Développeur sur une plateforme de traitement d’images médicales utilisant des ressources informatiques distribuées (cloud) Rennes , France

France
Publié il y a 2 mois

Type de contrat : Contrat à durée déterminée

Niveau de qualification requis : Diplôme d’études supérieures ou équivalent

Fonction : Ingénieur scientifique temporaire

Niveau d’expérience : De 3 à 5 ans

A propos du centre de recherche ou du département Inria

Le Centre Inria de l’Université de Rennes est l’un des neuf centres Inria et compte plus d’une trentaine d’équipes de recherche. Le Centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences du numérique. Elle est au cœur d’un riche écosystème de R&D et d’innovation : PME très innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l’enseignement supérieur, laboratoires d’excellence, institut de recherche technologique, etc.

Contexte

France Life Imaging (FLI) est un projet d’infrastructure de recherche à grande échelle visant à établir un réseau coordonné et harmonisé d’imagerie biomédicale en France. Ce projet a été sélectionné par l’appel « investissements d’Avenir » comme « Infrastructure en Biologie et Santé ». Son objectif est a) de coordonner les activités de recherche à l’échelle nationale liées à l’imagerie in vivo et de combiner les compétences pour repousser les barrières technologiques actuelles, et b) de fournir aux scientifiques un accès pratique à une gamme complète de technologies d’imagerie (150 systèmes d’imagerie) et intégrées. prestations de service.

Au sein de cette infrastructure, le Noeud « Analyse et gestion d’images » (IAM) est coordonné par Inria . L’objectif de ce nœud est de proposer une infrastructure pour stocker, gérer et traiter des données d’imagerie in vivo provenant de procédures humaines ou précliniques. Nous contribuons à une infrastructure d’archivage et de gestion d’images in vivo et fournissons des solutions pour traiter et gérer les données acquises via des solutions logicielles et matérielles dédiées. De plus, nous avons construit une solution polyvalente d’analyse d’images et de gestion de données pour l’imagerie in vivo qui permettra l’interopérabilité entre les sites de production distribués et les utilisateurs distribués, une solution de stockage hétérogène et distribuée mettant en œuvre l’indexation des données brutes et des métadonnées.

Dans ce contexte et au cours des dernières années, nous avons collecté et conservé différents types de données, en utilisant la base de données d’images basée sur le Web, appelée Shanoir , et différents types d’algorithmes de traitement, en utilisant la plateforme d’imagerie virtuelle .

La Plateforme d’Imagerie Virtuelle ( VIP ) est un portail web développé au CREATIS pour la simulation et le traitement de données massives en imagerie médicale. L’un des principaux objectifs de VIP est de fournir un accès transparent aux ressources informatiques distribuées pour les utilisateurs finaux. VIP a ainsi la capacité de gérer automatiquement des charges de travail importantes et complexes (générer, planifier et exécuter plusieurs tâches), sans nécessiter de compétences spécifiques de la part de ses utilisateurs. Ce sont les développeurs et administrateurs VIP qui sont chargés de rendre cela possible. L’instance VIP actuellement déployée chez CREATIS utilise principalement les ressources de stockage et de calcul fournies par l’ e-infrastructure EGI . Un nombre croissant de projets aux exigences diverses (parfois axées sur la sécurité) nécessitent un accès à des ressources de calcul et de stockage (par exemple, des clusters locaux, des cloud privés/publics) qui ne sont pas membres de la fédération EGI.

Dans ce contexte, le développeur recruté travaillera à l’extension et à l’adaptation de VIP pour l’utilisation de telles ressources informatiques et de stockage privées . Il/Elle sera sous la supervision du responsable de la plateforme VIP et interagira avec les autres ingénieurs VIP et l’équipe d’ingénierie FLI-IAM. Il/Elle sera hébergé au laboratoire CREATIS (Villeurbanne) .

Affectation

Les principaux objectifs du poste sont :

  • Analyse et conception des besoins
    • Compréhension de la mise en œuvre actuelle de VIP pour la gestion des tâches sur EGI
    • Analyse des besoins et solutions techniques pour l’intégration des nouvelles ressources informatiques disponibles
    • Choix de la solution à mettre en œuvre et cahier des charges
  • Développement et tests de logiciels
    • Implémentation de la ou des solutions choisies au sein de VIP et des dépendances associées
    • Mise en œuvre des tests associés
    • Intégration continue (CI)
  • Déploiement et configuration
    • Automatisation sur la procédure de déploiement et de configuration sur l’infrastructure ciblée (idéalement avec des scripts Ansible)

Compétences

  • Formation de haut niveau en informatique (doctorat ou grande école), spécialisée en informatique
  • Expérience en développement logiciel (Java, Python, Shell)  
  • Expérience avec IntelliJ ou d’autres IDE, git, GitHub/Gitlab
  • Expérience avec les systèmes d’exploitation Linux
  • Connaissances dans le domaine du cluster et/ou du Cloud computing (Slurm, OpenStack, Kubernetes)
  • La connaissance d’Ansible serait un plus
  • Rigueur, autonomie, curiosité technique, passion pour les nouvelles technologies
  • Bonne maîtrise de l’anglais technique et scientifique

Ensemble d’avantages sociaux

  • Repas subventionnés
  • Remboursement partiel des frais de transports en commun
  • Possibilité de télétravail (90 jours par an) et organisation flexible du temps de travail
  • Paiement partiel des frais d’assurance

Rémunération

Salaire mensuel brut à partir de 2 695 euros selon diplôme et expérience

Informations générales

Attention : vous devez renseigner votre adresse e-mail afin de sauvegarder votre candidature chez Inria. Les candidatures doivent être déposées en ligne sur le site Inria. Le traitement des candidatures envoyées depuis d’autres canaux n’est pas garanti.

Instruction pour postuler

Merci de soumettre en ligne : votre CV, votre lettre de motivation et éventuellement vos lettres de recommandation

Défense Sécurité :
Ce poste est susceptible d’être situé dans une zone réglementée (ZRR), telle que définie par le décret n° 2011-1425 relatif à la protection du potentiel scientifique et technique national (PPST). L’autorisation d’accéder à une zone est accordée par le directeur de l’unité, suite à une décision ministérielle favorable, telle que définie dans l’arrêté du 3 juillet 2012 relatif au PPST. Une décision ministérielle défavorable à un poste situé dans une ZRR entraînerait l’annulation de la nomination.

Politique de recrutement :
Dans le cadre de sa politique de diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.

Contacts

Les clés du succès

  • Une lettre de motivation détaillée
  • Un CV complet avec des expériences passées et une formation pertinente
  • Lettres de recommandation de personnes capables de soutenir la candidature

À propos d’Inria

Inria est l’institut national de recherche français dédié aux sciences et technologies du numérique. Elle emploie 2 600 personnes. Ses 200 équipes projets agiles, généralement conduites conjointement avec des partenaires académiques, regroupent plus de 3 500 scientifiques et ingénieurs œuvrant pour relever les défis du numérique, souvent à l’interface avec d’autres disciplines. L’Institut emploie également de nombreux talents dans plus de quarante métiers différents. 900 collaborateurs d’appui à la recherche contribuent à la préparation et au développement de projets scientifiques et entrepreneuriaux à portée mondiale.

Caractéristiques de l'emploi

Catégorie emploiDoctorat

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