Contexte Même si l’utilisation de la lumière comme source d’énergie est bien établie en photocatalyse, sa mise en œuvre en réactivité asymétrique hétérogène est encore rare. Il est donc urgent de trouver de nouvelles stratégies pour générer des réactions photochimiques asymétriques efficaces avec le rayonnement solaire. Dans ce projet, nous proposons de combiner les caractéristiques uniques des nanoparticules métalliques plasmoniques en tant que photocatalyseurs[1] avec une réactivité asymétrique, dans le but de réaliser des réactions photocatalytiques hétérogènes et asymétriques uniquement pilotées par des plasmons.[2] Différents systèmes plasmoniques chiraux avec des réponses chiroptiques à différentes échelles d'énergie (de l'UV au NIR) seront utilisés comme matières premières.[3,4] Ces systèmes plasmoniques très polyvalents seront mis en œuvre pour explorer la réactivité asymétrique pour les transformations organiques et inorganiques. Activités Le postdoctorant sera en charge de conduire des réactions photochimiques utilisant différents nanomatériaux plasmoniques synthétisés par nos partenaires de Bordeaux et Strasbourg comme catalyseurs hétérogènes. En parallèle, il/elle contribuera également à la synthèse colloïdale de résonateurs plasmoniques chiraux. La microscopie électronique à transmission et à balayage ainsi que différentes spectroscopies seront couramment utilisées pour la caractérisation des matériaux. De plus, le GCMS et d'autres techniques chromatographiques seront mises en œuvre pour surveiller les réactions photochimiques étudiées. Les références [1] Brissaud et al., Solar RRL, 2023, 7, 2300195 [2] Negrín-Montecelo et al., J. Am. Chimique. Soc., 2022, 144, 4, 1663 [3] Gao et al., ACS Nano, 2020, 14, 4, 4111 [4] Wu et al., Nano Lett., 2021, 21, 19, 8298

Qu'est-ce que le Nexus doctoral ExposUM ?

Les Nexus Doctoraux proposés par l'Institut ExposUM sont des réseaux de 3 à 4 doctorants issus de disciplines différentes et affiliés à au moins deux unités de recherche différentes. Par rapport à un doctorat traditionnel, participer à un Doctoral Nexus favorisera la capacité à travailler en équipe et à concevoir des projets de manière transdisciplinaire tout en approfondissant son propre champ d'expertise. Un programme d'enseignement spécifique sera proposé et les doctorants concernés auront également la possibilité d'organiser un séminaire au sein du réseau Nexus. Les thèses sont financées dès l'origine pendant 4 ans, incluant le salaire du doctorant et une allocation environnementale.

Résumé du projet Nexus SECS (Société & Environnement Social face aux comportements suicidaires)

Le suicide, avec 700 000 décès annuels, dont 10 000 en France, représente un enjeu majeur pour la santé mondiale. Elle génère d’énormes coûts sociaux et économiques, notamment à travers la consommation de soins de santé. La complexité des phénomènes suicidaires, influencés par des facteurs individuels, sociaux et environnementaux, nécessite une approche holistique. Le défi actuel consiste à identifier des marqueurs clinico-biologiques fiables pour améliorer nos capacités prédictives auprès des individus à risque et développer des stratégies thérapeutiques efficaces et personnalisées.

Le comportement suicidaire apparaît comme un moyen d’échapper à une douleur psychologique et sociale insupportable plutôt que comme la vie elle-même. En effet, l’isolement et l’exclusion sociale, problématique malheureusement très actuelle, sont sources de douleur qui précipitent les actes suicidaires. Grâce à une consommation excessive de soins de santé, les personnes présentant un risque de suicide pourraient tenter de soulager cette douleur et de renouer avec la société.

Les liens sociaux sont essentiels à la survie. Lorsque leur intégrité est menacée, une douleur psychologique/sociale et une réponse inflammatoire sont induites de la même manière que la douleur et l'inflammation physiques face aux menaces contre l'intégrité physique. L’étude des réponses douloureuses et inflammatoires dans des situations d’adversité sociale est donc nécessaire pour mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques des comportements suicidaires.

La prévention du suicide est une priorité de santé évidente qui, au niveau sociétal, doit être alignée avec la légalisation prochaine du suicide assisté, qui pourrait modifier les représentations sociales du suicide. Notre proposition est un programme de recherche intégré, ancré dans l'éthique (ED Droit et science politique ED 461), la modélisation statistique (IDESP, UMR1318) et les biomarqueurs (IGF, ED CBS2), offrant une approche globale pour comprendre, prévenir et gérer les tendances suicidaires. comportements.

Axe 1 – Éthique et représentations sociales : Le débat sur le suicide assisté soulève des questions éthiques complexes, juxtaposant soulagement de la douleur et prévention du suicide. Une réflexion approfondie sur la prévention du suicide, en s'adaptant à ses représentations sociales changeantes, sera abordée.

Axe 2 - Modélisation et prédiction du risque de suicide : L'utilisation des données de consommation de soins offre une opportunité unique de modéliser le risque de suicide. Grâce à une approche statistique et d’intelligence artificielle, la construction d’algorithmes prédictifs, notamment grâce à l’utilisation de réseaux de neurones, vise à mieux prédire les comportements suicidaires.

Axe 3 - Biomarqueurs des comportements suicidaires : Explorant la douleur psychologique et la réponse immuno-inflammatoire spécifique des individus à risque suicidaire exposés au stress social, l'identification de biomarqueurs renforcera la compréhension physiopathologique des comportements suicidaires, ouvrant la voie à des stratégies de traitement personnalisées.

En abordant les phénomènes suicidaires sous différentes perspectives, notre projet contribue à comprendre l'impact de l'exposome sur les comportements suicidaires et initie une réflexion sur la transformation des environnements sociaux, favorisant le développement d'interventions personnalisées et efficaces. Le projet permettra naturellement de s'interpénétrer les trois axes, chaque aspect interrogeant les autres : médecine personnalisée - douleur - éthique - usage de l'intelligence artificielle.

Sujet de thèse : Neurosciences sociales : réponses inflammatoires et douloureuses au stress social dans les comportements suicidaires

Faire face à des facteurs de stress psychosociaux tels que les ruptures, les difficultés financières ou professionnelles est au cœur de notre condition humaine ; cependant, certaines personnes tentent de se suicider dans de tels contextes d'adversité sociale, ce qui suggère l'existence de différences interindividuelles en matière de vulnérabilité au stress social. Cliniquement, les facteurs de stress sociaux interpersonnels induisent une douleur sociale, qui pourrait être assimilée à une douleur psychologique ; ce dernier est associé à des idées suicidaires et prédictif de tentative de suicide (SA) dans l'année chez les personnes déprimées. De plus, la douleur psychologique perçue dans la vie quotidienne chez les individus ayant des antécédents d'AS et le niveau d'inflammation basale sont en corrélation avec l'activation du cortex orbitofrontal lors d'une tâche expérimentale d'exclusion sociale (jeu de cyberball), favorisant une prise de décision altérée, qui est un trait cognitif du suicide. vulnérabilité. Biologiquement, la maltraitance infantile, la solitude et l'exclusion sociale, facteurs de risque de suicide, sont associées à une activité et à une inflammation accrues de l'axe hypothalamo-hypophyso-surrénalien. Cependant, l’émergence de douleurs psychosociales et son lien avec la réponse inflammatoire restent à établir, notamment chez les individus à risque suicidaire. Notre équipe (et d’autres) a identifié, grâce à la mesure du cortisol salivaire, qu’une réactivité accrue au stress social lors d’un stress social expérimental (Trial Social Stress Test) caractérisait un groupe spécifique de sujets à risque suicidaire. Cependant, les études sur la réponse inflammatoire au stress social chez les individus ayant des antécédents d’AS font encore défaut.

Nous émettons l'hypothèse que les patients à risque suicidaire ont une réponse biologique (inflammatoire) et douloureuse (douleur psychologique) spécifique aux situations d'exclusion sociale ou de dévalorisation, favorisant des idées ou des comportements suicidaires. Notre objectif global est d'identifier les biomarqueurs du comportement suicidaire dans les situations de stress social interpersonnel grâce à l'étude de l'inflammation et de la douleur psychologique chez les patients ayant des antécédents de dépression.

Sur la base des données déjà collectées dans les études cliniques menées par notre équipe, nous proposons de :

• Comparez les réponses immunitaires-inflammatoires et douloureuses périphériques au stress social expérimental (TSST) chez des sujets avec et sans antécédents d'AS.
• Tester la valeur prédictive de ces marqueurs (cliniques et biologiques) sur le risque de survenue d'AS à un horizon d'un an.
• Étudier l'influence de l'état inflammatoire de base des individus sur la douleur psychologique/sociale suite à un stress social expérimental.
• Identifier, à la fois transversalement et prospectivement, le lien entre la douleur psychologique, les marqueurs inflammatoires périphériques (sérum, cellulaire, expression génique de l'inflammation et épigénétique) et les idées suicidaires dans des cohortes locales de patients déprimés et une cohorte nationale de patients atteints de troubles bipolaires.
• Évaluer l'effet modulateur ou médiateur de l'inflammation entre la présence d'une adversité précoce (maltraitance infantile) ou tardive (solitude).
• Évaluer l'impact du soutien social sur la douleur psychologique et l'inflammation chez les patients à risque de suicide.

Pour atteindre ces objectifs, nous exploiterons les données collectées lors d'études cliniques menées par notre équipe (utilisant TSST (N=75) et Cyberball Game (N=155)), une cohorte de patients déprimés suivis dans notre service (N>800), ou une cohorte de patients atteints de troubles bipolaires suivis dans le réseau national FACE-BD (N>3000).

Le projet vise à identifier les mécanismes physiopathologiques impliqués dans la vulnérabilité aux comportements suicidaires liés à l'exposition à des facteurs de stress interpersonnels, conduisant à l'identification précise des individus particulièrement à risque, à l'identification de cibles thérapeutiques et à la personnalisation de stratégies thérapeutiques basées sur les profils des patients.

Procédure de demande

La candidature doit être composée des éléments suivants :

• Un curriculum vitae (CV)
• Une lettre de motivation
• Une copie du diplôme permettant l'inscription
• Documents spécifiques demandés par l'école doctorale Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé (CBS2) ( https://edcbs2.umontpellier.fr/ )

Si vous souhaitez postuler à ce poste, merci d'envoyer au plus vite un email à : philippe.courtet@umontpellier.fr e-olie@chu-montpellier.fr cc : exposum-aap@umontpellier.fr afin de les informer de votre intérêt.

Avant le dimanche 21 avril, 20h00 CET

Plus d’informations disponibles ici (au 11 mars 2024) :

https://www.umontpellier.fr/articles/appel-a-projet-doctoral-nexus-campagne-2024

Nous ouvrons 1 poste de doctorat/Postdoc à CentraleSupélec / IETR à Rennes sur les accélérateurs matériels DNN résistants aux canaux latéraux , encadré dans le cadre du projet ANR JCJC ATTILA (bourse jeunes chercheurs de l'Agence nationale de la recherche) Vous intégrerez le laboratoire IETR de Rennes et travaillerez avec des membres de l' équipe ASIC et du SUSHI de l'IRISA / Inria . Nous faisons partie d'un environnement collaboratif plus large avec des chercheurs de Rennes et de Nantes travaillant sur le matériel DL et la sécurité matérielle/logicielle. Objectifs du poste L'objectif est d'étudier les vulnérabilités des canaux secondaires des systèmes DL dans des plates-formes reconfigurables hétérogènes (MPSoC-FPGA) et de concevoir des accélérateurs sécurisés contre les attaques SCA. Nous nous concentrons sur les implémentations du calcul approximatif (AxC) et ses implications en matière de sécurité . Par conséquent, nous visons à comprendre l’ interaction entre les techniques AxC, les vulnérabilités des canaux secondaires et les mécanismes de défense . Bien que l’accent soit mis sur les attaques SCA exploitant la consommation d’énergie ou les émanations EM, le candidat peut également explorer d’autres vulnérabilités des canaux secondaires. Nous accueillons des candidats ayant des parcours et des intérêts différents , par exemple en matière de matériel et d'architecture (FPGA, sécurité matérielle, accélérateurs et microarchitecture sécurisés, microcontrôleurs) ou en informatique/mathématiques (analyse de canal secondaire, cryptanalyse, intelligence artificielle). Selon le contexte, les orientations de recherche à explorer comprennent, sans s’y limiter :

• Implémentation du DNN, évaluation des canaux secondaires et découverte des vulnérabilités. Étendez notre configuration actuelle pour implémenter d'autres modèles DNN dans les FPGA (ou microcontrôleurs) en tirant parti des techniques AxC, et évaluez les fuites et les vulnérabilités des canaux secondaires dans différents paramètres.
• Mise en œuvre de contre-mesures. Étudier les contre-mesures existantes dans la littérature et en proposer de nouvelles en tirant parti de l'AxC et d'autres techniques à explorer.
• Techniques avancées d’analyse des canaux secondaires et méthodologies d’évaluation. Étudier la littérature sur les techniques d'analyse et d'attaques pour proposer et mettre en œuvre de nouvelles méthodologies d'évaluation side-channel adaptées au contexte des DNN (récupération de paramètres/entrées, rétro-ingénierie de modèles ou d'accélérateurs matériels, découverte de nouvelles vulnérabilités, etc.).

Le poste offre un cheminement pour compléter un doctorat. dans un domaine émergent important et la possibilité de mettre en place et de développer leur propre programme de recherche pour les candidats postdoctoraux. Détails

• Durée : Ph.D. thèse complète de 3 ans, et Postdoc 2 ans avec possibilité de prolongation.
• Date de début : Flexible courant 2024, idéalement doctorat. Oct./Nov., et Postdoc dès que possible.
• Ensemble d'avantages sociaux:
  • Couverture de la sécurité sociale
  • Repas subventionnés
  • Remboursement partiel des frais de transports en commun
  • Congés payés
  • Possibilités d'hébergement disponibles sur le campus
  • Accès aux équipements et activités de formation professionnelle, sociale, culturelle et sportive

Profil des candidats

• Diplômé (Master 2 ou 5ème année Ing.) ou Ph.D. en génie informatique/électrique, informatique, microélectronique, systèmes embarqués. Vous disposez d'une solide expérience dans au moins un des domaines suivants :
  • Attaques par canal secondaire, méthodologies d'analyse et d'évaluation par canal secondaire, cryptanalyse
  • Autre sécurité matérielle/logicielle
  • Conception pour FPGA/SoC-FPGA et expérience pratique en prototypage et implémentations
  • Implémentation de DNN/CNN dans des FPGA et/ou d'autres accélérateurs/systèmes
  • Machine Learning/Intelligence Artificielle (PyTorch, TensorFlow, TFLite...)

Autres compétences intéressantes :

• Programmation en C/C++/Python
• Utilisation de Linux/Git comme environnement de développement
• Bonne utilisation des instruments de laboratoire (oscilloscopes, alimentations, etc.). Vous pouvez parler, écrire et lire l'anglais à un niveau professionnel (la langue française n'est pas requise).

comment s'inscrire Veuillez envoyer un email aux contacts indiqués ci-dessous avec les informations suivantes :

• Votre CV
• Lettre(s) de référence des superviseurs précédents
• Copies/liens vers des rapports/articles/dépôts montrant votre expérience
• Postdoc :
  • Lettre de motivation et énoncé de recherche (4 pages max)
  • Votre doctorat. manuscrit de thèse
• Doctorat.:
  • Lettre de motivation
  • Relevés de notes Bachelor/Master

N'hésitez pas à nous contacter pour plus de détails et d'informations. Contacts:

• Rubén Salvador : ruben.salvador@inria.fr
• Maria Méndez Real : maria.mendez@univ-nantes.fr
• Jean-Christophe Prévotet : Jean-Christophe.Prevotet@insa-rennes.fr
• Amor Nafkha : Amor.Nafkha@centralesupelec.fr

Date limite : les entretiens commenceront au fur et à mesure de l'arrivée des candidatures et se dérouleront jusqu'à pourvoir les postes.

Les activités du chercheur s'inscrivent dans le cadre du projet NaMuMat (ANR JCJC). L'objectif de ce projet est de développer des modèles de matrice extracellulaire pour des modèles intestinaux in vitro. Nous utilisons notamment l’impression 3D biphotonique haute résolution pour fabriquer des supports poreux pour l’établissement d’épithéliums intestinaux, qui sont ensuite intégrés dans des puces microfluidiques pour permettre l’ensemencement, la culture, la caractérisation et l’imagerie de ces monocouches cellulaires. La qualité de ces modèles de barrière intestinale peut être mesurée par les méthodes TEER (Trans-Epithelial Electrical Resistance), dans lesquelles la résistance et l'impédance de la monocouche cellulaire sont caractérisées lors de la culture cellulaire et de l'établissement d'un épithélium confluent. Dans le cadre de ce projet, le chercheur travaillera à l'intégration d'une méthode TEER dans une puce 3D imprimée stéréolithographiquement, et à l'analyse des mesures obtenues. Plus spécifiquement, les activités comprendront : - Fabrication d'échafaudages (lithographie et impression 3D) - Fabrication d'électrodes (technique salle blanche) - Fabrication de puces microfluidiques (stéréolithographie) et intégration d'électrodes - Culture de lignées cellulaires (Caco-2) et établissement de cellules épithéliales modèles barrières - Mise en place d'une méthode de mesure TEER (résistance et impédance) - Acquisition et analyse des données TEER en cours de culture. Le chercheur rejoindra et travaillera en étroite collaboration avec l'équipe ELiA du LAAS-CNRS (Toulouse). L'équipe ELiA compte une vingtaine de collaborateurs, travaillant sur des thématiques liées à l'utilisation des micro et nanosystèmes pour la biologie. Le poste est situé dans un secteur couvert par la Protection du Potentiel Scientifique et Technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente.

Les électrolyseurs à membrane échangeuse d’anions sont des dispositifs prometteurs pour la production propre d’hydrogène à partir de l’eau. Au cours de la dernière décennie, les performances des électrolyseurs d’eau à membrane échangeuse d’anions et des électrodes pour piles à combustible (AEMWE/AEMFC) ont été considérablement améliorées grâce à la conception et au développement de nouveaux matériaux (électrocatalyseurs, ionomères échangeurs d’anions ou membranes). Cependant, malgré son importance pour la conception de couches de catalyseur AEMWE/AEMFC efficaces, la structure interfaciale électrode/électrolyte, ses propriétés, ainsi que son impact sur l'activité électrocatalytique et la stabilité de l'interface ont été peu étudiés. Le Post-Doc étudiera les interfaces électrodes/ionomères à l'aide de surfaces modèles (monocristaux, films minces, etc.). Les propriétés des interfaces (épaisseur, structure, capacité des électrodes) seront étudiées en fonction de la composition des solutions ionomères et électrolytiques, par des méthodes spectroscopiques et électrochimiques (ellipsométrie, FTIR, Raman, spectroscopie d'impédance, réflexion des rayons X ou des neutrons). La cinétique des réactions HOR/HER sera étudiée sur des électrodes à disque rotatif et des électrodes à diffusion gazeuse. Le CNRS est le seul organisme de recherche en France qui regroupe toutes les disciplines scientifiques. Sa force réside dans le fait de disposer de spécialistes dans des domaines très spécialisés, capables d'appréhender leur sujet en profondeur. L’interdisciplinarité, c’est réunir ces experts pour travailler sur un projet commun. Cette approche vise à explorer de nouvelles questions scientifiques - qui nécessitent une coopération entre disciplines - et à développer des stratégies globales pour répondre à des défis scientifiques majeurs - par nature transdisciplinaires et interdisciplinaires - comme le changement climatique, la santé et l'environnement ou les inégalités éducatives. Le CNRS s'efforce ainsi de faire dialoguer les sciences entre elles, mais aussi avec les acteurs de la société. Le LEPMI est un laboratoire d'électrochimie dont les études portent essentiellement sur l'énergie et le développement durable. http://lepmi.grenoble-inp.fr/ . L’équipe impliquée est l’équipe Electrochimie Interfaciale et Procédés (EIP).

Appel à bourses postdoctorales Marie Curie

Rejoignez notre équipe en tant que boursier postdoctoral Marie Curie ! La Faculté des sciences de la santé de l'Université Palacký d'Olomouc invite les jeunes chercheurs talentueux à exprimer leur intérêt pour le  programme de bourses postdoctorales Marie Skłodowska-Curie  (MSCA PF), qui finance 12 à 24 mois de recherche. La bourse comprend un salaire, une allocation de mobilité, une allocation familiale (le cas échéant) et des frais de recherche. En plus d'être éligibles au MSCA, les candidats qui soumettent leur proposition à l'Université Palacký d'Olomouc et dépassent le seuil de 85 % , mais ne sont pas financés par le MSCA en raison de la limite budgétaire, ont la possibilité d'être financés par le MSCA.Bourses ERA (un programme accessible uniquement aux pays en expansion comme la République tchèque) . Et les candidats qui ont réussi leSeuil de 70 %participant à l'évaluation seront admissibles au financement de leurs projets grâce aux subventions MSCA-CZ du programme opérationnel Jan Amos Commenius du ministère de l'Éducation, de la Jeunesse et des Sports de la République tchèque. En tant qu'institution d'accueil, nous offrons aux candidats la possibilité de travailler avec des superviseurs possédant une vaste expérience (plus d'informations sur nos domaines et nos superviseurs ci-dessous). En plus de garantir que les candidats reçoivent les meilleurs conseils et soutiens possibles, nous proposons un  atelier de formation de 2 jours , qui se déroule en ligne fin avril. Pour être pris en considération pour cette opportunité, les candidats seront soumis à un processus de présélection basé sur leur CV, leur idée de projet et leur motivation. Il existe  trois principales conditions d’éligibilité :

• Les candidats doivent être titulaires d'un doctorat et avoir au plus 8 ans d'expérience en recherche à temps plein au moment de la candidature.
• Les candidats de toute nationalité sont les bienvenus, mais ils ne doivent pas avoir vécu ou travaillé en République tchèque pendant plus de 12 mois au cours des 3 années précédant la date de clôture de l'appel le 11 septembre 2024 (règle de mobilité).
• Les candidats doivent choisir la Faculté des sciences de la santé de l'Université Palacký d'Olomouc comme établissement d'accueil.

Pour postuler, les candidats doivent remplir le  formulaire d'inscription  et soumettre les documents suivants (format PDF) en pièce jointe avant  le 15 avril 2024  (les candidatures qui ne suivront pas ces instructions seront rejetées) :

• Déclaration de motivation d'une page comprenant le parcours du candidat, l'idée du projet et la façon dont elle recoupe l'expertise du superviseur (et de l'Université Palacký à Olomouc).
• CV (3 pages maximum)

Le processus de sélection sera un effort de collaboration entre les superviseurs et nos conseillers de recherche. Les candidats sélectionnés seront contactés d'ici la mi-mai  et informés des prochaines étapes du processus, qui comprennent la préparation conjointe d'une candidature MSCA PF avec leur superviseur. Pour toute autre question, veuillez contacter Marika Svrčková ( marika.svrckova@upol.cz ). L'économie de la santé Assoc. prof. Jarmila Zimmermannova, Ph.D. habilité à l'Université d'économie de Prague en 2017 dans le domaine de la finance. De 2003 à 2009, elle a occupé divers postes au ministère de l'Environnement de la République tchèque, plus récemment en tant que directrice adjointe du Département de l'énergie durable et des transports et chef du Département de la réforme fiscale environnementale et des transports. Elle a représenté le ministère de l'Environnement de la République tchèque au sein du Groupe de travail de l'OCDE - Réunions conjointes d'experts en fiscalité et en environnement. De 2011 à 2022, elle a occupé divers postes au Moravian Business College Olomouc, notamment comme recteur, vice-recteur pour la science et la recherche et professeur agrégé au Département d'économie et au Département de développement durable. Actuellement, elle travaille à l'Université Palacky, Faculté des sciences de la santé, Centre pour la science et la recherche. Elle est également vice-doyenne aux relations internationales et à l'internationalisation. Dans le domaine de la bioéconomie, elle est responsable de la section socio-économique de la Plateforme pour la bioéconomie (République tchèque) et depuis mars 2022 également membre du comité scientifique de la Circular Bio-based Europe Joint Undertaking (CBE JU). Ses principaux domaines d'expertise sont l'économie publique, les finances publiques et l'impact des instruments de politique financière et économique. Elle est l'auteur de nombreux articles scientifiques et d'une monographie. Elle a donné des conférences à l'échelle internationale dans des universités en Hongrie (Budapest Business School), en Allemagne (Hochschule Nordhausen, Duale Hochschule Villingen Schwenningen, Ruhr Universität Bochum), en Slovénie (Université de Maribor), aux Pays-Bas (Université d'Utrecht), en Israël (Kinneret Academic College), Chine (Université Dalian Minzu) et Espagne (Université Rovira i Virgili, Tarragone). Santé mentale et bien-être Simona Dobešová Cakirpaloglu, Ph.D. est un éminent scientifique et expert dont la formation universitaire et les intérêts professionnels se concentrent sur les questions de risques psychosociaux et de santé mentale. Elle a commencé sa carrière universitaire en obtenant une maîtrise en psychologie au Département de psychologie de la Faculté des arts de l'Université Palacký d'Olomouc en 2003 et en 2007, elle a obtenu son doctorat. en psychologie clinique de la même université. Actuellement, elle occupe le poste de directrice adjointe de l'Institut des sciences sociales et humaines de la Faculté des sciences de la santé de l'Université Palacký d'Olomouc. Professionnellement, le Dr Dobešová Cakirpaloglu se spécialise dans plusieurs domaines clés. L’un d’eux est le stress au travail et le syndrome d’épuisement professionnel, où elle s’efforce d’identifier les facteurs contribuant à l’épuisement professionnel et à l’épuisement chez les professionnels de la santé et cherche des moyens d’atténuer ces problèmes. Elle aborde également l'intimidation au travail et son impact sur le bien-être mental des individus, son travail aidant à identifier des stratégies pour résoudre ce problème et améliorer l'environnement de travail. Le Dr Dobešová Cakirpaloglu est une chercheuse et experte dont les travaux contribuent de manière significative à l'amélioration de la qualité de vie et de la santé mentale des individus. Épidémiologie des maladies infectieuses et non infectieuses Ondrej Holý, Ph.D. , est assoc. professeur d'épidémiologie à la Faculté des sciences de la santé, Université Palacký d'Olomouc. Il est auteur et co-auteur de plus de 40 articles scientifiques, ainsi que de 5 manuels. Actuellement, il est vice-doyen à la gestion stratégique et à la qualité et il est également directeur du Centre des sciences et de la recherche. Son principal domaine d'expertise comprend l'épidémiologie des maladies infectieuses, les infections émergentes et réémergentes, la transmission des maladies infectieuses et sa prévention, ainsi que l'histoire des épidémies et des pandémies. Il est également connu pour avoir réfuté les fausses nouvelles en médecine dans le cadre du projet « Lovci šarlatanov (Chasseurs de charlatans) » ( https://www.lovcisarlatanov.sk/ ), principalement sur le COVID-19 et les canulars en matière de vaccination. Il a de l'expérience dans des universités et des groupes de recherche étrangers – Université de Kuopio/Université de Finlande orientale (Finlande) ; The Pathogen Research Group – School of Science and Technology, Nottingham Trent University, Nottingham (Royaume-Uni) ; Étude pilote européenne, multicentrique et prospective de prévalence des infections à Cronobacter sakazakii chez l'homme (EUCRONI) (Autriche) ; Épidémiologie et microbiologie moléculaire des pathogènes alimentaires - Universidad del Bio-Bio (Chili). Il est membre de différentes organisations professionnelles et scientifiques – Société tchécoslovaque de microbiologie ; Société d'épidémiologie et de microbiologie. Il est garant du doctorat. programme Protection et promotion de la santé à la Faculté des sciences de la santé, Université Palacký d'Olomouc. Il est membre du comité thématique du doctorat. programme - Épidémiologie, médecine préventive et hygiène à la Faculté de médecine et de médecine dentaire de l'Université Palacký d'Olomouc. Récemment, il a également rejoint le projet international et interdisciplinaire appelé Sinophone Borderlands, il est membre du nouveau groupe de recherche Civilization Crisis (budget de ce projet 6 millions d'euros, financé par le FEDER). Actuellement, Ondřej Holý est le co-superviseur d'un candidat retenu au MSCA travaillant à l'Université Palacký d'Olomouc et résolvant un projet intitulé « L'imaginaire viral : entre crise et routine ». Il est également membre du groupe de travail HR Award de l'Université Palacký d'Olomouc. La gestion des soins de santé Daniela Navrátilová, Ph.D. est consacré aux questions de gestion avec un accent sur la gestion stratégique. Dans sa profession, elle se concentre principalement sur le transfert de connaissances théoriques sur les outils de disciplines de gestion sélectionnées dans la pratique des organisations privées et publiques. Dans son travail scientifique, elle tente de trouver une réponse à la question de savoir dans quelle mesure les travailleurs occupant des postes de direction sont guidés uniquement par leur intuition et dans quelle mesure ils utilisent activement des outils de gestion spécifiques qui peuvent être appris. Outre la pratique académique, elle exerce comme conférencière et formatrice en compétences de gestion et de communication. Elle participe activement à la création, à la coordination et à la mise en œuvre de nombreux projets scientifiques ou en développement nationaux et internationaux.

Call for Marie Curie Postdoctoral Fellows

Join our team as a Marie Curie Postdoctoral Fellow!

Faculty of Health Sciences, Palacký University in Olomouc, invites young and talented researchers to express their interest in the Marie Skłodowska-Curie Postdoctoral Fellowship programme (MSCA PF), which provides funding for 12-24 months of research. The fellowship includes a salary, mobility allowance, family allowance (if applicable), and research expenses.

In addition to being eligible for MSCA, applicants who submit their proposal with Palacký University in Olomouc and pass the 85% threshold, but are not funded by MSCA due to the budget limit, have the opportunity to be funded by theERA Fellowships (a scheme only accessible to widening countries like Czech Republic). And those candidates who have passed the70% thresholdin the evaluation will qualify to have their projects funded through the MSCA-CZ grants of the Operational Programme Jan Amos Commenius of Ministry of Education, Youth and Sports of Czech Republic.

As the host institution, we offer candidates the opportunity to work with supervisors with extensive experience (more information about our fields and supervisors below). In addition to ensuring that candidates receive the best possible guidance and support, we are providing a 2-day training workshop, which takes place online at the end of April.

To be considered for the opportunity, candidates will undergo a pre-selection process based on their CV, project idea and motivation. There are three main eligibility requirements:

• Applicants must hold a PhD and have at most 8 years of full-time research experience by the time of the application.
• Applicants of any nationality are welcome, but they must not have lived or worked in Czech Republic for more than 12 months during the 3 years leading up to the closing date of the call on 11 September 2024 (mobility rule).
• Applicants must choose the Faculty of Health Sciences at Palacký University in Olomouc as their host institution.

To apply, candidates must complete the registration form and submit the following documents (PDF format) as attachments by 15 April 2024 (applications that do not follow these instructions will be discarded):

• One-page motivation statement that includes the background of the candidate, the project idea and how it intersects with the supervisor’s expertise (and Palacký University in Olomouc).
• CV (maximum 3 pages)

The selection process will be a collaborative effort between the supervisors and our research advisers. Selected candidates will be contacted by the middle of May and informed of the next steps in the process, which include joint preparation of an MSCA PF application with their supervisor.

For any other further questions, please contact Marika Svrčková (marika.svrckova@upol.cz).

Health Economics

Assoc. prof. Jarmila Zimmermannová, Ph.D. habilitated at the University of Economics in Prague in 2017 in the field of finance. From 2003 to 2009 she worked in various positions at the Ministry of the Environment of the Czech Republic, most recently as Deputy Director of the Department of Sustainable Energy and Transportation and Head of the Department of Environmental Tax Reform and Transportation. She represented the Ministry of the Environment of the Czech Republic in the OECD Working Group - Joint Meetings of Tax and Environment Experts. From 2011 to 2022, she worked in various positions at the Moravian Business College Olomouc, in particular as Rector, Vice-Rector for Science and Research and associate professor at the Department of Economics and the Department of Sustainable Development. Currently, she works at Palacky University, Faculty of Health Sciences, Centre for Science and Research. She is also Vice-Dean for International Relations and Internationalisation. In the field of bioeconomics, she is the leader of the Socio-Economic Section of the Platform for Bioeconomy (Czech Republic) and from March 2022 also a member of the Circular Bio-based Europe Joint Undertaking (CBE JU) Scientific Committee. Her main areas of expertise are public economics, public finance, and the impact of financial and economic policy instruments. She is the author of a number of scientific articles and a monograph. She has lectured internationally at universities in Hungary (Budapest Business School), Germany (Hochschule Nordhausen, Duale Hochschule Villingen Schwenningen, Ruhr Universität Bochum), Slovenia (University of Maribor), the Netherlands (Utrecht University), Israel (Kinneret Academic College), China (Dalian Minzu University) and Spain (University Rovira i Virgili, Tarragona).

Mental Health and Well-being

Simona Dobešová Cakirpaloglu, Ph.D. is a prominent scientist and expert whose academic background and professional interests are focused on the issues of psychosocial risks and mental health. She began her academic career by obtaining a Master's degree in psychology from the Department of Psychology at the Faculty of Arts of Palacký University in Olomouc in 2003 and in 2007, she earned her Ph.D. in clinical psychology from the same university. Currently, she holds the position of Deputy Head of the Institute of Social and Human Sciences at the Faculty of Health Sciences, Palacký University in Olomouc. Professionally, Dr. Dobešová Cakirpaloglu specializes in several key areas. One of them is occupational stress and burnout syndrome, where she strives to identify factors contributing to burnout and exhaustion among healthcare professionals and seeks ways to alleviate these issues. She also addresses workplace bullying and its impact on individuals' mental well-being, with her work aiding in the identification of strategies to address this problem and improve the work environment.  Dr. Dobešová Cakirpaloglu is a researcher and expert whose work significantly contributes to improving the quality of life and mental health of individuals.

Epidemiology of Infectious and Non-infectious Diseases

Ondřej Holý, Ph.D., is assoc. professor in epidemiology at the Faculty of Health Sciences, Palacký University Olomouc. He is author and co-author of more than 40 scientific papers, as well as 5 textbooks. Currently he is Vice-Dean for Strategic Management and Quality, and he is also the director of the Science and Research Centre. His main area of expertise includes epidemiology of infectious diseases, emerging and re-emerging infections, transmission of infectious diseases and its prevention, and history of epidemics and pandemics. He is also known for refuting fake news in medicine within the “Lovci šarlatanov (Quack Hunters)” project (https://www.lovcisarlatanov.sk/), mainly about COVID-19 and vaccinations hoaxes. He has experience from foreign universities and research groups – University of Kuopio/University of Eastern Finland (Finland); The Pathogen Research Group – School of Science and Technology, Nottingham Trent University, Nottingham (UK); European, multi-centre, prospective prevalence pilot-study of Cronobacter sakazakii infections in humans (EUCRONI) (Austria); Epidemiología y microbiología molecular de patógenos en alimentos - Universidad del Bio-Bio (Chile). He is a member of different professional and scientific organizations – Czechoslovak Society for Microbiology; Society for Epidemiology and Microbiology. He is guarantor of the Ph.D. program Health protection and promotion at the Faculty of Health Sciences, Palacký University Olomouc. He is a member of the Subject-Area Board for Ph.D. program - Epidemiology, Preventive Medicine and Hygiene at Faculty of Medicine and Dentistry, Palacký University Olomouc. Recently he also joined the international and interdisciplinary project called Sinophone Borderlands, he is a member of the new Civilisation Crisis research group (budget of this project 6 mil. Eur, funded by ERDF). Currently, Ondřej Holý is the co-supervisor of a successful MSCA candidate working at the Palacký University Olomouc and solving a project called "The Viral Imaginary: Between Crisis and Routine". He is also member of the HR award working group at the Palacký University Olomouc.

Healthcare Management

Daniela Navrátilová, Ph.D. is devoted to management issues with an emphasis on strategic management. In her profession, she focuses primarily on the transfer of theoretical knowledge about the tools of selected management disciplines into the practice of private and public organizations. In her scientific work, she tries to find an answer to the question, to what extent workers in managerial positions are guided only by their intuition and to what extent they actively use specific management tools that can be learned. Apart from academic practice, she works as a lecturer and trainer of management and communication skills. She actively participates in the creation, coordination and implementation of many national and international scientific or developing projects.

Les candidatures sont sollicitées pour deux associés de recherche postdoctoraux pour travailler avec le professeur Ziad Mallat au Centre de recherche cardiovasculaire de Paris (PARCC), Paris, France ( https://parcc.inserm.fr/ ).  Le titulaire du poste travaillera au sein d'un programme axé sur l'identification des mécanismes biologiques sous-jacents aux maladies cardiovasculaires athéroscléreuses, en mettant l'accent sur la contribution des cellules immunitaires résidentes. Le candidat retenu possédera un doctorat dans un sujet pertinent tel que les sciences biologiques, aura au moins deux ans d'expérience postdoctorale et aura une vaste expérience « pratique » de l'isolement et de la culture de cellules immunitaires primaires, de la préparation et de l'analyse d'échantillons. utilisant la cytométrie en flux et les techniques de génomique unicellulaire, ainsi que d'autres techniques de laboratoire standard, et possédant une excellente communication (écrite et verbale) et des compétences de travail en équipe. Une expérience dans des études précliniques in vivo et une expertise en analyse bioinformatique de données unicellulaires seraient fortement appréciées. Les candidats doivent avoir des antécédents en matière de réalisations en recherche, y compris des publications évaluées par des pairs. Une description complète du rôle est disponible dans le document Informations complémentaires, et le professeur Mallat peut être contacté via ziad.mallat@inserm.fr pour plus d'informations concernant ce rôle. Le financement de ces postes est disponible pour 3 ans, dans un premier temps.

Qu'est-ce que le Nexus doctoral ExposUM ?

Les Nexus Doctoraux proposés par l'Institut ExposUM sont des réseaux de 3 à 4 doctorants issus de disciplines différentes et affiliés à au moins deux unités de recherche différentes. Par rapport à un doctorat traditionnel, participer à un Doctoral Nexus favorisera la capacité à travailler en équipe et à concevoir des projets de manière transdisciplinaire tout en approfondissant son propre champ d'expertise. Un programme d'enseignement spécifique sera proposé et les doctorants concernés auront également la possibilité d'organiser un séminaire au sein du réseau Nexus. Les thèses sont financées dès l'origine pendant 4 ans, incluant le salaire du doctorant et une allocation environnementale.

Résumé de l'ensemble du projet

La dynamique épidémiologique et évolutive des maladies infectieuses est affectée par de nombreux facteurs environnementaux, écologiques et sociaux. Afin de comprendre et d’anticiper les conséquences d’une épidémie sur la santé publique et l’évolution de l’agent pathogène, il est nécessaire de modéliser précisément son environnement. Dans ce projet, nous envisageons d'étudier un aspect spécifique de cet environnement, qui est la structure par âge. Motivé par la prise de conscience, lors de la pandémie de COVID-19, que la structure par âge était un ingrédient de modélisation crucial pour faire des prévisions de santé publique (pic d'hospitalisation, vaccination), anticiper l'évolution virale (dynamique des variantes) ou comprendre la physiopathologie (cinétique intra-hôte). Le projet EMIPSA rassemble des biologistes, des mathématiciens, des statisticiens et des médecins qui proposent d'utiliser des modèles structurés par âge pour analyser la dynamique épidémiologique (évolution du nombre de cas) et évolutive (évolution des fréquences variantes) des pathogènes. Notre projet Nexus permettra des interactions entre 4 projets de thèse distincts sur (1) l'évolution des stratégies d'histoire de vie des pathogènes, en particulier des virus respiratoires, dans une population structurée par l'âge de l'infection et le statut vaccinal [écologie évolutive], (2) la justification mathématique rigoureuse de les modèles structurés utilisés en épidémiologie évolutive [mathématiques et modélisation], (3) la modélisation de la dynamique évolutive intra-hôte du paludisme, en tenant compte de la structure par âge des globules rouges [mathématiques et modélisation], et (4) l'anticipation de l'impact du épidémies sur le système de soins critiques français, en tenant compte de la dynamique de répartition des facteurs de risque, et plus particulièrement de l'âge [biologie et santé].

Projet de doctorat

Préparer le système de soins intensifs aux futures crises sanitaires

La pandémie de COVID-19 a mis en évidence la fragilité de notre système de santé, et notamment le risque de surcharge des unités de soins intensifs (USI)1. Les USI ont pu continuer à fonctionner uniquement grâce à la réorganisation de leur personnel et de leurs équipements, et notamment en supprimant les activités reportables (telles que les interventions chirurgicales électives)2. Compte tenu du vieillissement de la population, de la fréquence croissante des comorbidités et de leurs associations, et du risque d'émergence d'agents pathogènes amplifié par le changement global3, la pression sur les unités de soins intensifs devrait augmenter, à la fois de manière chronique et aiguë. Une contribution importante pour anticiper ces besoins, et orienter la stratégie hospitalière sur le long terme, consiste à modéliser l'activité d'un service de réanimation soumis à des régimes réguliers et de crise en vue de la population soignante française des prochaines décennies, en s'appuyant sur la activité de soins intensifs des dernières années décrites précédemment.

La première étape consistera à utiliser les données de la base de données PMSI (Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information) pour dresser un état des lieux national des activités de soins critiques existantes au cours des dix dernières années, y compris l'activité pré-pandémique, l'état de santé du COVID-19. crise et la dynamique post-pandémique, tout en analysant l’hétérogénéité interrégionale4. De plus, la fraction de la population générale susceptible d'être admise en soins intensifs sera déduite à l'aide de modèles de Markov cachés5. Dans un deuxième temps, les résultats de ces analyses seront croisés avec des projections démographiques6, des données épidémiologiques sur les comorbidités7 et des scénarios d'épidémies d'agents pathogènes émergents et réémergents, afin de produire une projection nationale des besoins en soins critiques sur les 30 prochaines années. ans8 . Enfin, dans une troisième phase, une USI virtuelle sera soumise par simulation à cette pression sanitaire, en activité régulière et de crise9,10, ce qui permettra d'identifier numériquement les faiblesses et les potentiels leviers organisationnels pour assurer la résilience future de l'État national. système de soins intensifs.

Mots-clés : Épidémiologie projetée ; prévisions démographiques; préparation à une pandémie ; optimisation hospitalière ; modélisation en soins intensifs.

Les références:

[1] Sofonéa et al. (2021) La mémoire est essentielle pour capturer la dynamique épidémiologique du COVID-19. Épidémies. [2] Lefrant et al. (2021) Capacité en lits de réanimation pendant la pandémie de COVID-19 en France : Des lits éphémères à une adaptation continue et permanente. Anaesth Crit Care Douleur Med. [3] Mora et coll. (2022) Plus de la moitié des maladies pathogènes humaines connues peuvent être aggravées par le changement climatique. » Nat Clim Change [4] Boulet et al. (2023) Activité des services de réanimation en france d'après la base de données nationale entre 2013 et 2019 : plus de patients gravement malades , séjour plus court et taux de mortalité inférieur. Anaesth Crit Care Pain Med. [5] Gimenez et al. (2012) Estimation des paramètres démographiques à l'aide de modèles dynamiques de processus cachés. Theor Popul Biol. [6] Algava & Blanpain (2021) 68,1 millions d'habitants en 2070 : une population un peu plus nombreuse qu'en 2021, mais plus âgée. Insee première. [7] Bagein et al. (2022) L'état de santé de la population en France. Les Dossiers de la DREES. [8] Sofonea & Alizon (2021) Anticiper la tension de capacité des unités de soins intensifs liées au COVID-19 : retour sur les projections épidémiologiques en France, Anaesth Crit Care Pain Med. [9] Lefrancq et al. (2021) Evolution des résultats pour les patients hospitalisés au cours des 9 premiers mois de la pandémie du SRAS-CoV-2 en France : une analyse rétrospective des données de surveillance nationale. The Lancet Regional Health-Europe. [10]Melman et coll. (2021) Équilibrer les ressources hospitalières rares pendant la pandémie de COVID-19 à l’aide de la simulation d’événements discrets. Gestion des soins de santé Sci.

Encadrement : Mircea T. Sofonea (Prof. Assoc. U. Montpellier & Nîmes Univ. Hosp., épidémiologie ; superviseur), Jean-Yves Lefrant (Prof. Titulaire & Praticien Hospitalier U. Montpellier & Nîmes Univ. Hosp., soins intensifs ; co-encadrant), Rémi Choquet (IR HDR CNRS, biostatistiques ; co-encadrant).

Laboratoire d'accueil : UMR PCCEI, U. Montpellier, Inserm U1058, EFS (60, rue de Navacelles – CS 34394 Montpellier Cedex 5)

Procédure de demande:

La demande doit inclure les éléments suivants

• un CV
• une lettre de motivation
• une copie du diplôme requis pour l'inscription
• toute information complémentaire spécifique demandée par l'école doctorale CBS2

Si vous souhaitez postuler à ce poste, merci d'envoyer un e-mail à Mircea T. Sofonea ( mircea.sofonea@umontpellier.fr ), Jean-Yves Lefrant ( jean.yves.lefrant@chu-nimes.fr ), Rémi Choquet ( remi.choquet@cefe.cnrs.fr ), en copie Sébastien Lion ( sebastien.lion@cefe.cnrs.fr ) et exposum-aap@umontpellier.fr pour les informer de votre intérêt.

Avant le dimanche 21 avril, 20h CET

Qu'est-ce que le dispositif ExposUM Doctoral Nexus ?

Les Doctoral Nexus proposés par l'Institut ExposUM sont des réseaux de 3 à 4 doctorantes et doctorants, issus de disciplines différentes et affiliés à au minimum deux unités de recherche différentes. Par rapport à une thèse classique, participer à un Doctoral Nexus favorisera la capacité à travailler en équipe et à concevoir des projets de manière transdisciplinaire tout en approfondissant son propre champ d'expertise. Un programme pédagogique spécifique sera proposé et les doctorants concernés(e)s auront également l'opportunité d'organiser un séminaire au sein du réseau Nexus. Les thèses sont financées d'emblée pour 4 années, comprenant le salaire du doctorant ou de la doctorante ainsi qu'une enveloppe d'environnement.

Résumé du Projet NEXUS

La dynamique épidémique et évolutive des maladies infectieuses est influencée par de nombreux facteurs environnementaux, écologiques et sociaux. Pour comprendre et anticiper les conséquences d'une épidémie sur la santé publique, ainsi que l'évolution du pathogène qui la cause, il est nécessaire de modéliser finement l'environnement du pathogène, qui est notamment caractérisé par la structure, à différents niveaux, de la population d'hôtes. Dans ce projet, nous proposons d'étudier comment cette structure, et plus particulièrement les structures en âge, affectent la dynamique épidémiologique des pathogènes et les pressions de sélection qui conduisent au remplacement d'une variante par une autre. Nous nous intéressons d'une partie à la structure en âge de la population d'hôtes proprement dite (avec des individus plus ou moins âgés et donc plus ou moins vulnérables à l'infection), et d'autre part, à la structure en âge d'infection, qui caractérise le fait que le temps depuis le moment de l'infection affecte la dynamique intra-hôte et la transmission inter-hôte. Une motivation de réalisation de ce projet tient dans la, pendant la pandémie de COVID-19, qu'il était essentiel de prendre en compte ces structures en âge, aussi bien pour des problématiques de santé publique (anticipation du pic d'hospitalisation, rappels vaccinaux ) que des questions d'évolution virale (dynamique de variantes) ou de physiopathologie (cinétique intra-hôte). Le projet EMIPSA regroupe un consortium de biologistes, mathématiciens, statisticiens et cliniciens qui propose d'utiliser des modèles structurés en âge pour analyser la dynamique épidémiologique (la variation du nombre de cas au cours du temps) et évolutive (le changement de fréquence des différents variantes) des pathogènes. Nous proposons un projet Nexus articulant 4 sujets de thèse individuels, portant (1) sur l'évolution des stratégies d'histoire de vie des pathogènes, en particulier les virus respiratoires, dans des populations structurées par l'âge d'infection et le statut vaccinal [écologie évolutive] (2) sur la justification rigoureuse des modèles mathématiques utilisés en épidémiologie évolutive, lorsque la population est structurée [mathématiques et modélisation], (3) sur la modélisation de la dynamique évolutive intra-hôte du paludisme en prenant en compte la structure en âge de la population de globules rouges [mathématiques et modélisation], et (4) sur l'anticipation de l'impact des épidémies sur le système de soins critiques en France, en prenant notamment en compte la dynamique de distribution des facteurs de risques, au premier rang duquel l'âge [biologie-santé].

Sujet de thèse : Dynamique évolutive des populations structurées dans un régime de mutations faibles : application à l'épidémiologie

Contexte

Afin de comprendre et gérer les épidémies, il est nécessaire de modéliser de manière conjointe la dynamique épidémiologique et évolutive des pathogènes. L'apport de la modélisation mathématique a été particulièrement clair pendant la pandémie de COVID-19. Toutefois, la prise en compte de la variabilité génétique des pathogènes pose des défis mathématiques, ce qui a donné lieu à au moins deux approches : (1) dans la littérature mathématique, une approche asymptotique développée durant les deux dernières décennies pour étudier des modèles intégro -différentiels venant de la biologie évolutive [1- 3], et (2) en biologie théorique, une approche dite « oligomorphique » développée plus récemment [4,5]. L'objectif de ce travail de thèse sera de faire un lien entre ces deux approches, et de justifier et améliorer les résultats obtenus par les biologistes travaillant sur l'épidémiologie évolutive des maladies infectieuses.

Objectifs et méthodes :

Nous nous intéressons à l'étude asymptotique d'une classe d'équations intégro-différentielles qui caractérisent les dynamiques des densités phénotypiques des populations structurées en classes, utilisées de manière pratique en biologie évolutive pour décrire l'interaction entre démographie (y compris épidémiologie) et évolution . (1) Dynamique à deux habitats. En pratique, l'étude d'un modèle épidémiologique introduit une complexité supplémentaire, et nous commençons par étudier le problème suivant, plus simple (cf.document attaché)

Ce système d'équations peut décrire la dynamique éco-évolutive dans une population composée de deux habitats. La fonction ni (t ,z), pour i=1,2, représente la densité d'individus avec le trait z au temps t, dans l'habitat i. Les densités ni (t ,z), changent au cours du temps sous l'effet de trois forces : (1) la mutation, avec les taux σ1 et σ2 ; (2) la migration entre les deux habitats, avec les taux ν1 et ν2 ; et (3) la reproduction locale et la mortalité, décrites via le taux de croissance R (z, ρ). Ce dépend du taux de manière décroissante de la taille totale de la population ρ prenant ainsi en compte la compétition entre les individus, par exemple pour une ressource. Nous nous intéressons à l'étude asymptotique de ce problème lorsque les taux de mutations sont faibles, c'est-à-dire σi=ε 2 si si , avec ε un petit paramètre. Un effet faible de mutations va entraîner une faible variance phénotypique à l'issue des événements de reproduction. Nous nous attendons à ce que dans ce régime de faible variance phénotypique, les densités phénotypiques ni (t ,z), se concentrent autour d'un ou plusieurs traits dominants qui évoluent lentement avec une vitesse d'ordre ε. Pour capturer la dynamique de ces traits dominants, il est alors nécessaire de faire un changement de variable en temps en introduisant les fonctions suivantes nε ,i ( t,z)=ni (t/ε,z) , , pour i=1, 2. Les nε,ivont alors se concentrer autour d'un ou deux traits dominants qui évoluent à une vitesse d'ordre 1. Notre objectif est de prouver ces propriétés, et de décrire la dynamique de ces traits dominants, ainsi que celle des variances phénotypiques autour de ces traits. Cette analyse pourra s'appuyer sur les résultats existants sur l'étude de la solution stationnaire de ce modèle [6-7]. (2) Application à l'épidémiologie. Biologiquement, il est possible d'étendre le scénario précédent pour modéliser l'épidémiologie évolutive d'un pathogène. Dans ce cas, les densités ni (t ,z) représentent les densités d'hôtes infectés par un pathogène avec le trait z, et on peut voir les habitats i comme des classes d'hôtes (représentant des classes d'âge, ou des (hôtes vaccinés ou non). Les taux de migration représentent eux les transitions entre classes (par vieillissement ou changement de statut vaccinal). Enfin, les taux de croissance Ri peuvent être modifiés pour dépendre de la densité d'hôtes non infectés dans chaque classe, Si(t), dont on peut expliciter la dynamique. Par rapport au modèle précédent, on a donc une compétition pour une ressource explicite. L'objectif sera d'étendre les résultats obtenus précédemment à ce modèle épidémiologiquement plus réaliste.

Prérequis :

On recherche pour ce sujet une personne ayant suivi une formation de la meilleure qualité en mathématiques, tant au niveau licence qu'au niveau master, avec des étapes de contact avec la recherche en mathématiques appliquées. Une bonne familiarité avec les équations paraboliques et de Hamilton-Jacobi, et les différentes approches pour leur étude (solutions de viscosité, méthodes variationnelles) sera un atout majeur, et une expérience en modélisation sera très appréciée.

Les références :

[1] Perthame et Barle. (2008) Concentrations de Dirac dans les PDE paraboliques de Lotka-Volterra, Indiana Univ. Mathématiques. J. [2] Lorz, Mirrahimi et Perthame. (2011) Dynamique de masse de Dirac dans les équations paraboliques non locales multidimensionnelles. Commun. Partiel. Différer. Éq.[3] Mirrahimi & Roquejoffre, (2016) Une classe d'équations de Hamilton-Jacobi avec contrainte : Unicité et approche constructive, J. Differ. Équ. [4] Lion, Boots & Sasaki (2022) Dynamiques éco-évolutives multimorphes dans des populations structurées, naturaliste américain. [5] Sasaki et. Dieckmann, (2011) Dynamique oligomorphique pour analyser la génétique quantitative de la spéciation adaptative, J. Math. Biol. [6] Mirrahimi (2017) Une approche Hamilton-Jacobi pour caractériser les équilibres évolutifs en environnements hétérogènes, Modèles et méthodes mathématiques en sciences appliquées, [7] Mirrahimi & Gandon (2020) Evolution de la spécialisation en environnements hétérogènes : équilibre entre sélection, mutation et migration, génétique.

Direction :

Sepideh Mirrahimi (CNRS, Institut Montpelliérain Alexander Grothendieck ; directrice), Jean-Michel Roquejoffre (Université Paul Sabatier, Institut de mathématiques de Toulouse ; co-directeur), Sébastien Lion (CNRS, Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive de Montpellier ; co- directeur).

Laboratoire d'accueil : Institut Montpelliérain Alexander Grothendieck ( https://imag.umontpellier.fr ).

Modalités de candidature

La candidature doit être composée des éléments suivants :

• Un CV
• Une lettre de motivation
• De la copie du diplôme permettant l'inscription
• Des éléments spécifiques demandés par l'école doctorale I2S ( https://adum.fr/as/ed/I2S/home.pl ).

Si vous souhaitez postuler sur ce sujet, adressez au plus vite un mail à Sepideh Mirrahimi ( sepideh.mirrahimi@umontpellier.fr ), Jean-Michel Roquejoffre ( jeanmichel.roquejoffre@math.univ-toulouse.fr ), en mettant en copie Sébastien Lion ( sebastien.lion@cefe.cnrs.fr ) et exposum-aap@umontpellier.fr afin de les informer de votre intérêt.

Qu'est-ce que le Nexus doctoral ExposUM ?

Les Nexus Doctoraux proposés par l'Institut ExposUM sont des réseaux de 3 à 4 doctorants issus de disciplines différentes et affiliés à au moins deux unités de recherche différentes. Par rapport à un doctorat traditionnel, participer à un Doctoral Nexus favorisera la capacité à travailler en équipe et à concevoir des projets de manière transdisciplinaire tout en approfondissant son propre champ d'expertise. Un programme d'enseignement spécifique sera proposé et les doctorants concernés auront également la possibilité d'organiser un séminaire au sein du réseau Nexus. Les thèses sont financées dès l'origine pendant 4 ans, incluant le salaire du doctorant et une allocation environnementale.

Résumé de l'ensemble du projet

La dynamique épidémiologique et évolutive des maladies infectieuses est affectée par de nombreux facteurs environnementaux, écologiques et sociaux. Afin de comprendre et d’anticiper les conséquences d’une épidémie sur la santé publique et l’évolution de l’agent pathogène, il est nécessaire de modéliser précisément son environnement. Dans ce projet, nous envisageons d'étudier un aspect spécifique de cet environnement, qui est la structure par âge. Motivé par la prise de conscience, lors de la pandémie de COVID-19, que la structure par âge était un ingrédient de modélisation crucial pour faire des prévisions de santé publique (pic d'hospitalisation, vaccination), anticiper l'évolution virale (dynamique des variantes) ou comprendre la physiopathologie (cinétique intra-hôte). Le projet EMIPSA rassemble des biologistes, des mathématiciens, des statisticiens et des médecins qui proposent d'utiliser des modèles structurés par âge pour analyser la dynamique épidémiologique (évolution du nombre de cas) et évolutive (évolution des fréquences variantes) des pathogènes. Notre projet Nexus permettra des interactions entre 4 projets de thèse distincts sur (1) l'évolution des stratégies d'histoire de vie des pathogènes, en particulier des virus respiratoires, dans une population structurée par l'âge de l'infection et le statut vaccinal [écologie évolutive], (2) la justification mathématique rigoureuse de les modèles structurés utilisés en épidémiologie évolutive [mathématiques et modélisation], (3) la modélisation de la dynamique évolutive intra-hôte du paludisme, en tenant compte de la structure par âge des globules rouges [mathématiques et modélisation], et (4) l'anticipation de l'impact du épidémies sur le système de soins critiques français, en tenant compte de la dynamique de répartition des facteurs de risque, et plus particulièrement de l'âge [santé publique]

Projet de doctorat

Evolution des stratégies d'histoire de vie des pathogènes : âge de l'infection, hétérogénéité et plasticité

Contexte : L'adaptation des pathogènes à leur environnement dépend de nombreux phénotypes qui s'expriment à différentes étapes du cycle de vie : infection d'un nouvel hôte, croissance intra-hôte du pathogène, production de propagules transmissibles. Ces différents phénotypes sont souvent résumés à l'aide d'un nombre réduit de caractères : virulence α, taux de transmission β, taux de récupération γ. Ces phénotypes peuvent évoluer en raison de pressions de sélection directes ou indirectesmodulées [1]. La succession de variants au cours de la pandémie de COVID-19 a démontré l’importance de comprendre et de prédire les facteurs qui régissent cette dynamique évolutive. Cependant, les modèles d'adaptation classiques supposent que les traits sont constants au cours de l'infection, ce qui implique que les durées d'infection sont distribuées de manière exponentielle et que la transmissibilité d'un hôte est indépendante du temps écoulé depuis le début de l'infection (c'est-à-dire l'âge de l'infection). Ces contraintes ne correspondent pas aux estimations empiriques des temps de génération des agents pathogènes [2]. Bien que certains modèles aient pris en compte la structure de l'infection [3], ils envisagent souvent des scénarios épidémiologiques simplifiés et ne peuvent pas décrire la dynamique évolutive transitoire dans une population d'hôtes hétérogène, où le nombre de contacts ou le statut immunitaire varie selon les hôtes. Il est donc important de développer un nouveau cadre théorique pour décrire l’adaptation des pathogènes dans des scénarios plus réalistes. Un tel cadre sera très utile pour comprendre l’évolution phénotypique du SRAS-CoV-2 et d’autres agents pathogènes.

Objectifs

Ce projet de thèse vise à modéliser l'évolution des stratégies d'exploitation des hôtes par les pathogènes lorsqu'elles peuvent être affectées par la distribution de l'infection en fonction de l'âge de la population hôte, de l'hétérogénéité de la population hôte et de la capacité des pathogènes à moduler leur stratégie en fonction de le temps écoulé depuis le début de l’infection (ce que l’on appelle les stratégies plastiques). Les modèles s'appuieront sur une description mécaniste de la croissance des pathogènes intra-hôtes, afin de caractériser les gradients de sélection sur les traits qui régissent la réplication des pathogènes. Cette analyse sera utilisée pour comprendre l'évolution à court et à long terme des traits d'histoire de vie des pathogènes (transmission, virulence…). Nous analyserons trois scénarios épidémiologiques.  Evolution dans une population hôte homogène. Nous analyserons l'évolution des phénotypes pathogènes lorsque les hôtes sont tous identiques, dans différents scénarios épidémiologiques (croissance exponentielle, équilibre endémique, fluctuations saisonnières).  Evolution dans une population hôte hétérogène. Nous prendrons alors en compte les variations de comportement ou de morbidité liées à l'âge. Par exemple, les personnes âgées ont souvent moins de contacts que les jeunes adultes, mais sont plus à risque, comme cela a été observé pour le SARSCoV-2. Comment cette hétérogénéité affecte-t-elle l’évolution des stratégies pathogènes ?  Adaptation des agents pathogènes à la vaccination : La vaccination introduit une autre forme d'hétérogénéité dans la population hôte. Les agents pathogènes peuvent s’adapter aux vaccins [4] grâce à des stratégies d’évasion immunitaire mais aussi à des stratégies d’exploitation spécifiques dépendantes de l’âge. Nous analyserons l’évolution conjointe de ces différentes stratégies. Méthodes : Le doctorant combinera (1) des modèles épidémiologiques compartimentaux prenant en compte le statut de l'hôte (infection, vaccination, âge), (2) des modèles structurés infection-âge (équations aux dérivées partielles), et (3) des modèles d'infection intra-hôte. croissance d’agents pathogènes lors d’infections aiguës. Résultats attendus : Le modèle sera utilisé pour quantifier l'avantage sélectif d'une variation phénotypique de traits exprimés à différents moments d'une infection et dans différents scénarios épidémiologiques. Cela nous permettra de caractériser l’adaptation des agents pathogènes à la fois transitoire et à long terme.

Faisabilité

Le cadre théorique pour analyser ces modèles existe, basé sur des modèles déjà développés par S. Lion et S. Gandon [5]. O. Ronce apportera son expertise unique sur l'évolution de l'histoire de vie dans les modèles démographiques structurés par âge [6]. Un défi de ce projet sera de prendre en compte conjointement la structure d’âge des infections et la dynamique épidémiologique. Parce que ce défi est partagé par les différents projets de thèse du projet Nexus, le doctorant bénéficiera grandement de l'expertise et des progrès de l'ensemble du consortium.

Mots clés : épidémiologie, virulence, évolution virale, structure par âge, vaccination, dynamique intra-hôte

Références :  [1] Day & Gandon (2007) Application de modèles génétiques de population à l'épidémiologie évolutive théorique. Ecologie Lett. {2] Blanquart et al (2022) Sélection des profils d'infectiosité dans les épidémies lentes et rapides, et montée en puissance des variants du SRAS-CoV-2. Élife. [3] Foutel-Rodier et al (2022) Des modèles épidémiques individuels aux PDE de McKendrick-von Foerster : un guide pour modéliser et déduire la dynamique du COVID-19. J. mathématiques. Biol. [4] Gandon & Day (2007) L'épidémiologie évolutive de la vaccination. JR Soc. Interface. [5] Gandon & Lion (2022) Vaccination ciblée et rapidité d’adaptation du SARSCoV-2. PNAS. [6] Cotto, Olivieri et Ronce (2013). Calendrier optimal du cycle vital dans une métapopulation avec dispersion des juvéniles. ‐ J. evol. Biol.

Encadrement : Sébastien Lion (DR CNRS, CEFE Montpellier ; conseiller), Sylvain Gandon (DR CNRS, CEFE, Montpellier ; co-directeur), Ophélie Ronce (DR CNRS, ISEM, Montpellier ; co-responsable).

Laboratoire d'accueil : Centre d'Écologie Fonctionnelle et Évolutive (CEFE), 1919, route de Mende, 34293 Montpellier Cedex 5. ( https://www.cefe.cnrs.fr )

Procédure de demande

La demande doit inclure les éléments suivants :

• un CV
• une lettre de motivation
• une copie du diplôme requis pour l'inscription
• toute information complémentaire spécifique demandée par l'école doctorale GAIA ( https://adum.fr/as/ed/gaia/index.pl ).

Si vous souhaitez postuler à ce poste, merci d'adresser un e-mail à Sébastien Lion ( sebastien.lion@cefe.cnrs.fr ), Sylvain Gandon ( sylvain.gandon@cefe.cnrs.fr ), et Ophélie Ronce ( ophelie .ronce@umontpellier.fr ), avec un CC à exposum-aap@umontpellier.fr pour les informer de votre intérêt.

Avant le dimanche 21 avril, 20h CET

Plus d’informations disponibles ici (au 11 mars 2024) :

https://www.umontpellier.fr/articles/appel-a-projet-doctoral-nexus-campagne-2024

Le post-doctorant contribuera au projet Citoyens (CITIZENS' Implication in public Decision, https://www.gate.cnrs.fr/Citizens/ financé par l'Agence Nationale de la Recherche. Face à la hausse du taux d'abstention depuis Au cours des dernières décennies, l'ambition de ce projet est d'étudier les déterminants microéconomiques de l'implication des citoyens dans la prise de décision publique. Notre projet vise à explorer l'impact causal de la décentralisation sur la participation électorale et à évaluer à l'aide de techniques économétriques comment les différentes formes de décentralisation et les différentes formes de gouvernance locale pourraient rapprocher les citoyens et les élus au niveau local.Plus précisément, le chercheur postdoctoral utilisera l'analyse économétrique (panel, quasi-expérimentation, simulations) sur des données publiques locales pour évaluer l'impact des compétences locales. , les méthodes de vote et les caractéristiques socio-économiques sur la participation électorale.Le chercheur postdoctoral participera à des activités telles que la collecte et la gestion de données, le développement de modèles théoriques et l'utilisation de techniques économétriques adéquates pour les analyser. Le chercheur postdoctoral travaillera au CREM de Rennes, sous la direction de Benoit Le Maux, Vincent Merlin et Sonia Paty, et collaborera avec les autres membres du projet CITIZENS. Le chercheur postdoctoral aidera à la gestion et à la collecte des données et rédigera des articles scientifiques. Il/Elle assistera aux ateliers et séminaires de recherche organisés au CREM Rennes, et contribuera à leur organisation. Il/Elle présentera ses travaux en séminaire ainsi que dans des conférences françaises et internationales. Il/Elle participera aux activités de diffusion du projet CITIZENS. Le CREM est la plus importante unité de recherche en économie publique de l'ouest de la France, avec un centième de chercheurs. Il est soutenu par le CNRS, l'Université de Rennes et l'Université de Caen Normandie. Il offre un environnement de recherche international de grande qualité (voir CREM - Centre de recherche en économie & management (univ-rennes.fr)).