Doctorat – Profil de recherche – Biochimie des terpènes ModBioTerp chez les hépatiques

Type : Doctorat

Début du poste entre le 01/01/2025 et le 31/12/2027

Le contrat est d’une durée de 36 mois.

Affiliation : Laboratoire de Biotechnologies Végétales appliquées aux Plantes Aromatiques et Médicinales, UMR CNRS 5079 Université Jean Monnet (UJM),

Saint-Etienne, France

https://lbvpam.univ-st-etienne.fr/fr/index.html

Location : campus Métare, Faculté des Sciences et Techniques UJM Saint-Etienne

MOTS CLÉS : Thèse – France – Terpène – Biochimie – Hépatiques

Contact pour les RH :

Merci d’adresser votre candidature à recrutementsujm@univ-st-etienne.fr avant la date limite ^du 15 septembre 2024 23h59 (heure de Paris) , elle devra comprendre

• Lettre de motivation

• CV (y compris les informations personnelles)
• Liste des publications
• Diplôme/relevé de notes de maîtrise et de doctorat

Contact pour le Laboratoire

Henrik toft Simonsen

henrik.toft.simonsen@univ-st-etienne.fr

INSTITUT D’ACCUEIL et LABORATOIRE

L’Université Jean Monnet est une université pluridisciplinaire et l’UJM est présente sur tout le territoire stéphanois : avec ses 20 000 étudiants, l’Université Jean Monnet apporte jeunes talents et excellence à  ses 5 campus  et au territoire local.

Nous offrons un environnement scientifique international créatif et stimulant, ainsi qu’un accès aux technologies de pointe. Vous faites partie d’une collaboration internationale et élargissez ainsi votre réseau. Le LBVPam est un laboratoire de premier plan en biochimie des parfums végétaux et est mondialement reconnu pour l’excellence de sa recherche, de son enseignement, de son innovation et de ses conseils scientifiques. Nous offrons un emploi enrichissant et stimulant dans un environnement international. Nous visons l’excellence académique dans un environnement caractérisé par le respect collégial et la responsabilité personnelle.

Directeur principal : Professeur Henrik Toft Simonsen, LBVPAM, UJM

Co-directeur de thèse : Dr. Sandrine Moja, LBVPAM, UJM et Dr. Matthew Styles, Isobionics, Pays-Bas.

Pour plus d’informations, contactez : henrik.toft.simonsen@univ-st-etienne.fr

CONTEXTE

La bourse de doctorat proposée fait partie du programme du réseau Marie Skłodowska-Cuire « Modélisation de la biochimie des synthases terpéniques » également appelé ModBioTerp.

ModBioTerp vise à faire progresser notre compréhension des synthases de terpènes en utilisant des techniques de modélisation assistée par IA in silico de pointe et une caractérisation biochimique pour prédire et adapter la structure et la fonctionnalité de ces enzymes insaisissables. Ce projet se concentre sur la classe de produits naturels des terpénoïdes, qui est la classe de produits naturels la plus vaste et la plus diversifiée chimiquement et qui recèle un immense potentiel pour les applications biotechnologiques. ModBioTerp établira des modèles enzymatiques qui prédisent et adaptent ab-initio la structure et la fonctionnalité des synthases de terpènes et libèrent le vaste potentiel des terpénoïdes et ouvrent la voie à des solutions biotechnologiques durables et innovantes.

L’objectif du projet de thèse spécifique est d’explorer la biosynthèse des terpénoïdes dans les hépatiques et de caractériser biochimiquement une gamme d’enzymes microbiennes de type terpène synthase. Le fait de faire partie d’un grand réseau permettra au candidat d’acquérir des connaissances auprès de plusieurs laboratoires pendant la durée du projet.

Le projet comprend la collecte d’espèces et la participation à des événements de formation en réseau en plus des études biochimiques à Saint-Etienne, ainsi que des défis biotechnologiques pour établir la transformation d’hépatiques sélectionnées. Le projet est divisé en plusieurs étapes :

• Expression d’au moins 20 MTPSL à partir d’hépatiques des espèces Bazzania, Lophocolea, Frunellaria et Porella dans la levure.
• Participer à la modélisation de 5 MTPSL et réaliser des mutations dans ceux-ci avec oloBion.
• Caractérisation in vitro et in vivo chez la levure et chez les plantes des MTPSL originales et mutées.

L’objectif global est d’élargir nos connaissances sur la biosynthèse des terpénoïdes des hépatiques qui sont chimiquement uniques par rapport aux autres plantes, et de caractériser biochimiquement les enzymes de type terpène synthase microbienne dans les plantes non productrices de graines afin de suivre leur évolution.

LE POSTE ET LES ACTIVITÉS

Nous recherchons des personnes souhaitant effectuer des recherches en biochimie végétale et en biologie moléculaire, en mettant l’accent sur la biochimie des terpénoïdes. À l’Université Jean Monnet, Saint Étienne, France, vous pourrez innover dans le domaine de la biochimie végétale et rejoindre un projet de recherche qui va au-delà des connaissances actuelles en biochimie des terpénoïdes des bryophytes. Ainsi, nous recherchons un candidat ayant une solide expérience et une forte volonté d’obtenir un doctorat dans notre laboratoire. Vous ferez partie de l’école doctorale EDSIS, UJM.

Le candidat retenu doit être titulaire d’un Master of Science (ou d’un diplôme d’ingénieur) en biologie moléculaire et/ou en biochimie ou dans des domaines très similaires, et avoir de préférence travaillé en biologie moléculaire végétale et/ou en biochimie des terpénoïdes. Le candidat doit avoir des connaissances en bioinformatique. Nous attendons du candidat au doctorat qu’il ait des connaissances en caractérisation des enzymes, en techniques de clonage, en chimie analytique, donc toute connaissance dans ce domaine est un avantage.

Le candidat doit être capable d’écrire et de parler anglais à un niveau scientifique.

COMPÉTENCES ET CONNAISSANCES PROFESSIONNELLES

Le candidat doit être titulaire d’un diplôme de maîtrise avant le début des études de doctorat et être en mesure d’occuper le poste au plus tard le 1er janvier 2025.

Au moment du recrutement, les candidats au doctorat ne doivent pas avoir obtenu de doctorat et être dans les 4 premières années (équivalent temps plein) de leur carrière de chercheur. De plus, au moment de la sélection par l’UJM, les chercheurs ne doivent pas avoir résidé ou exercé leur activité principale (travail, études, etc.) en France pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant immédiatement leur recrutement. Les séjours de courte durée, tels que les vacances, ne sont pas pris en compte.

CONDITIONS DE SALAIRE ET DE NOMINATION

Le poste sera basé sur un accord signé avec l’Union européenne et suivra les règles générales d’emploi dans une université française. La période d’emploi est de 3 ans entièrement financée.

LIEU DE TRAVAIL

La majeure partie du projet se déroulera au LBVPAM à Saint-Etienne, en France. Le doctorant devra effectuer un séjour externe de trois mois à oloBion, Barcelone, Espagne et un mois à KTH, Stockholm, Suède. Le doctorant devra également participer aux 3 événements de formation organisés dans le réseau.