capacité à s'exprimer en anglais)

Qualités personnelles

• Un esprit de recherche et de curiosité scientifique
• Intérêt pour le contexte scientifique et la thématique du projet
• Capacité de dialogue et d'interaction avec les collaborateurs (aussi bien internes qu'externes à la LOPS)

Conditions de travail spécifiques

Un séjour international (1 à 3 mois) dans un laboratoire de recherche à l'étranger est prévu pendant le doctorat (financement appel ISblue)

La thèse est une véritable opportunité de travailler sur les thématiques scientifiques et technologiques prioritaires de l'Ifremer. Elle donne droit à un salaire mensuel brut de 2300 euros brut pour une durée de 3 ans, non cumulable avec d'autres bourses. 

Comment postuler pour ce poste

Votre dossier de candidature doit comprendre :

• un curriculum vitae 
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes académique (Bachelor + Master 1 et premier semestre Master 2)

Votre candidature doit être compilée en 2  fichiers PDF  , jusqu'à 3 Mo pour chaque fichier.

La date limite de dépôt des candidatures est le 15 avril 2024. Néanmoins, nous vous invitons vivement à nous faire part au plus tôt de votre intention de postuler, en contactant les encadrants du sujet : lucia.pineau.guillou@ifremer.fr virginie.thierry@ifremer .fr william.llovel@ifremer.fr

Les contrats des doctorants débuteront à compter du 1er octobre 2024, sous réserve du dépôt des documents administratifs autorisant l'Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de Master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors UE).

L'Institut et le service de recrutement

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l'IFREMER s'inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l’expertise et l’innovation pour :

- Protéger et restaurer l'océan

- Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société

- Créer et partager des données, des informations et des connaissances sur les océans.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long des côtes françaises sur plus de 20 sites, l'Institut explore les 3 grands océans : les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader dans les sciences océaniques, l'IFREMER gère la flotte océanographique française et ses scientifiques dévoués créent des technologies révolutionnaires pour repousser les limites de l'exploration et de la connaissance des océans, des abysses à l'interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens ont à cœur de faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et transfèrent ces connaissances et technologies aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Notre mission consiste également à renforcer la sensibilisation du public à l’importance de comprendre l’océan et ses ressources, et à responsabiliser les générations futures de dirigeants par le biais de campagnes nationales d’éducation et de sensibilisation.

Créé en 1984, l'IFREMER est un établissement public français et son budget avoisine les 240 millions d'euros. Il opère sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, du ministère de la Mer, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature : 15/04/2024

Toutes les candidatures sont traitées exclusivement via notre site Internet. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton « Postuler ». 

Référence : PV-2024-1430/2 Département/Bureau : Durée en mois :36 Date de début : Date limite de dépôt des candidatures :15/04/2024

Domaines généraux de responsabilité

Le Laboratoire des ressources environnementales de Sète (LERLR) et le Laboratoire d'adaptation et d'adaptabilité des animaux et des systèmes (L3AS) de l'Ifremer font partie de l'Unité Mixte de Recherche MARine Biodiversité, Exploitation et Conservation (MARBEC) (https://umr-marbec.fr/fr /), dont les tutelles sont l'Institut national de recherche pour le développement durable (IRD), l'Ifremer, l'Université de Montpellier et le Centre national de la recherche scientifique (CNRS). MARBEC est l'un des plus grands laboratoires travaillant sur la biodiversité marine et ses usages en France avec environ 230 agents, dont 80 chercheurs, maîtres de conférences et professeurs. L'unité est implantée à Sète, Montpellier et Palavas-les-Flots, ainsi que dans l'Océan Indien, en Asie, en Afrique et en Amérique du Sud. MARBEC étudie la biodiversité marine des écosystèmes lagonaires, côtiers et offshore, principalement méditerranéens et tropicaux. Parmi les nombreux projets de recherche en cours, MARBEC mène notamment des projets de recherche sur la répartition des habitats et leurs rôles fonctionnels face aux changements globaux à l'aide d'outils innovants complémentaires.

Résumé

Les lagons méditerranéens sont désormais soumis à de multiples pressions anthropiques locales et globales. Cela se traduit par une modification de la structure de l'écosystème, de son fonctionnement et des services fournis. Comprendre la réponse future des communautés biologiques lagonaires est donc d’un intérêt majeur pour définir des actions de conservation efficaces pour préserver ou restaurer ces écosystèmes. Le métabarcoding est aujourd’hui utilisé comme outil intégratif pour caractériser la biodiversité à partir de l’ADN environnemental (eDNA). Cet outil, couramment utilisé en milieu marin, n'a pas encore été développé pour les macrophytes alors qu'ils jouent un rôle essentiel dans la formation des habitats pour de nombreuses espèces. Ce projet de thèse vise à développer des méthodes basées sur l'eDNA pour évaluer la diversité des macrophytes et leur microbiome, indicateur potentiel de l'état de santé de l'hôte. Plus spécifiquement, le projet se concentrera sur (i) l'évaluation de l'efficacité des outils moléculaires pour identifier les macrophytes, (ii) la caractérisation du microbiome associé à l'état de santé des macrophytes, et (iii) l'optimisation de la stratégie d'échantillonnage in situ et des outils de capture d'ADNe pour les holobiontes macrophytes. en milieu marin. Basé sur des approches expérimentales et in situ , le développement de ces méthodes pourra permettre d'anticiper les changements de régime de ces écosystèmes et contribuer à la mise en œuvre de mesures de gestion préventive.

Mots clés

Holobionte macrophyte, ADN environnemental, métabarcoding, bioinformatique, biosurveillance, lagons méditerranéens

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

• Master en recherche.
• Vous disposerez d'une solide expérience en biologie moléculaire (extraction d'ADN, PCR, Sanger et séquençage à haut débit) et en analyse de données (bioinformatique, R).
• Vous serez au courant des précautions de laboratoire.
• De bonnes connaissances en phylogénie et/ou en écologie marine/aquatique seraient un avantage.
• Très motivé par le projet de recherche de thèse, rigoureux, dévoué et autonome.
• Maîtrise de l'anglais.
• Capacité et attrait pour la lecture, l'analyse et la synthèse de publications et de résultats scientifiques, la rédaction et les présentations orales.
• Capacité à discuter et interagir avec des collaborateurs internes ou externes à l'Ifremer et au MARBEC.

Conditions de travail spécifiques

Modalités d'exercices :

• À temps plein
• Embarquement pour la journée
• Possibilité de travailler en dehors des jours ouvrables en fonction des missions de prélèvement
• Travaux de laboratoire
• Analyses de données

La thèse est une véritable opportunité de travailler sur les thématiques scientifiques et technologiques prioritaires de l'Ifremer. Elle donne droit à un salaire mensuel brut de 2300 euros brut pour une durée de 3 ans , non cumulable avec d'autres bourses. 

Comment postuler pour ce poste

Votre dossier de candidature doit comprendre :

• un curriculum vitae 
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes académique (Bachelor + Master 1 et premier semestre Master 2)

Votre candidature doit être compilée en 2  fichiers PDF  , jusqu'à 3 Mo pour chaque fichier.

La date limite de candidature est le 15 avril 2024. Néanmoins, nous vous invitons vivement à nous faire part au plus tôt de votre intention de postuler, en contactant les trois encadrants de matière : Angélique Gobet ( angelique.gobet@ifremer.fr ), Vincent Ouisse ( vincent.ouisse@ifremer.fr ) et Yannick Gueguen ( yannick.gueguen@ifremer.fr ).

En parallèle, merci de déposer votre candidature à l'école doctorale : ED 584 GAIA (Univ. Montpellier)

Les contrats des doctorants débuteront à compter du 1er octobre 2024, sous réserve du dépôt des documents administratifs autorisant l'Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de Master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors UE).

L'Institut et le service de recrutement

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l'IFREMER s'inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l’expertise et l’innovation pour :

- Protéger et restaurer l'océan

- Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société

- Créer et partager des données, des informations et des connaissances sur les océans.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long des côtes françaises sur plus de 20 sites, l'Institut explore les 3 grands océans : les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader dans les sciences océaniques, l'IFREMER gère la flotte océanographique française et ses scientifiques dévoués créent des technologies révolutionnaires pour repousser les limites de l'exploration et de la connaissance des océans, des abysses à l'interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens ont à cœur de faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et transfèrent ces connaissances et technologies aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Notre mission consiste également à renforcer la sensibilisation du public à l’importance de comprendre l’océan et ses ressources, et à responsabiliser les générations futures de dirigeants par le biais de campagnes nationales d’éducation et de sensibilisation.

Créé en 1984, l'IFREMER est un établissement public français et son budget avoisine les 240 millions d'euros. Il opère sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, du ministère de la Mer, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature : 15/04/2024

Toutes les candidatures sont traitées exclusivement via notre site Internet. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton « Postuler ». 

Référence : PV-2024-1413/1 Département/Bureau : Durée en mois : Date de début : Date limite de candidature : 15/04/2024

Domaines généraux de responsabilité

L'unité de recherche DYNECO (Dynamique des Ecosystèmes Côtiers) travaille sur l'évolution des écosystèmes côtiers en réponse aux perturbations naturelles et anthropiques. Il mène des activités scientifiques et d'expertise dans ce domaine visant à comprendre, modéliser et prédire 1) les flux de matière dans le continuum terre-mer, et 2) la dynamique spatiale et temporelle de la biodiversité. Les approches impliquent l’observation, l’expérimentation et la modélisation.

Au sein de DYNECO, le laboratoire PELAGOS se concentre sur les écosystèmes pélagiques côtiers. Le laboratoire travaille sur les flux biogéochimiques aux interfaces et la dynamique des communautés phytoplanctoniques côtières, avec un accent particulier sur les proliférations d'algues nuisibles. Le laboratoire regroupe des chimistes, des biogéochimistes et des biologistes.

Résumé

Les crustacés comptent parmi les sources alimentaires de protéines animales les plus durables. Cependant, la production durable de coquillages est entravée par plusieurs facteurs, notamment la bioaccumulation de toxines produites par des espèces de phytoplancton telles qu'Alexandrium minutum . En raison de leurs grandes capacités de dispersion dans le milieu marin, les espèces de phytoplancton devraient présenter des populations homogènes dans le monde entier. Pourtant, une structure génétique spatiale forte est extrêmement courante. Vous étudierez si cette forte structure génétique spatiale peut s'expliquer par une adaptation locale à des conditions environnementales contrastées. L'adaptation locale est rarement étudiée dans le phytoplancton, mais elle pourrait être essentielle pour mieux comprendre le développement d'espèces toxiques dans le contexte du changement climatique. À l'aide de populations se développant en Bretagne (France) et en Galice (Espagne), vous : 1. Analyserez des séries de suivi à long terme pour identifier les conditions environnementales associées au développement d'A. minutum dans les deux écosystèmes ; 2. Déterminer les fonctions des gènes appartenant à des régions génomiques présentant d'importantes divergences inter-populations ; 3. Caractériser la divergence fonctionnelle entre les populations à l'aide d'expériences in vitro

Mots clés

Efflorescences algales nuisibles, Génomique des populations et fonctionnelle, Diversité fonctionnelle, Adaptation locale, Écologie

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

• Master en biodiversité, écologie, évolution et/ou océanographie.
• Intérêt à utiliser à la fois des outils basés sur la ligne de commande (modélisation statistique, bioinformatique) et des approches expérimentales pour étudier les aspects fonctionnels de la diversité intraspécifique du phytoplancton.

Conditions de travail spécifiques

La thèse est une véritable opportunité de travailler sur les thématiques scientifiques et technologiques prioritaires de l'Ifremer. Elle donne droit à un salaire mensuel brut de 2300 euros brut pour une durée de 3 ans, non cumulable avec d'autres bourses. 

Ce poste de doctorat est basé au laboratoire Pelagos (Plouzané, France) et comprendra des courts séjours dans le groupe « Algues nocives et écologie du plancton », au Centre Océanographique de Vigo (Espagne).

Comment postuler pour ce poste

Votre dossier de candidature doit comprendre :

• un curriculum vitae 
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes académique (Bachelor + Master 1 et premier semestre Master 2)

Votre candidature doit être compilée en 2 fichiers PDF maximum, jusqu'à 3 Mo pour chaque fichier.

La date limite de candidature est le 15 avril 2024 . Néanmoins, nous vous invitons vivement à nous faire part au plus tôt de votre intention de postuler, en contactant le responsable du sujet : mickael.le.gac@ifremer.fr

En parallèle, merci de déposer votre candidature à l'école doctorale : EDSML (https://ed-sml.doctorat-bretagne.fr)

Les contrats des doctorants débuteront à compter du 1er octobre 2024 , sous réserve du dépôt des documents administratifs autorisant l'Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de Master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors UE).

L'Institut et le service de recrutement

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l'IFREMER s'inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l’expertise et l’innovation pour :

- Protéger et restaurer l'océan

- Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société

- Créer et partager des données, des informations et des connaissances sur les océans.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long des côtes françaises sur plus de 20 sites, l'Institut explore les 3 grands océans : les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader dans les sciences océaniques, l'IFREMER gère la flotte océanographique française et ses scientifiques dévoués créent des technologies révolutionnaires pour repousser les limites de l'exploration et de la connaissance des océans, des abysses à l'interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens ont à cœur de faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et transfèrent ces connaissances et technologies aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Notre mission consiste également à renforcer la sensibilisation du public à l’importance de comprendre l’océan et ses ressources, et à responsabiliser les générations futures de dirigeants par le biais de campagnes nationales d’éducation et de sensibilisation.

Créé en 1984, l'IFREMER est un établissement public français et son budget avoisine les 240 millions d'euros. Il opère sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, du ministère de la Mer, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature : 15/04/2024

Toutes les candidatures sont traitées exclusivement via notre site Internet. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton « Postuler ». 

Référence : PV-2024-1412/1 Département/Bureau : Durée en mois :36 Date de début : Date limite de dépôt des candidatures :15/04/2024

Domaines généraux de responsabilité

Le laboratoire EM3B (fr. Ecosystèmes Microbiens et Molécules Marines pour les Biotechnologies) contribue efficacement à la science par la recherche fondamentale sur les bactéries marines issues de milieux particuliers (matrices alimentaires, sources hydrothermales profondes) et leurs précieux métabolites, notamment les peptides antimicrobiens et les exopolysaccharides. Ces connaissances fondamentales ouvrent la voie à des développements innovants déjà explorés en alimentation (biopréservation) et en médecine (ingénierie tissulaire, traitement du cancer). https://em3b.ifremer.fr/EM3B-en-bref.

Résumé

Les bactéries lactiques (LAB) sont des bactéries non pathogènes reconnues comme agents de biocontrôle grâce à la production de composés biologiquement actifs tels que les peptides antimicrobiens (bactériocines). Les LAB sont également couramment utilisés comme probiotiques chez l'homme et l'animal pour divers effets bénéfiques (stimulation du système immunitaire, compétition contre les bactéries pathogènes). Pour assurer une performance optimale de ces bactéries bénéfiques, leur encapsulation dans un microenvironnement approprié assurant à la fois leur viabilité et leurs activités de sécrétion constitue un défi.

Dans ce contexte, l'objectif de la thèse est de développer une structure hydrogel à base d'exopolysaccharides produits par des bactéries de sources hydrothermales profondes de la collection Ifremer, encapsulant des LAB vivants sélectionnés pour leurs effets bénéfiques en biopréservation et en cicatrisation. L'incorporation de bactéries à l'intérieur de la matrice tridimensionnelle hautement hydratée leur fournira un environnement protecteur propice à leur survie et à la production de molécules antibactériennes. Dans le cadre de la thèse, une preuve de concept utilisant l'échafaudage d'hydrogel antibactérien développé encapsulant des LABS vivants sur un modèle de cicatrisation in vitro sera réalisée.

Mots clés

Hydrogel, bactéries, propriété mécanique, activité antibactérienne, biopréservation, cicatrisation.

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

• Master 2 en physico-chimie des biopolymères.
• Compétences en chimie analytique, techniques de caractérisation des biomatériaux et microbiologie.
• Excellentes compétences en communication écrite et orale en anglais

Conditions de travail spécifiques

• Un séjour de 3 mois en troisième année de thèse est prévu au Département de Biomatériaux et Composites de l'Université AGH de Cracovie (Pologne)
• La thèse est une véritable opportunité de travailler sur les thématiques scientifiques et technologiques prioritaires de l'Ifremer. Elle donne droit à un salaire mensuel brut de 2300 euros pour une durée de 3 ans, non cumulable avec d'autres bourses. 

Comment postuler pour ce poste

Votre dossier de candidature doit comprendre :

• un curriculum vitae 
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes académique (Bachelor + Master 1 et premier semestre Master 2)

Votre candidature doit être compilée en 2  fichiers PDF  , jusqu'à 3 Mo pour chaque fichier.

La date limite de candidature est le 15 avril 2024 . Néanmoins, nous vous invitons vivement à nous faire part au plus tôt de votre intention de postuler, en contactant le responsable du sujet : Agata.Zykwinska@ifremer.fr

En parallèle, merci de déposer votre candidature à l'école doctorale : VAAME.

Les contrats des doctorants débuteront à compter du 1er octobre 2024 , sous réserve du dépôt des documents administratifs autorisant l'Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de Master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors UE).

L'Institut et le service de recrutement

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l'IFREMER s'inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l’expertise et l’innovation pour :

- Protéger et restaurer l'océan

- Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société

- Créer et partager des données, des informations et des connaissances sur les océans.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long des côtes françaises sur plus de 20 sites, l'Institut explore les 3 grands océans : les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader dans les sciences océaniques, l'IFREMER gère la flotte océanographique française et ses scientifiques dévoués créent des technologies révolutionnaires pour repousser les limites de l'exploration et de la connaissance des océans, des abysses à l'interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens ont à cœur de faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et transfèrent ces connaissances et technologies aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Notre mission consiste également à renforcer la sensibilisation du public à l’importance de comprendre l’océan et ses ressources, et à responsabiliser les générations futures de dirigeants par le biais de campagnes nationales d’éducation et de sensibilisation.

Créé en 1984, l'IFREMER est un établissement public français et son budget avoisine les 240 millions d'euros. Il opère sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, du ministère de la Mer, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature : 15/04/2024

Toutes les candidatures sont traitées exclusivement via notre site Internet. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton « Postuler ». 

Référence :  PV-2024-1429 Département/Bureau : Département des Ressources Biologiques et Environnement Unité de recherche Economie Maritime Lieu d'affectation : Brest, Bretagne, FR , France Date limite de prise de fonction : Date limite de candidature : 23/04/2024

Domaines généraux de responsabilité

Située sur le site de l'Institut Universitaire Européen de la Mer, à côté du Centre Ifremer en Bretagne, l'unité Economie Maritime (EM) fait partie intégrante de l'Unité Mixte de Recherche 6308 AMURE (AMénagement des Usages des Ressources et des Espaces marins et littoraux) , qui regroupe des personnels de l'Ifremer, de l'Université de Brest et du CNRS en sciences humaines et sociales. Les principales thématiques abordées par l'unité EM sont l'analyse économique des trajectoires de développement des activités maritimes, l'évaluation de leurs impacts sur les écosystèmes marins et côtiers et leurs services écosystémiques associés, et l'analyse des réponses que peuvent apporter les politiques publiques, notamment en termes d’institutions et de mécanismes de régulation. Les travaux de l'équipe EM portent plus particulièrement sur les problématiques de gestion des ressources marines vivantes exploitées (ex : pêche professionnelle et récréative, élevage marin) et des politiques de conservation du milieu marin.

Résumé

Titre de la thèse « Approche intégrée pour l'évaluation de scénarios de gestion spatiale d'un écosystème social halieutique confronté à des enjeux multiples. Application à la pêcherie de coquilles Saint-Jacques en Manche Est touchée par des proliférations d'algues toxiques » (H/F)

La gestion durable des pêcheries est confrontée à de multiples défis dans le contexte du changement global et de la dégradation des conditions de production. Les proliférations d'algues nocives et toxiques (HAB) constituent également un enjeu majeur pour la gestion des pêcheries en France, en raison des risques qu'elles font peser sur la santé humaine via la consommation de produits de la mer, et des impacts socio-économiques potentiels qu'elles peuvent avoir. Ce projet de thèse abordera la question de la durabilité de la pêche et de la gouvernance de cette activité en relation avec le HAB, avec un focus sur la gestion spatialisée de la pêcherie de coquille Saint-Jacques en Manche Est. Les interdictions temporaires d'accès aux zones de pêche visent à gérer la ressource ou à protéger les consommateurs en empêchant la vente d'animaux contaminés par des algues toxiques. L'objectif de cette thèse est de (1) développer une approche de modélisation spatiale intégrée pour caractériser la dynamique spatiale de la pêcherie analysée, en considérant les forçages liés aux mesures de gestion, notamment d'ordre spatial, et les forçages liés à la dynamique des HAB, et (2) ) pour explorer des mécanismes de gestion appropriés afin de mieux gérer à la fois la pêcherie et les problèmes de santé dont elle souffre cycliquement. Le but de ce modèle intégré est d’explorer une nouvelle approche de gestion anticipative de la pêche ressource/santé, par opposition au mode actuel de gestion de crise sans coordination collective.

Mots clés

Coquille Saint-Jacques, bioéconomie, HAB, approche écosystémique, gouvernance, durabilité, impacts, adaptation, Manche, modèles intégrés.

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

vous disposez d'un profil d'ingénieur en pêche ou équivalent, avec un bon niveau de connaissances dans le traitement de données spatialisées quantitatives et qualitatives issues de sources hétérogènes. De solides compétences en approches de modélisation, en programmation informatique et en traitement statistique de séries temporelles longues sont requises. La connaissance des HAB et de leurs impacts associés serait intéressante. Une sensibilisation aux questions sociales et économiques liées à la gestion des pêcheries et la capacité de mener des travaux de terrain en interaction avec les parties prenantes seront également nécessaires.

Conditions de travail spécifiques

Les tâches à réaliser dans le cadre de la thèse concernent principalement la modélisation et le traitement de données. De plus, des entretiens avec les parties prenantes seront nécessaires pour recueillir les informations quantitatives et qualitatives nécessaires aux analyses à réaliser. Le travail de terrain pourra être complété par des ateliers avec les pêcheurs et les parties prenantes pour discuter des scénarios de gestion qui pourraient être développés dans le cadre de la thèse.

La thèse est une véritable opportunité de travailler sur les thématiques scientifiques et technologiques prioritaires de l'Ifremer. Elle donne droit à un salaire mensuel brut de 2300 euros brut pour une durée de 3 ans, non cumulable avec d'autres bourses. 

Comment postuler pour ce poste

Votre dossier de candidature doit comprendre :

• un curriculum vitae 
• une lettre de motivation
• une lettre de référence
• un relevé de notes académique (Bachelor + Master 1 et premier semestre Master 2)

Votre candidature doit être compilée en 2  fichiers PDF  , jusqu'à 3 Mo pour chaque fichier.

La date limite de dépôt des candidatures est le 15 avril 2024. Néanmoins, nous vous invitons vivement à nous faire part au plus tôt de votre intention de postuler, en contactant le responsable du sujet : jose.perez@ifremer.fr

Les contrats des doctorants débuteront à compter du 1er octobre 2024, sous réserve du dépôt des documents administratifs autorisant l'Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de Master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour les doctorants étrangers hors UE).

L'Institut et le service de recrutement

Pionnier des sciences océaniques, la recherche de pointe de l'IFREMER s'inscrit dans le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l’expertise et l’innovation pour :

• Protéger et restaurer l'océan
• Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société
• Créez et partagez des données, des informations et des connaissances sur les océans.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long des côtes françaises sur plus de 20 sites, l'Institut explore les 3 grands océans : les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader dans les sciences océaniques, l'IFREMER gère la flotte océanographique française et ses scientifiques dévoués créent des technologies révolutionnaires pour repousser les limites de l'exploration et de la connaissance des océans, des abysses à l'interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens ont à cœur de faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et transfèrent ces connaissances et technologies aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Notre mission consiste également à renforcer la sensibilisation du public à l’importance de comprendre l’océan et ses ressources, et à responsabiliser les générations futures de dirigeants par le biais de campagnes nationales d’éducation et de sensibilisation.

Créé en 1984, l'IFREMER est un établissement public français et son budget avoisine les 240 millions d'euros. Il opère sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, du ministère de la Mer, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature : 23/04/2024

Toutes les candidatures sont traitées exclusivement via notre site Internet. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton « Postuler ». 

PROFIL CHERCHEUR :  Postdoc / R2 : Docteurs  DOMAINE(S) DE RECHERCHE1 : Informatique ; Ingénierie; Mathématiques; Sciences médicales PRINCIPAL DOMAINE OU DISCIPLINES DE RECHERCHE1 : Apprentissage automatique

DESCRIPTION DU POSTE /OFFRE  Organisme d'accueil : Ce poste est basé au sein de l'unité de recherche SESSTIM (Sciences Economiques et Sociales de la Santé et Traitement de l'Information Médicale) de la Faculté des Sciences Médicales et Paramédicales de la Timone, Marseille, France. Le SESSTIM œuvre à produire des recherches d’excellence, multidisciplinaires et interdisciplinaires en sciences sociales et en santé publique pouvant conduire à des changements dans les différents domaines de la médecine prédictive, personnalisée, préventive et participative. Les chercheurs du SESSTIM développent ou sont associés à des projets de recherche qui tentent d'apporter des réponses aux défis actuels de la société et de ses populations et contribuent aux évolutions et avancées méthodologiques. 

Fonctions principales : Le candidat travaillera au sein de l'équipe multidisciplinaire « Méthodes quantitatives et traitement de l'information médicale (QuanTIM) », comprenant des chercheurs en épidémiologie et santé publique, des statisticiens, des biostatisticiens, des informaticiens et des data scientists. Plus précisément, il/elle sera affecté à un projet impliquant l'application et le développement de techniques d'intelligence artificielle aux données des registres du cancer. L'objectif des travaux sera de développer ou d'adapter une méthodologie d'apprentissage automatique afin d'estimer la surmortalité dans le cas de tables de mortalité en population générale insuffisamment stratifiées.

Activités :  Dans le cadre du projet MIRACLE (Méthodologie et Intelligence aRtificielle pour lA recherche épidémiologique en CancéroLogiE sur bases de données), financé par la Ligue contre le Cancer, le candidat contribuera à la valorisation des bases de données sur le cancer, notamment en population ceux. Dans ce contexte, un indicateur clé est la survie nette, qui représente la survie qui serait observée dans un monde hypothétique où les personnes mourraient uniquement de la maladie étudiée. La prise en compte de la mortalité due à d'autres causes, issue des tables de mortalité de la population générale stratifiées sur certaines variables, permet d'étudier des comparaisons entre populations et tendances. Cependant, une utilisation insuffisamment utilisée des tables de mortalité conduit à des estimations biaisées de la surmortalité. Différentes approches ont été envisagées et différents modèles ont été proposés pour estimer la surmortalité par cancer pour des variables non directement observées dans les tables de mortalité. Toutefois, les modèles reposent sur des hypothèses qui peuvent être jugées trop fortes compte tenu des besoins et des questions épidémiologiques. Le candidat se familiarisera avec les différentes approches et modèles déjà développés, puis étudiera l'apport des approches basées sur l'apprentissage automatique. Il développera ou adaptera une méthodologie basée sur l'apprentissage automatique (k-means, forêts aléatoires ou autres) pour estimer la surmortalité dans le cas de tables de mortalité de la population générale insuffisamment stratifiées. La méthodologie développée doit être adaptable à la situation où le nombre de variables non directement observées dans les tables de mortalité de la population générale n'est pas limité. Le candidat évaluera les performances de ces différentes méthodes à travers des études de simulation. Il/elle accordera une importance particulière à l'interprétation des méthodes, en mettant l'accent sur l'interprétabilité épidémiologique des résultats obtenus. Il implémentera le tout dans un package R, de préférence, ou en Python. Avec les autres chercheurs du projet, il rédigera le(s) article(s) sur ces travaux en vue d'une publication dans des revues internationales à comité de lecture (revues méthodologiques et/ou appliquées).

TYPE DE CONTRAT :  TEMPORAIRE / STATUT DE L'EMPLOI :  TEMPS PLEIN / HEURES PAR SEMAINE :  37h30 DATE LIMITE DE CANDIDATURE :  15/06/2024 09:00 DATE DE DEBUT ENVISAGEE :  15/04/2024 DURÉE ENVISAGÉE : 12 mois (possibilité de prolongation) EMPLOI NON FINANCÉ GRÂCE À UN PROGRAMME-CADRE DE RECHERCHE DE L'UE

LIEU(S) DE TRAVAIL :  Laboratoire SESSTIM (Sciences économiques et sociales de la santé & traitement de l'information médicale, Campus Timone, Faculté de Médecine, 27 Bd Jean Moulin, 13005 Marseille France

CE QUE NOUS OFFRONS:

Rémunération : Niveau postdoctoral; Grille salariale d'Aix-Marseille Université.

Opportunités: 

• Collaboration : en tant que membre de l'équipe, le chercheur s'engagera dans des efforts de collaboration avec ses pairs à l'intérieur et à l'extérieur de l'équipe ou du pays.
• Exposition internationale : Le chercheur aura la chance de présenter ses travaux lors de congrès internationaux.
• Implication pédagogique : Le chercheur participera activement aux unités d'enseignement de l'équipe. Il/Elle contribuera aux initiatives pédagogiques, notamment aux écoles d'été organisées par l'équipe.

Avantages :  Le SCASC (« Service Commun d'Action Sociale et Culturelle ») subventionne les frais de repas et offre une prise en charge à 50 % des frais de transport pour les déplacements professionnels. Il propose également des cours de sport, des activités culturelles, un soutien social et des services de conseil.

Informations complémentaires : Le Centre Euraxess d'Aix-Marseille Université informe les professeurs, chercheurs, postdoctorants et doctorants étrangers invités sur les démarches administratives à entreprendre avant leur arrivée à AMU et les différentes formalités pratiques à accomplir une fois en France : visas et conditions d'entrée. , assurances, aide à la recherche d'un logement, accompagnement à l'ouverture d'un compte bancaire, etc. Plus d'informations sur  le portail AMU EURAXESS

QUALIFICATIONS, DOMAINES DE RECHERCHE REQUIS, NIVEAU D'ÉDUCATION REQUIS, COMPÉTENCES PROFESSIONNELLES, AUTRES EXIGENCES DE RECHERCHE (années d'expérience en recherche  (max. 3000 caractères)

Connaissance

• Solides connaissances théoriques et appliquées des techniques d’apprentissage automatique ;
• Connaissances et compétences en analyse de survie ;
• Expertise en interprétation de modèles (ex. technique SHAP);
• Maîtrise des langages de programmation R et/ou Python.

Compétences linguistiques

• Anglais : niveau scientifique (lu, écrit, parlé).

Niveau de diplôme et expérience

• Poste de doctorat/postdoctorat avec une spécialisation en biostatistique, sciences des données, mathématiques ou statistiques appliquées.

Compétences générales : 

• Autonomie, excellentes capacités d'organisation et rigueur ;
• Capacité à travailler dans un environnement dynamique et à respecter les délais ;
• Capacité d’écoute, d’analyse et de synthèse ;
• Capacité à travailler avec des équipes multidisciplinaires;
• Etre force de propositions.

DOCUMENTS DE CANDIDATURE DEMANDÉS, CRITÈRES D'ÉLIGIBILITÉ, PROCESSUS DE SÉLECTION Votre dossier de candidature composé de :

• Une lettre de motivation expliquant comment le candidat estime pouvoir contribuer au projet ;
• Un curriculum vitae ;
• Le rapport de soutenance de thèse.
• Une ou plusieurs lettres de recommandation seraient un avantage.
• Référence de l'offre (à indiquer systématiquement) : MIRACLE-MLLT-24

Le candidat doit être titulaire d'un doctorat en sciences avec un solide dossier académique et des publications évaluées par des pairs. 

Les candidats seront présélectionnés sur la base de leurs propositions de recherche et de leurs publications, suivis d'un processus d'entretien rigoureux. Les entretiens se dérouleront en visioconférence ou en présentiel à Marseille.

COMMENT POSTULER/  Envoyer à  roch.giorgi@univ-amu.fr et  nathalie.graffeo@univ-amu.fr

Site Internet :  https://sesstim.univ-amu.fr/fr

Le Synchrotron européen, l'ESRF, est un centre de recherche international basé à Grenoble, en France.

Grâce à son ingénierie innovante, sa vision scientifique pionnière et l’engagement fort de ses 700 collaborateurs, l’ESRF est reconnue comme l’une des meilleures installations de recherche au monde. Son accélérateur de particules produit d’intenses faisceaux de rayons X qui sont utilisés chaque année par des milliers de scientifiques pour des expériences dans divers domaines tels que la biologie, la médecine, les sciences de l’environnement, le patrimoine culturel, la science des matériaux et la physique.

Soutenu par 21 pays, l’ESRF est un employeur garantissant l’égalité des chances et encourage la diversité.

Vous participerez à l'exploitation de la ligne de lumière, aux programmes de recherche internes en cours, fournirez un soutien aux utilisateurs externes en tant que contact local et développerez votre propre programme de recherche. En collaboration avec les scientifiques de la ligne de lumière, vous serez amené à participer au développement de méthodes d'analyse de données et d'environnements d'échantillons spécifiques à la ligne de lumière.

La station de diffusion de surface ID10 est dédiée aux études des surfaces et interfaces de matière condensée dure et molle en utilisant la réflectivité des rayons X (XRR), l'incidence rasante WAXS et SAXS, et des méthodes auxiliaires telles que la fluorescence des rayons X (XRF) et l'absorption des rayons X à proximité. structure de bord (XANES). La principale particularité de la station est le déflecteur à double cristal (DCD) pour les études sur surfaces liquides y compris les interfaces enterrées. Beamline est équipée d'une variété d'environnements d'échantillonnage, notamment une auge de Langmuir et un réacteur pour la croissance par dépôt chimique en phase vapeur (CVD) de matériaux 2D sur des catalyseurs à métal liquide (LMCat). Les sujets de recherche internes actuels incluent l'étude des films de Langmuir imitant les membranes cellulaires, l'assemblage de nanoparticules aux interfaces liquides et la catalyse (croissance CVD du graphène, hNB, GaN, AlN et synthèse Fischer-Tropsch).

Des informations complémentaires peuvent être obtenues auprès du Dr Oleg Konovalov ( konovalov@esrf.fr ).

- Ph.D. en physique, chimie ou dans une matière étroitement liée obtenue il y a moins de 3 ans.

- Forte aptitude pour l'instrumentation et l'analyse de données

- Connaissance de sujets de recherche pertinents pour la physique du solide, la science des surfaces, les surfaces liquides

- Expérience dans l'application de techniques de diffusion (diffusion des rayons X ou des neutrons) pour étudier la matière molle ou des systèmes associés. Une connaissance de base de la modélisation des données de diffusion est essentielle.

- Compétences en analyse de données et programmation avec Python ou MATLAB

- Capacité à interagir avec le personnel multidisciplinaire et les utilisateurs des installations

- Maîtrise de l'anglais (langue de travail à l'ESRF)

Contrat de 18 mois, renouvelable pour une nouvelle période de 6 ou 18 mois.

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L'ESRF est un employeur garantissant l'égalité des chances et encourage les candidatures de personnes handicapées.