Doctorant – Département d’Electronique et Systèmes d’Information

Date de dernière candidature 30 avril 2024 00:00

Département TW06 – Département d’Electronique et Systèmes d’Information

Contrat Durée limitée

Diplôme Master of Science délivré par données de départ. En physique ou en mathématiques. D’autres diplômes comme la biophysique, l’ingénierie, la chimie, l’informatique ou l’équivalent sont les bienvenus si le candidat possède une solide formation en mathématiques.

Taux d’occupation 100%

Type de poste vacant Personnel de recherche

Description de l’emploi

Dans le cadre d’un nouveau financement ERC Consolidator Grant (projet PASTIME), nous recherchons plusieurs doctorants motivés en modélisation biophysique. Les étudiants effectueront des recherches théoriques et informatiques en utilisant des simulations à l’échelle moléculaire.

Dans le projet PASTIME, nous rechercherons des méthodologies pour étudier la cinétique du transport des médicaments. Étant donné que les expériences sont souvent trop coûteuses ou manquent de détails, les simulations moléculaires peuvent donner un aperçu de la dynamique de la liaison des médicaments aux protéines, ou de la cinétique de perméation de ces molécules médicamenteuses à travers les membranes. Bien que de telles méthodologies de calcul existent, de nouveaux développements fondamentaux sont nécessaires pour comprendre les aspects « temporels » et rendre les calculs réalisables avec la puissance informatique actuelle.

Selon l’intérêt du candidat, l’étudiant travaillera sur l’un des sujets suivants :

• Développer de nouvelles méthodes de simulation du transport de médicaments à travers les membranes cellulaires, en s’appuyant sur des calculs de perméabilité membranaire, par exemple en réduisant la mémoire dans les simulations.
• Développer de nouvelles méthodes de criblage de la cinétique de liaison des médicaments anticancéreux candidats aux sites de liaison des protéines, avec application en médecine de précision, où les médicaments sont adaptés à l’ADN spécifique du patient.
• Améliorer la méthodologie d’échantillonnage de chemin pour intégrer la cinétique hors équilibre, ce qui est particulièrement pertinent pour comprendre la mort cellulaire provoquée par un traitement de photoporation.

L’étudiant sera intégré au groupe de recherche Modèles biophysiques pour applications médicales (BioMMedA, https://biommeda.ugent.be ), qui crée un environnement motivant pour effectuer des recherches. BioMMedA fait partie de l’Institut de technologie biomédicale (IBiTech), qui est un pôle de biophysiciens et d’ingénieurs travaillant sur des questions de recherche biomédicale.

Le doctorant travaillera à l’obtention d’un doctorat dans le cadre du programme des écoles doctorales de l’Université de Gand sous la direction du professeur An Ghysels. Une contribution à l’enseignement peut également faire partie du contenu du poste. Cette recherche est réalisée en étroite collaboration avec des groupes internationaux (par exemple le groupe du professeur Titus van Erp au NTNU à Trondheim, Norvège). Localement, les collaborations au sein du réseau du Cancer Research Institute Gand (CRIG, Gand, Belgique) sont encouragées, notamment pour la validation expérimentale des résultats de recherche, et des collaborations internationales avec d’autres groupes de recherche sont également possibles.

Nous offrons:

• Un poste de doctorat à temps plein entièrement financé avec un salaire compétitif. Il y aura une période probatoire d’un an et, après une évaluation positive, le contrat pourra être prolongé de trois ans supplémentaires (4 ans au total).
• Vous travaillerez au sein du groupe BioMMedA, convivial et dynamique. Vous aurez l’opportunité de collaborer avec des experts en simulations moléculaires grâce à notre réseau international. Localement, vous pourrez interagir avec des experts en recherche sur le cancer et des partenaires expérimentaux, permettant ainsi de valider vos résultats de simulation. Vous aurez accès à une infrastructure de recherche de pointe au Centre flamand de calcul haute performance (VSC), permettant une formation scientifique de haut niveau dans une université de premier plan.
• Vous aurez l’occasion d’assister à des conférences internationales, de publier vos résultats dans des revues de premier plan et de visiter des instituts de recherche pertinents.
• L’Université de Gand propose à tous ses collaborateurs un ensemble d’avantages sociaux généreux, comprenant un large éventail de possibilités de formation et d’enseignement dans les écoles doctorales et un large éventail d’installations sportives et de loisirs. Gand est une ville universitaire dynamique, sûre, culturelle et accueillante offrant une grande qualité de vie.

Profil de l’emploi

(1) Vous possédez d’excellentes compétences en physique/mathématiques (pour le développement de méthodes) et vous aimez la pensée abstraite.
(2) Vous êtes compétent en programmation scientifique, en analyse de données et en gestion de données volumineuses (outils informatiques permettant de générer et d’analyser des données de systèmes moléculaires complexes), par exemple avec Python (ou équivalent).
(3) Idéalement, vous possédez également des connaissances en physique statistique, biophysique ou physique des matériaux, programmation, communication scientifique. Idéalement, vous avez déjà une certaine expérience en simulation moléculaire. Des connaissances en biologie ou en chimie sont un point fort, mais ne sont pas nécessaires en début de thèse.
(4) Vous avez un esprit analytique et de résolution de problèmes, dédié à surmonter les défis techniques.
(5) Vous avez une attitude ouverte envers l’apprentissage et êtes motivé, travailleur et déterminé à obtenir un doctorat.
(6) Vous possédez de bonnes compétences en communication orale et écrite, avec une maîtrise de l’anglais.

comment s’inscrire

L’embauche se fera sur une base continue, alors n’hésitez pas à postuler avant la date limite.

– Votre candidature doit être en anglais et comprendre les éléments suivants :
1. Une lettre de motivation
2. Un curriculum vitae
3. Des copies des diplômes concernés
4. Des listes de notes (relevé de notes des cours de Bachelor et Master)
5. En option : un échantillon une partie de votre mémoire de maîtrise ou d’une autre réalisation en résolution de problèmes

– Le curriculum vitae doit également mentionner une liste de deux professeurs avec leur institut et leurs coordonnées, qui vous ont encadré dans votre projet de recherche de Bachelor et/ou Master et qui sont disposés à fournir une lettre de recommandation (plus tard dans le processus de candidature).

– Le curriculum vitae doit mentionner les dates (mois et année) et les lieux (ville et pays) lorsque vous décrivez vos études, postes, etc.

– La candidature doit être envoyée à PASTIME.vacancy@ugent.be en utilisant l’objet suivant : “PhD : cinétique dans les simulations moléculaires, NOM, PRENOM”.
Seules les candidatures complètes seront prises en compte. Parmi toutes les candidatures, une liste restreinte Un tri des candidats sera effectué, qui seront contactés pour un entretien (éventuellement via Zoom/Teams).