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Nous recherchons un bioinformaticien talentueux ou un scientifique des données génomiques pour fournir un contrôle qualité des données génomiques et un assemblage à haut débit pour le projet de symbiose aquatique de la Fondation Moore.
Il existe des opportunités et des défis pour concevoir des solutions informatiques évolutives et robustes pour le suivi, le stockage et l’analyse des données. L’un des aspects les plus difficiles de ce rôle sera de produire des résultats scientifiques de haute qualité à grande échelle tout en s’adaptant aux développements rapides de la technologie et des logiciels de séquençage.
À propos de nous:
Le programme Tree of Life au Wellcome Sanger Instituteest dédié à la génération et à l’analyse de séquences génomiques de haute qualité provenant de toute la biodiversité eucaryote. L’équipe Tree of Life lance un nouveau projet de trois ans sur la génomique de la symbiose dans les systèmes aquatiques, financé par la Fondation Gordon et Betty Moore, où nous utiliserons des boîtes à outils de génomique avancées pour décrire et déchiffrer la biologie de milliers d’espèces qui vivre en association intime. Le projet collaborera à l’échelle internationale pour fournir des résultats de recherche passionnants et une meilleure compréhension de l’importance de la symbiose dans la génération de la diversité et le maintien de la fonction dans les écosystèmes aquatiques. Pour livrer ce nouveau projet, nous recrutons une équipe de biologistes moléculaires, de scientifiques en informatique et de soutien à la gestion de projet.
Au propos de vous:
Vous contribuerez au développement de méthodes et de logiciels pour le contrôle et l’assemblage des données génomiques. Les technologies de séquençage évoluent constamment en termes de type et de volume des données de séquence qu’elles produisent. Les progrès récents des technologies de séquençage à lecture longue nous permettent désormais de fournir efficacement des assemblages génomiques de haute qualité pour des espèces qui ne disposaient pas auparavant d’une telle ressource. Nous produirons des milliers d’assemblages génomiques pour les organismes symbiotiques et les analyserons pour comprendre leur biologie.
Vous aurez une expérience préalable de la bioinformatique du génome ou d’autres analyses de données scientifiques à grande échelle, ou un étudiant diplômé nouvellement qualifié avec des compétences en science des données intéressé par l’assemblage de données de séquence d’ ADN . Bien que souhaitable, une expérience antérieure avec les données de séquençage d’ ADN n’est pas strictement nécessaire pour le poste. Nous avons un solide dossier de publication et une culture de production de ressources de données ouvertes et de développement de logiciels open source. Ce rôle nécessite un état d’esprit d’investigation et de solution et d’excellentes compétences en communication pour travailler efficacement au sein de grands consortiums nationaux et internationaux.
Compétences essentielles
Compétences techniques:
- Diplôme dans une discipline scientifique liée à la bioinformatique, ou expérience équivalente
- Expérience antérieure en analyse informatique de données scientifiques, de préférence dans le domaine de l’assemblage du génome
- Connaissance approfondie de l’environnement informatique Unix
- Maîtrise d’un ou plusieurs langages de script, de préférence Python et Perl
- Connaissance des nouvelles données et technologies de séquençage
- Expérience avec un système de contrôle de version
Compétences et comportements:
- Excellentes compétences critiques et de résolution de problèmes
- Souci du détail et capacité de travailler pour respecter les délais
- Capacité à s’adapter rapidement à de nouveaux problèmes et idées
- Un haut niveau de compétences en communication pour être en mesure de susciter des exigences complexes et de transmettre des informations complexes à des groupes ayant différents niveaux de connaissances techniques
- Expérience de la gestion et de la motivation de personnel junior
Compétences idéales
Compétences techniques:
- Expérience de l’exécution de logiciels sur une batterie de serveurs, un cluster ou un environnement cloud
- Expérience antérieure de la gestion de gros volumes de données
- Expérience avec une programmation compilée et / ou un langage de balisage de flux de travail
- Expérience en développement Web
* Veuillez consulter les deux profils de rôle pour connaître les compétences et l’expérience requises pour les deux grades
Les autres informations
#HP
Alors que les développements autour du COVID -19 continuent d’évoluer, le Wellcome Genome Campus est fermé pour toutes les fonctions et installations, sauf les fonctions essentielles.
Les personnes restent au centre de tout ce que nous faisons et la majorité de notre personnel travaille désormais à distance pour assurer la continuité des opérations, en utilisant des outils de communication et de collaboration à distance.
Les entrevues auront lieu virtuellement et le candidat retenu devra s’attendre à être pleinement pris en charge grâce à l’intégration à distance et au travail à domicile jusqu’à la réouverture du campus à tout le personnel. Cette approche peut varier pour les personnes situées à l’étranger et / ou lorsqu’un visa est requis et que le départ sera basé sur un certain nombre de facteurs, nous serons en mesure de fournir des conseils spécialisés aux candidats concernés.
Processus de demande:
Veuillez postuler avec votre CV et une lettre de motivation décrivant 3 points qui, selon vous, remplissent les critères essentiels pour ce poste. Veuillez indiquer la note pour laquelle vous postulez.
Pour plus d’informations ou des questions sur ce poste, veuillez contacter Shane McCarthy ( sm15@sanger.ac.uk )
